Varian Beta SARS-CoV-2: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
S Rifqi (bicara | kontrib)
pengembangan artikel
InternetArchiveBot (bicara | kontrib)
Rescuing 1 sources and tagging 0 as dead.) #IABot (v2.0.9.2
 
(16 revisi perantara oleh 15 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 11:
'''Varian Beta SARS-CoV-2''', juga dikenal sebagai '''garis keturunan B.1.351''' atau '''501.V2''', adalah [[varian (biologi)|varian]] dari [[Koronavirus sindrom pernapasan akut berat 2|SARS-CoV-2]], virus yang menyebabkan [[Penyakit koronavirus 2019|Covid-19]]. Varian ini termasuk [[Varian SARS-CoV-2|varian yang dianggap penting]]. Ia ditemukan pertama kali di Teluk Nelson Mandela,<ref>{{cite web |url=https://www.iol.co.za/news/south-africa/kwazulu-natal/sa-reaches-grim-milestone-of-1-million-covid-19-cases-a01906de-5442-451c-932f-84d6fc381b84 |title=SA reaches grim milestone of 1 million Covid-19 cases |date=28 Desember 2020 |publisher=www.iol.co.za |access-date=29 Desember 2020 |language=en}}</ref> [[Eastern Cape|Provinsi Eastern Cape]], [[Afrika Selatan]], pada Oktober 2020<ref>{{cite news |title=Covid: South Africa passes one million infections as cases surge |date=28 Desember 2020 |work=BBC News |url=https://www.bbc.com/news/world-africa-55462863 |access-date=29 Desember 2020 |language=en-GB}}</ref> dan dilaporkan oleh [[Departemen Kesehatan (Afrika Selatan)|departemen kesehatan]] negara tersebut pada 18 Desember 2020.<ref name="nytimes">{{cite web |url=https://www.nytimes.com/2020/12/19/world/south-africa-announces-a-new-coronavirus-variant.html |title=South Africa announces a new coronavirus variant |date=18 Desember 2020 |access-date=20 December 2020 |publisher=[[The New York Times]] |quote=N501Y...has been found in other countries, including Australia |language=en}}</ref> [[Filogeografi|Analisis filogeografi]] menunjukkan bahwa varian ini telah muncul di daerah Teluk Nelson Mandela sejak Juli atau Agustus 2020.<ref name="Tegally21">{{cite journal |last1=Tegally |first1=Houriiyah |display-authors=et.al |date=9 Maret 2021 |title=Detection of a SARS-CoV-2 variant of concern in South Africa |journal=Nature |volume=592 |pp=438–443 |doi=10.1038/s41586-021-03402-9 |doi-access=free |language=en}}</ref>
 
[[Organisasi Kesehatan Dunia]] (WHO) melabeli varian ini sebagai varian '''Beta''' bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik.<ref>{{cite web |url=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants |title=Tracking SARS-CoV-2 variants |website=www.who.int |access-date=30 Juni 2021 |language=en}}</ref> WHO menganggapnya sebagai varian yang butuhdiwaspadai perhatian(''variant of concern'').<ref>{{cite web |url=https://twitter.com/Kemdikbud_RI/status/1415658435287289856 |author=Kementerian Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi Republik Indonesia |date=15 Juli 2021 |title=#MerdekaBelajar di Twitter |website=Twitter |access-date=18 Juli 2021 |quote=Varian tersebut terbagi atas dua kategori, yakni varian yang diperhatikan (''variant of interest'' [VoI]) dan varian yang diwaspadai (''variant of concern'' [VoC]).}}</ref>
 
== Penemuan ==
Baris 86:
Varian ini terdiri dari 31 mutasi: 19 mutasi tak bersinonim, 2 mutasi hapus, dan 10 mutasi bersinonim,<ref name="Tegally21" /> yaitu 21 mutasi yang mengubah protein dan 10 mutasi yang tidak berdampak.<ref>{{cite book |last1=Rachmawati |first1=Faidah |last2=Urifah |first2=Nurul |last3=Wijayati |first3=Ari |year=2009 |title=Biologi untuk SMA/MA Kelas XII Program IPA |location=Jakarta |publisher=Pusat Perbukuan Departemen Pendidikan Nasional}}</ref>
 
