Wikipedia

Siklus asam sitrat: Perbedaan antara revisi

Jelajahi riwayat secara interaktif
← Revisi sebelumnya
Konten dihapus Konten ditambahkan
VisualTeks wiki
ESCa (bicara | kontrib)
7.481 suntingan
Magog the Ogre (bicara | kontrib)
71 suntingan
id diagram
 
(49 revisi perantara oleh 21 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1:
[[Berkas:Citric_acid_cycle_with_aconitate_2Citric acid cycle with aconitate 2 id.svg|thumbjmpl|rightka|450px|Siklus asam sitrat]]
'''Siklus asam sitrat'''<ref>{{en}} {{cite book
| title = Molecular Biology of the Cell - How Cells Obtain Energy from Food
| author = Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter
| isbn = 0-8153-3218-1
| edition = 4
| year = 2002
| page =
| publisher = Garland Science
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A287#A307
| accessdate = 2010-07-11
}}</ref> ({{lang-en|citric acid cycle, tricarboxylic acid cycle, TCA cycle, Krebs cycle, Szent-Györgyi-Krebs cycle}}) adalah sederetan jenjang reaksi metabolisme [[pernafasanpernapasan]] selularseluler yang terpacu [[enzim]] yang terjadi setelah proses [[glikolisis]], dan bersama-sama merupakan pusat dari sekitar 500 reaksi metabolisme yang terjadi di dalam [[sel (tubuh)|sel]].<ref>{{en}} {{cite book
|title = Molecular Biology of the Cell - How Cells Obtain Energy from Food : Fig. 2-88. Glycolysis and the citric acid cycle are at the center of metabolism
|author = Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter
|isbn = 0-8153-3218-1
|edition = 4
|year = 2002
|page =
|publisher = Garland Science
|url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A287&rendertype=figure&id=A320
|accessdate = 2010-07-16
}}</ref> Lintasan [[katabolisme]] akan menuju pada lintasan ini dengan membawa [[molekul kecil]] untuk diiris guna menghasilkan [[energi]], sedangkan lintasan [[anabolisme]] merupakan lintasan yang bercabang keluar dari lintasan ini dengan penyediaan [[substrat]] [[senyawa organik|senyawa]] [[karbon]] untuk keperluan biosintesis.
 
[[Metabolom]] dan jenjang reaksi pada siklus ini merupakan hasil karya [[Albert Szent-Györgyi]] and [[Hans Krebs]].
Baris 16 ⟶ 26:
Pada sel eukariota, siklus asam sitrat terjadi pada [[mitokondria]], sedangkan pada [[organisme]] [[aerob]], siklus ini merupakan bagian dari lintasan [[metabolisme]] yang berperan dalam konversi kimiawi terhadap [[karbohidrat]], [[lemak]] dan [[protein]] - menjadi [[karbon dioksida]], [[air]], dalam rangka menghasilkan suatu bentuk [[energi]] yang dapat digunakan. Reaksi lain pada lintasan [[katabolisme]] yang sama, antara lain [[glikolisis]], [[oksidasi asam piruvat]] dan [[fosforilasi oksidatif]].
 
Produk dari siklus asam sitrat adalah prekursor bagi berbagai jenis [[senyawa organik]]. [[Asam sitrat]] merupakan prekursor dari [[kolesterol]] dan [[asam lemak]], termasuk[[asam ketoglutarat-alfa]] merupakan prekursor dari [[asam glutamat]], [[purina]] dan beberapa [[asam amino]], [[suksinil-KoA]] merupakan prekursor dari [[heme]] dan [[klorofil]], [[asam oksaloasetat]] merupakan prekursor dari [[asam aspartat]], [[purina]], [[pirimidina]] dan beberapa asam amino.<ref>{{en}} {{cite book
|title = Molecular Biology of the Cell - Fig. 2-87. Glycolysis and the citric acid cycle provide the precursors needed to synthesize many important biological molecules.
|author = Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter
|isbn = 0-8153-3218-1
|edition = 4
|year = 2002
|page =
|publisher = Garland Science
|url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A287&rendertype=figure&id=A318
|accessdate = 2010-07-16
}}</ref>
 
