Lihat sumber SARS-CoV-2

{{Current related||Pandemi COVID-19|date=Maret 2020}}
{{Tentang|jenis virus yang menyebabkan [[COVID-19]]|strain yang menyebabkan [[SARS]]|SARS-CoV-1|spesies yang memiliki kedua strain tersebut|Koronavirus terkait sindrom pernapasan akut yang berat}}
{{Infobox spesies
| color             = {{Tc2|virus}}
| image             = Novel Coronavirus SARS-CoV-2.jpg
| image_alt         = 
| image_caption     = Gambaran mikroskop transmisi elektron yang menunjukkan virion SARS-CoV-2
| image2            = 2019-nCoV-CDC-23312.png
| image2_caption    = Ilustrasi koronavirus yang dibuat oleh [[Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit]] (CDC).
| virus             = SARS-CoV-2
| synonyms          = 
* Koronavirus Wuhan
* Virus pneumonia pasar makanan laut Wuhan
| synonyms_ref      = 
| range_map         = {{Location map|China|float=center|caption=|lat_deg=30|lat_min=37|lat_sec=11|lat_dir=N|lon_deg=114|lon_min=15|lon_sec=26|lon_dir=E}}
| range_map_caption = Wuhan, Tiongkok, lokasi terjadinya wabah virus
| Death_toll        = 
* 1.018 per 10 Februari 2020 UTC+08.00
}}

{{Wikisource|Informasi Virus Korona Baru 2019 (CDC)}}

'''SARS-CoV-2''' atau '''Koronavirus sindrom pernapasan akut berat 2'''<ref name="Gorbalenya">{{Cite journal|last=Gorbalenya|first=Alexander E.|date=11 Februari 2020|title=Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus – The species and its viruses, a statement of the Coronavirus Study Group|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1|journal=bioRxiv|language=en|pages=2020.02.07.937862|doi=10.1101/2020.02.07.937862}}</ref><ref name="ictv">{{Cite web|url=https://talk.ictvonline.org/|title=ICTV|access-date=12 Februari 2020}}</ref> ({{lang-en|Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2}}) adalah salah satu anggota [[koronavirus]] yang mengakibatkan infeksi pernapasan [[COVID-19]]. Virus ini pertama kali diidentifikasi di Kota [[Wuhan]], [[Tiongkok]] dan menyebabkan [[wabah COVID-19]]. Virus ini juga dikenal sebagai '''koronavirus Wuhan''' dan '''virus pneumonia pasar makanan laut Wuhan''' (''Wuhan seafood market pneumonia virus'').<ref name="MN908947">{{cite journal |last1=Zhang |first1=Y.-Z. |display-authors=etal |title=Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947 |website=GenBank |accessdate=13 Januari 2020 |location=Bethesda MD |date=12 Januari 2020}}</ref>

[[Genom]] virus ini telah diurutkan.<ref>{{cite web|url=http://www.chinacdc.cn/dfdt/201912/t20191226_209404.html|title=中国疾病预防控制中心|website=chinacdc.cn|access-date=9 Januari 2020}}</ref><ref name=":0">{{cite web|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm|title=New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert|agency=Xinhua|access-date=9 Januari 2020|archive-date=2020-01-09|archive-url=https://web.archive.org/web/20200109084208/http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm|dead-url=yes}}</ref><ref name=":1">{{cite web|url=https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020|title=CoV2020|website=platform.gisaid.org|url-status=live|access-date=12 Januari 2020}}</ref> Perbandingan urutan genetik antara virus ini dan sampel virus lain menunjukkan tingkat kesamaan dengan [[SARS-CoV]] sebesar 79,5% dan dengan koronavirus kelelawar sebesar 96%.<ref name="sarscov">http://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v1.full.pdf</ref> Beberapa teori menyimpulkan bahwa virus ini berasal dari kelelawar.<ref name=nexstrain/><ref name=evoevidence/><ref>{{Cite journal|last=Callaway|first=Ewen|last2=Cyranoski|first2=David|date=2020-01-23|title=Why snakes probably aren’t spreading the new China virus|url=https://www.nature.com/articles/d41586-020-00180-8|journal=Nature|language=en|doi=10.1038/d41586-020-00180-8}}</ref>

== Penamaan ==
Selama wabah yang sedang berlangsung, virus ini sering disebut secara umum sebagai "koronavirus", "koronavirus baru" dan "koronavirus Wuhan",<ref name=BBCname>{{cite news|url=https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51371770|title=How the new coronavirus will finally get a proper name|last1=Taylor-Coleman|first1=Jasmine|publisher=BBC|date=5 Februari 2020|accessdate=12 Februari 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20200205190745/https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51371770|archive-date=5 Februari 2020|language=en|url-status=live}}</ref><ref name=Fortune>{{Cite web |url=https://fortune.com/2020/02/08/wuhan-coronavirus-disease-names/ |title=Wuhan coronavirus? 2019 nCoV? Naming a new disease |last=Stobbe |first=Mike|date=8 Februari 2020|website=Fortune|language=en-US |access-date=12 Februari 2020|url-status=live }}</ref> sedangkan WHO merekomendasikan penamaan sementara "2019-nCoV" di tengah kekhawatiran bahwa tidak adanya nama resmi dapat menyebabkan penggunaan nama-nama informal yang merugikan, per pedoman WHO tahun 2015,<ref name=Fortune/><ref>[https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/163636/WHO_HSE_FOS_15.1_eng.pdf World Health Organization Best Practices for the Naming of New Human Infectious Diseases]. Organisasi Kesehatan Dunia. Mei 2015.</ref>

