Transkonjugasi: Perbedaan antara revisi

'''Transkonjugasi''' adalah suatu proses transfer materi genetik secara [[horizontal]] yang terdiri dari [[konjugasi]] dan [[transposisi]].<ref name="v">{{en}} {{cite book|last= Jeffrey H. Miller|first=|authorlink=|coauthors=|title= Discovering Molecular Genetics|url= https://archive.org/details/discoveringmolec0000mill|year= 1996|publisher= CRC Press|location=|id= ISBN 978-087969475-3 }}</ref> Konjugasi merupakan proses transfer materi genetik (DNA) antarsel dengan memanfaatkan kontak antarsel berupa [[pilus]] yang akan menghubungan sel donor dan sel resipien.<ref name="qq"/> Adanya peristiwa [[konjugasi]] diselidiki pertama kali oleh [[Lederburg]] dan [[Tatum]] (1946) pada ''[[Escherichia coli]].<ref name="qq"/> Proses ini umunya hanya melibatkan dua tetua (''diparental mating'') yaitu sel donor dan sel resipien, namun juga dapat dilakukan oleh tiga tetua (''triparental mating'').<ref name="qq"/> Pada sistem dua tetua, biasanya plasmid yang ditransfer merupakan self-transmissible plasmid, salah satunya adalah F plasmid''.<ref name="qq">{{en}}Baron LS, Carey WF, Spilman WM. Characteristics of a high frequency of recombination (Hfr) strain of Salmonella typhosa compatible with Salmonella, Shigella, and Escherichia species. Proc Natl Acad Sci USA 45(12):1752–7.</ref> Sedangkan [[transposisi]] adalah perpindahan elemen loncat (transposon) ke [[kromosom]] suatu bakteri.<ref name="p"/> [[Transposon]] adalah [[sekuens DNA]] yang dapat berpindah-pindah secara acak, baik pada [[kromosom]] sel yang sama maupun antarkromosom.<ref name="p"/> [[Transposon]] dapat melompat ke [[genom]] karena adanya gen ''tnp'' penyandi [[transposase]] yang menyebabkan terjadinya perpindahan secara [[autonom]].<ref name="p"/> Penemuan adanya elemen lompat ini dilakukan pertama kali oleh [[Barbara McClintock]] (1930) melalui penelitiannya terhadap [[genetika]] warna [[jagung]].<ref name="p">{{en}} {{cite book|last= Jeffrey Pommerville|first=|authorlink=|coauthors=|title= Alcamo's Fundamentals of Microbiology|url= https://archive.org/details/alcamosfundament0000pomm_q5k8|year= 2010|publisher= Jones & Bartlett Publishers|location=|id= ISBN 978-0-7637-6258-2}}</ref>

Dalam proses transkonjugasi, sel yang memberikan materi genetiknya disebut sel [[donor]] sedangkan sel yang menerimanya disebut sel [[resipien]].<ref name="v"/> Transkonjugasi memerlukan terdapat tiga gen utama yang berperan, yaitu gen ''tra'', ''oriT'', dan ''tnp''.<ref name="dd"/> Gen asal transfer (''Origin of transfer'' atau ''oriT'') merupakan gen yang bersifat ''cis-acting''.<ref name="dd"/><ref name="dd"/><ref name="dd"/> Yang dimaksud dengan sifat ''cis-acting'' adalah sekuens DNA yang diperlukan untuk mengekspresikan/menjalankan gen tertentu. Elemen ini memiliki beberapa kriteria tertentu, di antaranya adalah terdiri dari sekuens konsensus pendek, bisa terletak pada [[promoter]] atau ''enhancer'', dan satu elemen tunggal cukup untuk [[regulasi]] respon gen.<ref name="dd"/> Sementara itu, gen ''tra'' yang bersifat ''trans-acting'', artinya adalah gen yang menyandikan/mengekspresikan [[protein regulator]] yang bertugas untuk mengatur ekspresi gen lain. Gen ''tra'' terdiri dari dua komponen yaitu ''DNA transfer and replication'' (Dtr) dan ''Mating pair formation'' (Mpf). Komponen Dtr terdiri dari enzim [[relaksase]], [[helikase]], dan [[primase]].<ref name="dd"/>. Sistem Mpf berfungsi untuk membentuk [[pilus]] sebagai jembatan transfer DNA antarsel [[bakteri]].<ref name="dd"/> Saat jembatan [[pilus]] terbentuk, enzim nuklease akan membuat retakan atau ''nick'' pada utas tunggal DNA yang akan ditransfer (berupa DNA plasmid) di titik ''oriT'' sehingga DNA tersebut menjadi utas tunggal.<ref name="dd">{{en}}Rees CED, Wilkins BM. 1987. Revised genetic map of the distal end of the f transfer operon: Implications for DNA Helicase I, nicking at oriT, and conjugal DNA transport. J Bacteriol 171(6):3251-9.</ref> Ujung utas tunggal 5‘ akan dibawa oleh relaksase ke dalam sel resipien, sementara itu enzim [[Helikase]] bekerja untuk menjaga utas tunggal DNA yang ditransfer supaya tidak membentuk utas ganda kembali.<ref>{{en}}Atmakuri K, Cascales E, Burton OT, Banta LM, Christie PJ. 2007. Agrobacterium ParA/MinD-like VirC1 spatially coordinates early conjugative DNA transfer reactions. EMBO J 26(10): 2540-51.</ref> Begitu sampai di dalam sel resipien, enzim [[primase]] akan memulai terjadinya ''rolling circle replication'' sehingga [[DNA]] [[plasmid]] yang sudah ditransfer menjadi utas ganda kembali.<ref name="dd"/> Di dalam DNA plasmid yang ditransfer, terdapat gen ''tnp'' yang merupakan gen penyandi [[transposase]] untuk memindahkan [[transposon]] ke [[kromosom]] sel lain.<ref name="p"/> Setelah transposon melompat, plasmid pembawanya dapat didegradasi oleh [[enzim]] [[nuklease]].<ref name="dd"/> Enzim nuklease adalah enzim yang berfungsi mendegradasi/merusak DNA dengan memotong-motong DNA. Pada bakteri, transposon biasanya membawa gen struktural penyandi [[resistensi antibiotik]] tertentu yang diapit oleh ujung berulang terbalik atau ''inverted repeat''.<ref name="p"/> Ujung berulang terbalik terdiri dari sekuens DNA pada ujung kanan dan kiri yang berulang namun susunannya terbalik.<ref name="p"/> Sekuens ''inverted repeat'' ini membuat [[transposase]] dapat mengenali bagian DNA yang akan dipindahkan ke [[kromosom]] sel.<ref name="p"/>

[[Kategori:Biologi molekuler]]