== Sekilas proses ==
* Siklus asam sitrat dimulai dengan satu [[molekul]] [[asetil-KoA]] yangbereaksi dengan satu molekul H<sub>2</sub>O, mengirimkanmelepaskan [[gugus fungsional|gugus]] [[asetilkoenzim-A]], yangdan mempunyaimendonorkan dua [[atom]] [[karbon]], keyang tersisa dalam bentuk gugus [[senyawa organik|senyawaasetil]] kepada [[asam oksaloasetat]] yang memiliki [[molekul]] dengan empat atom karbon, danhingga membentukmenghasilkan [[asam sitrat]] dengan enam atom karbon.<ref>{{en}} {{cite book
| title = Molecular Biology of the Cell - Simple overview of the citric acid cycle
| author = Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter
| isbn = 0-8153-3218-1
| edition = 4
| year = 2002
| page =
| publisher = Garland Science
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A287&rendertype=figure&id=A305
| accessdate = 2010-07-11
}}</ref><ref>{{en}} {{cite book
|title = Molecular Biology of the Cell - Panel 2-9 The Complete Citric Acid Cycle
|author = Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter
|isbn = 0-8153-3218-1
|edition = 4
|year = 2002
|page =
|publisher = Garland Science
|url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A287&rendertype=box&id=A307
|accessdate = 2010-07-14
}}</ref>
* Asam sitrat kemudian mengalami sederet transformasi kimiawi, mengakibatkan dua gugus [[karboksil]] terlepas dari domain oksaloasetat, sebagai CO<sub>2</sub>.
<!--
* The citrate then goes through a series of chemical transformations, losing two [[carboxyl]] groups as CO<sub>2</sub>. The carbons lost as CO<sub>2</sub> originate from what was oxaloacetate, not directly from acetyl-CoA. The carbons donated by acetyl-CoA become part of the oxaloacetate carbon backbone after the first turn of the citric acid cycle. Loss of the acetyl-CoA-donated carbons as CO<sub>2</sub> requires several turns of the citric acid cycle. However, because of the role of the citric acid cycle in anabolism, they may not be lost since many TCA cycle intermediates are also used as precursors for the biosynthesis of other molecules.<ref>Wolfe RR, Jahoor F. (1990) [http://www.ajcn.org/cgi/reprint/51/2/248.pdf Recovery of labeled CO<sub>2</sub> during the infusion of C-1- vs C-2-labeled acetate: implications for tracer studies of substrate oxidation.] ''Am J Clin Nutr.'' '''51(2)''':248-52. PMID 2106256 </ref>
* At the end of each cycle, the four-carbon oxaloacetate has been regenerated, and the cycle continues.
-->
* Energi yang dihasilkan dari reaksi oksidasi dikirimkan dalam bentuk [[elektron]] menuju [[Nikotinamida adenina dinukleotida|NAD<sup>+</sup>]], membentuk NADH. Untuk setiap gugus asetil, akan terjadi tiga molekul NADH.
* Elektron juga dikirimkan ke penerima [[flavin adenina dinukleotida|FAD<sup>2+</sup>]], membentuk FADH<sub>2</sub>.
 