Kelompok Studi Koronavirus dari [[Komite Internasional Taksonomi Virus]] (ICTV) memberi nama virus ini ''koronavirus sindrom pernapasan akut berat 2'' (SARS-CoV-2) yang merupakan galur dalam spesies [[SARS-CoV]].<ref name="ictv"/> Penyakit yang disebabkan oleh virus ini diberi nama "penyakit koronavirus 2019" (Covid-19) oleh WHO.<ref>{{Cite web|url=https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-remarks-at-the-media-briefing-on-2019-ncov-on-11-february-2020|title=WHO Director-General's remarks at the media briefing on 2019-nCoV on 11 February 2020|website=www.who.int|agency=Organisasi Kesehatan Dunia|language=en|access-date=11 Februari 2020}}</ref>

== Penyakit ==
=== Epidemiologi ===
{{Utama|Wabah COVID-19}}
Penyakit akibat infeksi SARS-CoV-2 pada manusia pertama kali terjadi pada akhir Desember 2019. Pendekatan [[jam molekuler]] menyatakan waktu infeksi yang serupa atau sedikit lebih awal.<ref name=early>{{cite web |last1=Cohen|first1=Jon |title=Wuhan seafood market may not be source of novel virus spreading globally |url=https://www.sciencemag.org/news/2020/01/wuhan-seafood-market-may-not-be-source-novel-virus-spreading-globally |website=Science {{!}} AAAS |language=en |date=26 Januari 2020}}</ref> Wabah penyakit pertama kali terdeteksi di Kota Wuhan, Provinsi [[Hubei]], Tiongkok pada pertengahan Desember 2019. Virus ini kemudian menyebar ke [[Thailand]] ([[Bangkok]]); [[Jepang]] ([[Tokyo]]); [[Korea Selatan]] ([[Seoul]]); provinsi lain di [[Tiongkok Daratan]]; [[Hong Kong]];<ref>{{cite news|url=https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3047310/china-coronavirus-hong-kong-widens-criteria|title=China coronavirus: Hong Kong widens criteria for suspected cases after second patient confirmed, as MTR cancels Wuhan train ticket sales|date=23 Januari 2020|newspaper=South China Morning Post|accessdate=23 Januari 2020}}</ref> [[Taiwan]] ([[Taoyuan]]); dan kemudian ke dunia internasional. Korban jiwa berjumlah 1.669 orang yang sebagian besar berada di Wuhan dan sekitarnya, dengan 69.268 kasus per 15 Februari 2020.<ref name=DXY>{{cite web|url=https://3g.dxy.cn/newh5/view/pneumonia|title=消息：香港首確診患者二次化驗陽性　轉送瑪嘉烈醫院|author=黃金棋陳倩婷李恩慈勞敏儀侯彩琳|publisher=DXY|accessdate=25 Januari 2020|language=zh|archive-date=2020-01-23|archive-url=https://web.archive.org/web/20200123232022/https://3g.dxy.cn/newh5/view/pneumonia|dead-url=yes}}</ref>

Pada 30 Januari 2020, wabah akibat SARS-CoV-2 ditetapkan sebagai darurat kesehatan global oleh [[Organisasi Kesehatan Dunia]] (WHO).<ref name="WHODeclaration">{{cite web |url=https://www.bbc.com/indonesia/dunia-51320187|title=Virus corona: Wabah terus menyebar ke sejumlah negara di luar China, WHO nyatakan 'darurat kesehatan global'|author=<!--Not stated--> |date=30 Januari 2020 |publisher=BBC Indonesia|access-date=31 Januari 2020}}</ref><ref>{{cite web |url=https://www.liputan6.com/health/read/4167997/resmi-who-nyatakan-wabah-virus-corona-darurat-kesehatan-global|title=Resmi, WHO Nyatakan Wabah Virus Corona Darurat Kesehatan Global|first=Giovani|last=Dio Prasasti|date=30 Januari 2020|publisher=Liputan6.com|access-date=31 Januari 2020}}</ref> WHO menciptakan istilah sementara "penyakit pernapasan akut 2019-nCoV" untuk menggambarkan penyakit yang disebabkan oleh virus tersebut.<ref>[https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200130-sitrep-10-ncov.pdf?sfvrsn=d0b2e480_2 Novel Coronavirus(2019-nCoV) Situation Report-10], 30 Januari 2020. ''Organisasi Kesehatan Dunia''. Diakses tanggal 31 Januari 2020</ref>

