[[Berkas:Panggung Krapyak.jpg|thumb|180px|Bagian dalam Panggung Krapyak]]
Panggung Krapyak berbentuk menyerupai kotak. Ukuran luasnya adalah 17,6 m x 15 m.<ref>{{ButuhCite rujukanweb|date=19 February 2019|title=Panggung Krapyak Yogyakarta|url=https://pariwisata.jogjakota.go.id/detail/index/336|website=Dinas Pariwisata Kota Yogyakarta|access-date=17 Mei 2024}}</ref> Ketinggian bangunannya adalah 10 m.<ref>{{Cite book|last=Erikha, F., dan Lauder, M. R. M. T.|date=Januari 2022|url=https://penerbit.brin.go.id/press/catalog/view/337/393/5923|title=Toponimi di Jantung Kota Yogyakarta dari Perspektif Kebahasaan hingga Psikologi Sosial|location=Jakarta|publisher=LIPI Press|isbn=978-602-496-289-0|pages=33|doi=10.55981/brin.337|url-status=live}}</ref> Arsitektur bangunannya cukup unik. Setiap sisi bangunan memiliki sebuah pintu dan dua buah jendela. Pintu dan jendela ditutup dengan pagar besi yang tidak rapat sehingga bagian dalam bisa terlihat dari luar. Bagian bawah pintu dan jendela berbentuk persegi tetapi bagian atasnya melengkung, seperti rancangan pintu dan jendela di masjid. Bangunan ini terdiri dari dua lantai. Pada lantai atas berupa ruangan terbuka yang cukup luas dan dibatasi pagar dengan ketinggian sedang.
Penduduk di sekitar Panggung Krapyak dan para peneliti berasumsi bahwa dahulu pada abad ke-18 Masehi, bangunan ini dikelilingi oleh pagar berupa tembok. Sisa-sisa struktur tembok tersebut berada di sisi selatan dan barat Panggung Krapyak. Sayangnya, struktur tersebut tidak dapat dilihat karena tertutup warung dan rumah warga. Selain struktur tembok, ditemukan juga sumur dan sisa-sisa kolam yang masih berasosiasi dengan bangunan Panggung Krapyak ini.