{| class="wikitable"
Baris 47 ⟶ 70:
|-
|1
|[[Asam oksaloasetat|Oksaloasetat]] +<br />+ [[Asetil-KoA]]
|[[Asam sitrat|Sitrat]] +<br />+ [[Koenzim A|CoA-SH]]<br />+ H<sup>+</sup>
|[[Sitrat sintase]]
|[[Kondensasi aldolHidrolisis]]
|Setelah [[enzim]] sitrat sintase melepaskan satu ion H<sup>+</sup> dari molekul CH<sub>3</sub> gugus asetil dari asetil-KoA, molekul CH<sub>2</sub><sup>-</sup> pada gugus asetil tersebut akan bereaksi dengan asam oksaloasetat membentuk [[metabolit]] [[S-sitril-KoA]]. Reaksi [[hidrolisis]] yang terjadi selanjutnya pada gugus [[koenzim-A]] akan mendorong reaksi hingga menghasilkan tiga jenis produk.
|rate limiting stage (irreversible), <br />extends the 4C oxaloacetate to a 6C molecule
|-
|2
|[[Asam sitrat]]
|''[[Cis–transIsomerisme isomerismcis-trans|cis]]''-[[AconiticAsam acidasonitat|AconitateAsonitat]] +<br />+ H<sub>2</sub>O
|rowspan=2|[[Asonitase]]
| [[Reaksi dehidrasi|Dehidrasi]]
| rowspan="2" |Reaksi [[isomerisasi]] terjadi dengan dua tahap, enzim asonitase akan melepaskan gugus air dari asam sitrat membentuk metabolit [[Asam asonitat|cis-Asonitat]], kemudian terjadi penambahan kembali molekul air dengan pergeseran lokasi gugus [[hidroksil]] dan menghasilkan [[isomer]] [[asam sitrat]].
|rowspan=2|reversible isomerisation
|-
|3
|[[Asam asonitat|''cis''-Asonitat]] +<br />+ H<sub>2</sub>O
|[[Asam isositrat|Isositrat]]
|[[Reaksi hidrasi|Hidrasi]]
|-
|4
|[[Asam isositrat|Isositrat]] +<br />+ [[NicotinamidaNikotinamida adenina dinukleotida|NAD]]<sup>+</sup>
|[[Asam oksalosuksinat|OxalosuksinatOksalosuksinat]] +<br />+ [[NicotinamidaNikotinamida adenina dinukleotida|NADH + H <sup>+</sup>]]
|rowspan=2|[[Isositrat dehidrogenase]]
|[[Oksidasi]]
|rowspan=2|[[Enzim]] isositrat dehidrogenase bersama dengan [[koenzim]] NAD<sup>+</sup> akan mengubah gugus [[karboksil]] menjadi gugus [[karbonil]], membentuk [[asam organik|senyawa]] [[intermediat]] yang disebut [[asam oksalosuksinat|oksalosuksinat]]. Eksitasi oleh ion H<sup>+</sup> akan menyebabkan oksalosuksinat melepaskan gugus COO<sup>-</sup> yang tidak stabil dan membentuk senyawa [[karbondioksida|CO<sub>2</sub>]].
|generates [[NADH]] (equivalent of 2.5 ATP)
|-
|5
|[[Asam oksalosuksinat|Oksalosuksinat]]
|[[Asam ketoglutarat-alfa|Ketoglutarat-α]] +<br />+ CO<sub>2</sub>
|[[Dekarboksilasi]]
|irreversible stage, <br /> generates a 5C molecule
|-
|6
|[[Asam ketoglutarat-alfa|Ketoglutarat-α]] +<br />+ NAD<sup>+</sup> +<br />+ [[Koenzim A|CoA-SH]]
|[[Suksinil-KoA]] + <br />+ NADH + H<sup>+</sup> + <br />+ CO<sub>2</sub>
|[[Ketoglutarat-alfaKompleks dehidrogenase ketoglutarat-alfa|Ketoglutarat-α dehidrogenase]]
|Oksidatif<br />[[Dekarboksilasi]]
|Kompleks dehidrogenase ketoglutarat-alfa mirip [[kompleks piruvat dehidrogenase]] yang menjadi [[enzim]] pada transformasi [[asam piruvat]] menjadi [[asetil-KoA]]. Bersama dengan koenzim NAD<sup>+</sup> akan mempercepat oksidasi yang membentuk koenzim baru, disebut [[suksinil-KoA]], yang memiliki ikatan [[tio]][[ester]] antara [[koenzim-A]] dengan gugus [[suksinil]].