=== Penularan ===
Penularan dari manusia ke manusia dikonfirmasi di [[Guangdong|Provinsi Guangdong]], Tiongkok.<ref>{{Cite news|url=https://www.cbc.ca/news/health/coronavirus-human-to-human-1.5433187|title=China confirms human-to-human transmission of new coronavirus|date=20 Januari 2020|publisher=CBC News|access-date=21 Januari 2020|url-status=live}}</ref> Beberapa laporan menyatakan bahwa virus telah bersifat infeksius bahkan ketika dalam [[masa inkubasi]].<ref name=latent>{{cite news |title=【武漢肺炎】衛健委︰新型冠狀病毒傳播力增強　潛伏期最短僅1天 |url=https://news.mingpao.com/ins/%E5%85%A9%E5%B2%B8/article/20200126/s00004/1580028707559/%E3%80%90%E6%AD%A6%E6%BC%A2%E8%82%BA%E7%82%8E%E3%80%91%E8%A1%9B%E5%81%A5%E5%A7%94-%E6%96%B0%E5%9E%8B%E5%86%A0%E7%8B%80%E7%97%85%E6%AF%92%E5%82%B3%E6%92%AD%E5%8A%9B%E5%A2%9E%E5%BC%B7-%E6%BD%9B%E4%BC%8F%E6%9C%9F%E6%9C%80%E7%9F%AD%E5%83%851%E5%A4%A9 |work=明報新聞網|language=zh-CN}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://news.163.com/20/0126/16/F3R33UL80001899O.html|title=专家：病毒潜伏期有传染性 有人传染同事后才发病|date=26 Januari 2020|website=news.163.com|language=zh-CN}}</ref>

Para ilmuwan telah meneliti [[angka reproduksi dasar]] (''R''<sub>0</sub>) yang dimiliki virus ini. Dalam [[epidemiologi]], angka ini menunjukkan jumlah infeksi baru yang diakibatkan oleh setiap orang yang terinfeksi. Salah satu penelitian menyatakan bahwa setiap orang yang terinfeksi menyebarkan virus ke antara 3 hingga 5 orang.<ref>{{Cite journal|last=Zhao|first=Shi|last2=Ran|first2=Jinjun|last3=Musa|first3=Salihu Sabiu|last4=Yang|first4=Guangpu|last5=Lou|first5=Yijun|last6=Gao|first6=Daozhou|last7=Yang|first7=Lin|last8=He|first8=Daihai|date=2020-01-24|title=Preliminary estimation of the basic reproduction number of novel coronavirus (2019-nCoV) in China, from 2019 to 2020: A data-driven analysis in the early phase of the outbreak|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.23.916395v1|journal=bioRxiv|language=en|pages=2020.01.23.916395|doi=10.1101/2020.01.23.916395}}</ref> Penelitian lain memperkirakan ''R''<sub>0</sub> sebesar 1,4 hingga 3,8.<ref>{{Cite journal|last=Liu|first=Tao|last2=Hu|first2=Jianxiong|last3=Kang|first3=Min|last4=Lin|first4=Lifeng|last5=Zhong|first5=Haojie|last6=Xiao|first6=Jianpeng|last7=He|first7=Guanhao|last8=Song|first8=Tie|last9=Huang|first9=Qiong|last10=Rong|first10=Zuhua|last11=Deng|first11=Aiping|last12=Zeng|first12=Weilin|last13=Tan|first13=Xiaohua|last14=Zeng|first14=Siqing|last15=Zhu|first15=Zhihua|last16=Li|first16=Jiansen|last17=Wan|first17=Donghua|last18=Lu|first18=Jing|last19=Deng|first19=Huihong|last20=He|first20=Jianfeng|last21=Ma|first21=Wenjun|date=2020-01-25|title=Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.25.919787v1|journal=bioRxiv|language=en|pages=2020.01.25.919787|doi=10.1101/2020.01.25.919787}}</ref> Selain itu, virus ini diketahui mampu menular dalam rantai infeksi sebanyak empat orang.<ref name=Saey24Jan2020>{{Cite web|url=https://www.sciencenews.org/article/how-new-wuhan-coronavirus-stacks-up-against-sars-mers|title=How the new coronavirus stacks up against SARS and MERS|first=Tina Hesman|last=Saey|date=24 Januari 2020|access-date=25 Januari 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20200125064423/https://www.sciencenews.org/article/how-new-wuhan-coronavirus-stacks-up-against-sars-mers|archive-date=25 Januari 2020|url-status=live}}</ref>