|irreversible stage, <br /> generates NADH (equivalent of 2.5 ATP), <br /> regenerates the 4C chain (CoA excluded)
|-
|7
|[[Suksinil-KoA]] + <br />+ [[Guanosina difosfat|GDP]] + [[Fosfat inorganik|P<sub>i</sub>]]<br />+ H<sub>2</sub>O
|[[Asam suksinat|Suksinat]] +<br />+ [[Koenzim-A|CoA-SH +]]<br />+ [[Guanosina trifosfat|GTP]]
|[[Suksinil koenzim-A sintetase|Suksinil-KoA sintetase]]
|[[fosforilasi]] [[substrat]]
|[[substrate-level phosphorylation]]
|Senyawa [[Fosfat inorganik|Pi]] akan menggantikan gugus [[CoA]] pada [[asam suksinat|suksinat]], kemudian didonorkan ke GDP untuk membentuk GTP. Pada [[bakteri]] dan [[tumbuhan]], gugus Pi akan didonorkan ke ADP guna menghasilkan ATP.
|or [[adenosina difosfat|ADP]]→[[adenosina trifosfat|ATP]] instead of GDP→GTP,<ref name=[[Stryer]]>{{cite book |last= Berg |first=JM |coauthors= JL Tymoczko, L Stryer |title= Biochemistry - 5th Edition |pages =476|publisher= WH Freeman and Company |year=2002 |isbn= 0-7167-4684-0}}</ref><br />generates 1 ATP or equivalent
|-
|8
|[[Asam suksinat|Suksinat]] + <br />[[ubiquinone]]+ (Q)FAD
|[[Asam fumarat|Fumarat]] + <br />ubiquinol+ (QHFADH<sub>2</sub>)
|[[Suksinat dehidrogenase]]
|[[Oksidasi]]
|[[Berkas:Complex II.svg|kiri|150px]]Koenzim FAD akan menarik dua atom hidrogen dari [[asam suksinat|suksinat]]. Reaksi ini tidak terjadi di dalam matriks mitokondria, tetapi terjadi pada antarmuka antara matriks mitokondria dan rantai transpor elektron yang disebut [[suksinat dehidrogenase]] yang melintang pada membran mitokondria bagian dalam, enzim ini sering juga disebut "kompleks II".
|uses [[FAD]] as a [[prosthetic group]] (FAD→FADH<sub>2</sub> in the first step of the reaction) in the enzyme,<ref name=[[Stryer]]>Berg ''et al.'' (2002), page 501</ref><br/>generates the equivalent of 1.5 ATP
|-
|9
|[[Asam Fumarat|Fumarat]] + <br />+ H<sub>2</sub>O
|''L''-[[Asam malat|Malat]]
|[[Fumarase]]
|[[Hidrasi]]
|H<sub>2</sub>O addition<br />(''hydration'')
|Reaksi penambahan molekul air pada [[asam fumarat|fumarat]] akan menjadi gugus [[hidroksil]] pada senyawa baru.
|
|-
|10
|[[Asam malat|''L''-Malat]] + <br />+ NAD<sup>+</sup>
|[[Asam oksaloasetat|Oksaloasetat]] + <br />+ NADH + H<sup>+</sup>
|[[Malat dehidrogenase]]
|[[Oksidasi]]
|Reaksi oksidasi yang terakhir akan mengubah gugus [[hidroksil]] menjadi [[karbonil]] dan menghasilkan senyawa pertama siklus sitrat, yaitu asam oksaloasetat.
|generates [[NADH]] (equivalent of 2.5 ATP)
|}
 
== Lihat pula ==
* [[Deaminasi|Deaminasi oksidatif]]
* [[Siklus sel]]
* [[Fosforilasi oksidatif]]
* [[Siklus Krebs terbalik]]
 
== RujukanReferensi ==
{{reflist}}
{{Biokimia-stub}}
 
[[Kategori:Metabolisme]]
 
[[en:Citric acid cycle]]
Diperoleh dari "https://wiki-indonesia.club/wiki/Siklus_asam_sitrat"