=== Pengobatan ===
Saat ini belum ada pengobatan khusus untuk SARS-CoV-2 sehingga perawatan difokuskan pada pengurangan gejala.<ref name=thomreut_antivirals>{{Cite news|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-pneumonia-who-idUSKBN1ZD16J|title=WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide|date=14 Januari 2020|agency=Reuters|access-date=21 Januari 2020}}</ref> [[Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Tiongkok]] (CDC Tiongkok) sedang menguji prosedur perawatan pneumonia yang telah ada untuk diterapkan pada pneumonia akibat koronavirus.<ref name="auto1">{{Cite web|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/26/c_138734908.htm|title=China CDC developing novel coronavirus vaccine|date=26 Januari 2020|website=Xinhua|access-date=2020-01-28|archive-date=2020-01-26|archive-url=https://web.archive.org/web/20200126201658/http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/26/c_138734908.htm|dead-url=yes}}</ref>

Penggunaan [[obat antivirus]] yang ada sedang diteliti,<ref name=thomreut_antivirals/> termasuk [[protease inhibitor]] seperti [[indinavir]], [[saquinavir]], [[remdesivir]], [[lopinavir/ritonavir]] dan [[Interferon tipe I|interferon beta]].<ref name=Pau2020>{{cite journal |last1=Paules |first1=Catharine I. |last2=Marston |first2=Hilary D. |last3=Fauci |first3=Anthony S. |title=Coronavirus Infections—More Than Just the Common Cold |journal=JAMA |date=23 Januari 2020 |doi=10.1001/jama.2020.0757|pmid=31971553 }}</ref><ref>{{Cite news|url=https://www.reuters.com/article/gilead-coronavirus-idUSL4N29S45D|title=Gilead assessing Ebola drug as possible coronavirus treatment|date=23 Januari 2020 |work=Reuters|access-date=28 Januari 2020}}</ref> Efektivitas [[antibodi monoklonal]] yang telah diidentifikasi juga sedang diselidiki.<ref>{{Cite web|url=https://www.pharmaceutical-technology.com/news/coronavirus-vir-biotechnology-novavax-vaccine/|title=Coronavirus: Vir Biotechnology and Novavax announce vaccine plans-GB|access-date=28 Januari 2020}}</ref>

Pada 2 Februari 2020, Thailand melaporkan pengobatan yang berhasil untuk satu pasien. Dr. Kriengsak Attipornwanich dari [[Rumah Sakit Rajavithi]] di [[Bangkok]] mengatakan saat konferensi pers Kementerian Kesehatan Thailand, seorang perempuan Tiongkok berusia 71 tahun dari Wuhan dinyatakan negatif koronavirus 48 jam setelah dokter memberikan obat anti-HIV [[lopinavir/ritonavir|lopinavir dan ritonavi]] dalam kombinasi dengan obat [[influenza]] [[oseltamivir]].<ref>{{Cite news|url=https://www.medcom.id/internasional/asia/VNx4VwJN-dokter-thailand-klaim-temukan-penangkal-virus-korona|title=Dokter Thailand Klaim Temukan Penangkal Virus Korona|date=2 Februari 2020|access-date=4 Februari 2020|first=Fajar|last=Nugraha|website=Medcom.id}}</ref>

== Virologi ==
[[Berkas:Coronavirus replication.png|jmpl|kiri|[[Replikasi virus|Siklus penggandaan]] koronavirus.]]
=== Reservoir ===
Pada 22 Januari 2020, ''[[Journal of Medical Virology]]'' menerbitkan laporan analisis genom yang menjelaskan bahwa [[ular]] di wilayah Wuhan adalah "reservoir hewan liar yang paling mungkin" untuk virus ini, tetapi diperlukan lebih banyak penelitian.<ref name="BBC">{{Cite web|url=https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51217455|title=China coronavirus: Fear grips Wuhan as lockdown begins |date=23 Jan 2020|accessdate=21 Mei 2022|website=BBC|via=www.bbc.com}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://www.cnn.com/2020/01/22/health/snakes-wuhan-coronavirus-outbreak-conversation-partner/index.html|title=Snakes could be the source of the Wuhan coronavirus outbreak|first=Haitao Guo,Guangxiang "George" Luo,Shou-Jiang Gao,The|last=Conversation|date=23 Jan 2020|website=CNN|accessdate=21 Mei 2022}}</ref> [[Rekombinasi homolog]] mungkin menyebabkan peristiwa ini.<ref name="ji-wei-2020">{{cite journal |last1=Ji |first1=Wei |last2=Wang |first2=Wei |last3=Zhao |first3=Xiaofang |last4=Zai |first4=Junjie |last5=Li |first5=Xingguang |title=Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human |journal=Journal of Medical Virology |date=22 Januari 2020 |doi=10.1002/jmv.25682 |pmid=31967321 }}</ref><ref>{{cite news |author1=Haitao Guo |author2=Guangxiang "George" Luo |author3=Shou-Jiang Gao |title=Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China |url=https://theconversation.com/snakes-could-be-the-original-source-of-the-new-coronavirus-outbreak-in-china-130364 |accessdate=22 Januari 2020 |work=The Conversation |date=22 Januari 2020}}</ref> Beberapa ilmuwan percaya bahwa penyakit ini berasal dari ''[[Bungarus multicinctus]]'', ular yang sangat berbisa yang dijual di pasar Wuhan.<ref>{{Cite web|url=https://www.scimex.org/newsfeed/expert-reaction-could-new-coronavirus-have-come-from-snakes|title=EXPERT REACTION: Could new coronavirus have come from snakes?|last=SCIMEX|date= 23 Januari 2020 |website=Scimex |access-date=23 Januari 2020}}</ref> Berita di ''[[Nature (journal)|Nature]]'' mengkritik artikel ''Journal of Medical Virology'' dengan menyatakan bahwa ular sangat tidak mungkin menjadi reservoir, dan lebih cenderung pada [[mamalia]].<ref>{{cite journal|url=https://www.nature.com/articles/d41586-020-00180-8 |title=Why snakes probably aren't spreading the new China virus |authors=Ewen Callaway, David Cyranoski |journal=Nature |date=23 Januari 2020 |doi=10.1038/d41586-020-00180-8}}</ref> Banyak virolog juga sangat meragukan peranan ular sebagai inang perantara.<ref>{{Cite web|url=https://www.wired.com/story/wuhan-coronavirus-snake-flu-theory/|title=No, the Wuhan Virus Is Not a 'Snake Flu' |website=WIRED|first=Megan|last=Molteni|accessdate=21 Mei 2022|via=www.wired.com}}</ref>

Selama 17 tahun penelitian tentang asal-usul epidemi SARS 2003, banyak koronavirus kelelawar yang menyerupai SARS (''SARS-like'') diisolasi dan diurutkan, kebanyakan dari mereka berasal dari genus ''[[Rhinolophidae|Rhinolophus]]''. Dengan genom yang cukup, rekonstruksi [[pohon filogenetik]] untuk mengetahui sejarah mutasi koronavirus dapat dilakukan.

Koronavirus baru ini (SARS-CoV-2) berada dalam kategori koronavirus yang menyerupai SARS. Dua urutan genom dari ''[[Rhinolophus sinicus]]'' dengan kemiripan 80% telah dipublikasikan pada tahun 2015 dan 2017.<ref name=nexstrain>Sampel [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MG772933 CoVZC45] and [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MG772934 CoVZXC21], lihat [https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov visualisasi interaktif]</ref><ref name=evoevidence>{{cite journal|title=The 2019 new Coronavirus epidemic: evidence for virus evolution|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.24.915157v1|doi=10.1101/2020.01.24.915157v1|doi-broken-date=2020-01-25}}</ref> Sementara itu, artikel pracetak di jurnal [[bioRxiv]] yang ditulis oleh peneliti dari Institut Virologi Wuhan, [[Rumah Sakit Jinyintan Wuhan]], Universitas Akademi Sains Tiongkok, dan CDC Provinsi Hubei menyatakan bahwa koronavirus ini kemungkinan berasal dari [[kelelawar]], karena analisis mereka menunjukkan bahwa nCoV-2019 memiliki kemiripan 96% dengan koronavirus kelelawar yang diisolasi dari kelelawar ''[[Rhinolophus affinis]]''.<ref name="bioRxivBatOrigin">{{Cite journal|last=Zhou|first=Peng|last2=Yang|first2=Xing-Lou|last3=Wang|first3=Xian-Guang|last4=Hu|first4=Ben|last5=Zhang|first5=Lei|last6=Zhang|first6=Wei|last7=Si|first7=Hao-Rui|last8=Zhu|first8=Yan|last9=Li|first9=Bei|date=23 Januari 2020|year=|title=Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin|url=http://biorxiv.org/lookup/doi/10.1101/2020.01.22.914952|journal=BioRxiv|language=|volume=|issue=|pages=|doi=10.1101/2020.01.22.914952}}</ref> Sebagai perbandingan, jumlah mutasi ini mirip dengan jumlah mutasi yang diamati selama 10 tahun pada flu manusia H3N2.<ref>{{Cite web|url=https://nextstrain.org/flu/seasonal/h3n2/ha/2y?clade=3c3|title=Nextstrain H3N2|website=nextstrain.org|accessdate=21 Mei 2022}}</ref>

Hewan yang dijual sebagai makanan dicurigai sebagai reservoir atau perantara virus karena banyak dari individu yang terinfeksi pertama kali adalah pekerja di Pasar Makanan Laut Huanan. Akibatnya, mereka terpapar kontak yang lebih besar dengan hewan.<ref name="Hui14Jan2020" />

=== Filogenetik dan taksonomi ===
{{Infobox genome
| image       = File:SARS-CoV-2 genome.svg
| caption     = Susunan [[genom]] (klik untuk memperbesar)
| type        = nucleotide
| taxId       = MN908947
| size        = 29.903 [[pasangan basa]]
| year        = 2020
}}
Virus SARS-CoV-2 tergolong dalam genus ''[[Betacoronavirus]]'' (Beta-CoV) dalam keluarga [[Coronaviridae]]. Penyakit yang disebabkan Coronaviridae dapat berkisar dari [[pilek]] biasa hingga penyakit yang lebih parah seperti [[sindrom pernapasan Timur Tengah]] (MERS) dan [[sindrom pernapasan akut berat]] (SARS). Koronavirus adalah keluarga virus yang luas. Namun, hanya enam virus (229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, dan SARS-CoV) yang sebelumnya diketahui menginfeksi manusia; SARS-CoV-2 merupakan jenis ketujuh yang menginfeksi manusia.

Urutan genom betacoronavirus Wuhan menunjukkan kesamaan dengan betacoronavirus yang ditemukan pada kelelawar. Namun, virus ini secara genetik berbeda dari coronavirus lain seperti coronavirus terkait SARS dan MERS.<ref name=":1" /> Genus betacoronavirus terdiri atas empat garis keturunan (subgenus), SARS-CoV-2 bersama dengan SARS-CoV digolongkan dalam garis keturunan B (subgenus [[Betacoronavirus|Sarbecovirus]]).<ref name=Hui14Jan2020>Hui DS, I Azhar E, Madani TA, Ntoumi F, Kock R, Dar O, Ippolito G, Mchugh TD, Memish ZA, Drosten C, Zumla A, Petersen E. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health – The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. ''Int J Infect Dis''. 2020 Jan 14;91:264–266. {{pmid|31953166}} {{doi|10.1016/j.ijid.2020.01.009}} {{open access}}</ref><ref name="Wong2019">Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6409556/ Global Epidemiology of Bat Coronaviruses], in: Viruses. 2019 Feb; 11(2): 174, [[doi:10.3390/v11020174]]</ref><ref>{{cite web |title=Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses |url=https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov |website=nextstrain |accessdate=18 Januari 2020}}</ref>

Sejumlah genom koronavirus baru ini telah diisolasi dan dilaporkan termasuk BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019, BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019, dan BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019 dari CDC Tiongkok, Institut Biologi Patogen, dan Rumah Sakit Jinyintan Wuhan.<ref name=":1" /><ref>{{cite web|url=http://virological.org/t/initial-genome-release-of-novel-coronavirus/319|title=Initial genome release of novel coronavirus|date=11 Januari 2020|website=Virological|access-date=12 Januari 2020}}</ref><ref>{{Cite journal|date=17 Januari 2020|title=Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.3|publisher=ncbi.nlm.nih.gov}}</ref> Panjang urutan [[RNA]] yang dimilikinya sekitar 30 kbp.<ref name=":1" /> Model struktural komparatif dari protease koronavirus SARS-CoV-2 disediakan oleh Innophore GmbH, dengan beberapa percobaan obat melawan inhibitor protease virus telah dilakukan.<ref>{{cite web |last1=Gruber |first1=Christian |last2=Steinkellner |first2=Georg |title=Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level |url=https://innophore.com/2019-ncov/ |website=Innophore Enzyme Discovery |publisher=Innophore GmbH |date=23 Januari 2020}}</ref> Analisis filogenetik untuk sampel disediakan oleh Nextstrain.<ref>{{Cite web|url=https://nextstrain.org/ncov|title=Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID|last1=Bedford|first1=Trevor|last2=Neher|first2=Richard|date=|website=nextstrain.org|url-status=live|archive-url=|archive-date=|accessdate=26 Januari 2020}}</ref>

=== Struktur biologi ===
[[Berkas:Coronavirus 2019-nCoV.3.png|jmpl|ka|Diagram pita Innophore [[Phyre|Phyre2]] dari [[Protease]] SARS-CoV-2, target prospektif untuk [[obat antivirus]].<ref name=inno-dock />]]
Publikasi genom memberi jalan pada beberapa [[Prediksi struktur protein|pemodelan protein]] untuk protein pengikat [[reseptor (biokimia)|reseptor]] (RBD), yaitu protein ''spike'' (S). Protein S diketahui mempertahankan afinitas yang cukup terhadap reseptor [[enzim pengubah angiotensin]] 2 (ACE2) dan menggunakannya untuk masuk ke dalam sel.<ref>{{cite journal |title=Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission |url= http://engine.scichina.com/publisher/scp/journal/SCLS/doi/10.1007/s11427-020-1637-5 |journal=SCIENCE CHINA Life Sciences |doi=10.1007/s11427-020-1637-5 |doi-broken-date=24 Januari 2020 |accessdate=23 Januari 2020}}<!-- Broken DOI --></ref> Pada 22 Januari, dua kelompok yang berbeda (satu di Tiongkok yang bekerja dengan virus lengkap dan satu di AS yang bekerja dengan genetik balik) secara independen menunjukkan peranan ACE2 sebagai reseptor untuk SARS-CoV-2.<ref>{{cite journal |last1=Letko |first1=Michael |last2=Munster |first2=Vincent |date=22 Januari 2020 |title=Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV |url= https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.915660v1 |journal=BiorXiv |doi=10.1101/2020.01.22.915660 |accessdate=28 Januari 2020}}</ref><ref>{{cite journal |last1=Zhou |first1=Peng |last2=Shi |first2=Zheng-Li |date=2020 |title=Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin |url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v2 |journal=BiorXiv |doi=10.1101/2020.01.22.914952 |accessdate=24 Januari 2020}}</ref><ref>{{cite journal |last1=Gralinski |first1=Lisa E. |last2=Menachery |first2=Vineet D. |date=2020 |title=Return of the Coronavirus: 2019-nCoV |journal=Viruses |volume=12 |issue=2 |pages=135 |doi=10.3390/v12020135}}</ref>

Untuk mencari protease inhibitor yang potensial, enzim [[endopeptidase C30]] dari poliprotein [[rangka baca terbuka]] 1a (Orf1a) juga dimodelkan untuk percobaan [[docking (molekuler)|docking]] obat. Innophore telah menghasilkan dua model komputasi berdasarkan protease SARS,<ref name=inno-dock>{{cite web |url=https://innophore.com/2019-ncov/ |title=Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level |last1=Gruber |first1=Christian |last2=Steinkellner |first2=Georg |date=23 Januari 2020 |website=Innophore Enzyme Discovery |publisher=Innophore GmbH}}</ref> dan Akademi Ilmu Pengetahuan Tiongkok telah menghasilkan struktur eksperimental rekombinan protease SARS-CoV-2 yang belum dipublikasikan <ref name=cas-dock>{{cite web |title=上海药物所和上海科技大学联合发现一批可能对新型肺炎有治疗作用的老药和中药 |url=http://www.cas.cn/syky/202001/t20200125_4732909.shtml |website=Akademi Ilmu Pengetahuan Tiongkok |date=25 Januari 2020}}</ref>

== Pengembangan vaksin ==
Pada bulan Januari 2020, beberapa organisasi dan lembaga mulai bekerja untuk membuat vaksin untuk koronavirus Wuhan berdasarkan genom yang dipublikasikan.<ref name="ThomReut_NIH_Moderna_3months">{{Cite web|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-vaccines-idUSKBN1ZN2J8|title=With Wuhan virus genetic code in hand, scientists begin work on a vaccine|first1=Julie|last1=Steenhuysen|first2=Kate|last2=Kelland|date=25 Januari 2020|website=[[Thomson Reuters]]|accessdate=28 Januari 2020}}</ref><ref name="CBC_Saskatch_6_8_weeks_nonhuman" /> Di Tiongkok, CDC Tiongkok sedang mengembangkan vaksin untuk virus ''SARS-CoV-2''.<ref>{{Cite web|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/26/c_138734908.htm|title=China CDC developing novel coronavirus vaccine|date=26 Januari 2020|website=Xinhua|accessdate=26 Januari 2020|archive-date=2020-01-26|archive-url=https://web.archive.org/web/20200126201658/http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/26/c_138734908.htm|dead-url=yes}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://www.cnbcindonesia.com/news/20200127130748-8-133001/cdc-china-telah-mulai-kembangkan-vaksin-virus-korona|title=Chinese scientists race to develop vaccine as coronavirus death toll jumps|date=26 Januari 2020|website=CNBC Indonesia|accessdate=26 Januari 2020}}</ref>

Tiga proyek vaksin sedang didukung oleh [[Koalisi Inovasi Kesiapsiagaan Epidemi]] (CEPI), termasuk satu proyek perusahaan bioteknologi [[Moderna]] dan proyek lainnya oleh [[Universitas Queensland]] [[Australia]].<ref name="Guardian_CEPI_16weeks" /> [[Institut Kesehatan Nasional]] Amerika Serikat (NIH) bekerja sama dengan Moderna untuk membuat vaksin RNA yang cocok dengan protein permukaan (protein ''spike'') koronavirus, yang diharapkan untuk memulai produksi pada Mei 2020.<ref name="ThomReut_NIH_Moderna_3months" /> Di Australia, Universitas Queensland sedang menyelidiki potensi vaksin penjepit molekuler yang secara genetik akan memodifikasi protein virus untuk membuatnya meniru koronavirus dan merangsang reaksi kekebalan.<ref name="Guardian_CEPI_16weeks">{{Cite web|url=https://www.theguardian.com/science/2020/jan/24/lessons-from-sars-outbreak-help-in-race-for-coronavirus-vaccine|title=Lessons from Sars outbreak help in race for coronavirus vaccine|date=24 Januari 2020|work=The Guardian|language=en-GB|accessdate=28 Januari 2020}}</ref>

Dalam proyek independen, [[Agensi Kesehatan Masyarakat Kanada]] telah mengizinkan [[Organisasi Vaksin dan Penyakit Menular|Organisasi Vaksin dan Penyakit Menular-Pusat Vaksin Internasional]] (VIDO-InterVac) di [[Universitas Saskatchewan]] untuk mulai mengembangkan vaksin.<ref>{{Cite web|url=https://ca.news.yahoo.com/saskatchewan-lab-joins-global-effort-090415232.html|title=Saskatchewan lab joins global effort to develop coronavirus vaccine|website=ca.news.yahoo.com|date=26 Januari 2020|access-date=2020-01-28|archive-date=2020-01-26|archive-url=https://web.archive.org/web/20200126134853/https://ca.news.yahoo.com/saskatchewan-lab-joins-global-effort-090415232.html|dead-url=yes}}</ref> VIDO-InterVac menargetkan produksi vaksin dan pengujian terhadap hewan pada Maret 2020, dan pengujian terhadap manusia pada 2021.<ref name="CBC_Saskatch_6_8_weeks_nonhuman">{{Cite web|url=https://www.cbc.ca/news/canada/saskatchewan/vido-intervac-working-on-coronavirus-vaccine-1.5439118|title=Saskatchewan lab joins global effort to develop coronavirus vaccine|date=24 Januari 2020|work=Canadian Broadcasting Corporation|language=en|accessdate=26 Januari 2020}}</ref>

[[Imperial College London|Fakultas Kedokteran Imperial College]] di London memiliki dana untuk mengembangkan vaksin dan membawanya ke pengujian hewan, fase penelitian yang diharapkan akan selesai pada pertengahan Februari 2020.<ref>{{cite web|url=https://twitter.com/KayBurley/status/1221711134606155776|title="To get the vaccine into human studies would be about £1,500,000...to move it beyond that depends on how big the epidemic is." Imperial College's Prof Robin Shattock discusses the rush to develop a vaccine for coronavirus. JM #KayBurleypic.twitter.com/Pj1YABMufZ|last=Burley|first=Kay|date=27 Januari 2020|website=@KayBurley|access-date=4 Februari 2020}}</ref>

== Referensi ==
{{reflist}}

== Bacaan lebih lanjut ==
* {{cite report | vauthors = ((Organisasi Kesehatan Dunia)) | year = 2020 | title = Pengujian laboratorium terhadap kasus yang diduga manusia infeksi koronavirus baru (nCoV): pedoman sementara, 10 Januari 2020 | author-link = Organisasi Kesehatan Dunia | publisher = Organisasi Kesehatan Dunia | hdl = 10665/330374 | id = WHO/2019-nCoV/laboratory/2020.1 | hdl-access = free }}
* {{cite report | vauthors = ((Organisasi Kesehatan Dunia)) | year = 2020 | title = WHO R&D Blueprint: informal consultation on prioritization of candidate therapeutic agents for use in novel coronavirus 2019 infection, Geneva, Switzerland, 24 January 2020 | author-link = Organisasi Kesehatan Dunia | publisher = Organisasi Kesehatan Dunia | hdl = 10665/330680 | id = WHO/HEO/R&D Blueprint (nCoV)/2020.1 | hdl-access = free }}

== Pranala luar ==
{{Portal|Virus}}
{{Commons category}}
{{Wiktionary|Wuhan pneumonia}}
* [https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/index.html Centre for Disease Control (CDC)]
* {{cite web | title=MENGENAL NOVEL CORONAVIRUS (2019-nCoV) | website=Balai Besar Litbang Vektor dan Reservoir Penyakit [[Kementerian Kesehatan Republik Indonesia]] | url=http://www.b2p2vrp.litbang.kemkes.go.id/berita/baca/337/MENGENAL-NOVEL-CORONAVIRUS-2019-nCoV }}
* [https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019 Situs Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) seputar 2019-nCoV]
* {{cite web | title=Coronavirus | website=BMJ | url=https://www.bmj.com/coronavirus }}
* {{cite web | title=Novel Coronavirus Information Center | website=Elsevier | url=https://www.elsevier.com/connect/coronavirus-information-center }}
* {{cite web | title=2019-nCoV Resource Centre | website=Lancet | url=https://www.thelancet.com/coronavirus }}
* {{cite web | title=2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) | website=NEJM | url=https://www.nejm.org/coronavirus }}
* {{cite web | title=Coronavirus Research | website=Wiley | url=https://secure.wiley.com/Coronavirus2020 }}
*[https://dagacampuchia.com/cach-nuoi-ga-da-mau-map/ Cách nuôi gà đá mau mập]

=== Buka repositori akses pracetak ===
(Istilah pencarian yang disarankan: "2019-nCoV")
* {{cite web | title=bioRxiv | website=Server pracetak untuk biologi ([[bioRxiv]]) | url=https://www.biorxiv.org}}
* {{cite web | title=medRxiv | website=Server pracetak untuk ilmu kesehatan | url=https://www.medrxiv.org}}
* {{cite web | title=SSRN | website=Penyebaran penelitian yang cepat di seluruh dunia | url=https://www.ssrn.com/index.cfm/en}}

{{COVID-19}}
{{Taxonbar|from=Q82069695}}

[[Kategori:Spesies virus]]
[[Kategori:Pandemi Covid-19]]