Ilmuwan mencatat bahwa varian ini bisa lebih mudah menempel pada sel manusia karena tiga mutasi dalam domain pengikat reseptor (RBD) pada bulir virus, yaitu N501Y,<ref name="nytimes"/><ref name="caprisa">{{cite web |url=https://www.scribd.com/document/488618010/Full-Presentation-by-SSAK-18-Dec |last=Abdool Karim |first=Salim |date=19 Desember 2020 |title=The 2nd Covid-19 wave in South Africa: Transmissibility & a 501.V2 variant |page=11 |website=[[Scribd]] |publisher=[[CAPRISA]] |access-date=24 Desember 2020 |language=en}}</ref> K417N, dan [[E484K]].<ref>{{citation |title=Statement of the WHO Working Group on COVID-19 Animal Models (WHO-COM) about the UK and South African SARS-CoV-2 new variants |date=22 Desember 2020 |publisher=World Health Organization |url=https://www.who.int/docs/default-source/blue-print/who-com-statement_new-variant_rev1.pdf?sfvrsn=b87c0ad8_3&download=true |access-date=23 Desember 2020 |language=en}}</ref><ref>{{cite web |url=https://blogs.sciencemag.org/pipeline/archives/2020/12/22/the-new-mutations |last=Lowe |first=Derek |date=22 Desember 2020 |title=The New Mutations |website=In The Pipeline |publisher=American Association for the Advancement of Science |access-date=23 Desember 2020 |quote=I should note here that there’s another strain in South Africa that is bringing on similar concerns. This one has eight mutations in the Spike protein, with three of them (K417N, E484K and N501Y) that may have some functional role. |language=en |archive-date=2021-01-29 |archive-url=https://web.archive.org/web/20210129073128/https://blogs.sciencemag.org/pipeline/archives/2020/12/22/the-new-mutations |dead-url=yes }}</ref> Dua di antaranya, [[E484K]] dan N501Y, ada dalam motif pengikat reseptor (RBM) dari domain pengikat reseptor (RBD).<ref name="Tegally21" /><ref>{{cite web |url=https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-south-african-variant-of-sars-cov-2-as-mentioned-by-matt-hancock-at-the-downing-street-press-briefing/ |title=Expert reaction to South African variant of SARS-CoV-2 |publisher=Science Media Centre |access-date=26 Desember 2020 |language=en}}</ref> Mutasi N501Y juga ada dalam [[Varian Alpha SARS-CoV-2|varian Alpha]] dan [[Varian Gamma SARS-CoV-2|Gamma]].
 
== Efikasi vaksin ==
Perubahan asam amino [[E484K]], sebuah mutasi domain pengikat reseptor (RBD), dilaporkan berhubungan dengan kaburnya dari antibodi penetral yang bisa berdampak buruk terhadap efikasi vaksin Covid-19 yang bergantung pada protein bulir.<ref>{{cite news |title=New virus mutation raises vaccine questions |date=13 Januari 2021 |location=Paris |work=[[France 24]] |url=https://www.france24.com/en/live-news/20210113-new-virus-mutation-raises-vaccine-questions |access-date=13 Januari 2021 |language=en}}</ref><ref>{{cite news |last=Callaway |first=Ewen |date=7 Januari 2021 |title=Could new COVID variants undermine vaccines? Labs scramble to find out |work=Nature |url=https://www.nature.com/articles/d41586-021-00031-0 |access-date=17 Januari 2021 |quote=Chief among those is another receptor-binding-domain mutation, called E484K, that de Oliveira’s team has identified in the 501Y.V2 variant. |language=en}}</ref> Mutasi bulir E484K dikaitkan dengan kasus reinfeksi dengan varian Beta di Brazil yang diyakini para peneliti sebagai kasus reinfeksi pertama untuk varian ini.<ref name="ReutersBrazil">{{cite news |title=South African coronavirus variant detected in reinfection case in Brazil |date=8 Januari 2021 |work=Reuters |url=https://www.reuters.com/article/health-coronavirus-brazil-reinfection/south-african-coronavirus-variant-detected-in-reinfection-case-in-brazil-idUSKBN29D33S |access-date=11 Januari 2021 |language=en}}</ref> Peluang perubahan dalam antigenisitas disebut sebagai "mutasi kabur" dari antibodi monoklonal yang mampu menetralkan protein bulir varian SARS-CoV-2.<ref>{{cite journal |last1=Weisblum |first1=Yiska |display-authors=et.al |date=20 Oktober 2020 |title=Escape from neutralizing antibodies by SARS-CoV-2 spike protein variants |journal=eLife |volume=9 |pmc=7723407 |doi=10.7554/eLife.61312 |doi-access=free |language=en}}</ref><ref>{{cite press release |title=Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil |date=12 Januari 2021 |location=Jepang |publisher=NIID (National Institute of Infectious Diseases) |url=https://www.niid.go.jp/niid/images/epi/corona/covid19-33-en-210112.pdf |access-date=16 Januari 2021 |language=en}}</ref>
 
== Statistik ==
 
{| class="dapat diurutkan menurut wiki"
! colspan="3" | Kasus menurut negara (Diperbarui per 21 Juli 2021) GISAID<ref name="CovLineages1Jul" />
|-
! lingkup="kol" | Negara
! lingkup="kol" | Kasus terkonfirmasi
! lingkup="kol" | Tanggal Koleksi
|-
|Angola
|401
|22 April 2021
|-
|Argentina
| 1
|24 April 2021
|-
|Aruba
|4
|10 April 2021
|-
|Australia
|73
|28 Juni 2021
|-
|Austria
|260
|8 Juni 2021
|-
|Bahrain
| 1
|9 April 2021
|-
|Bangladesh
|56
|16 Juni 2021
|-
| Belgia
|1.075
|14 Juni 2021
|-
|Bosnia dan Herzegovina
| 1
|11 Februari 2021
|-
|Botswana
|342
|27 Juni 2021
|-
|Brasil
|6
|5 April 2021
|-
|Brunei
| 1
|20 Januari 2021
|-
|Bulgaria
|2
|9 Juni 2021
|-
|Kamboja
| 1
|31 Mei 2021
|-
|Kamerun
|9
| 1 Maret 2021
|-
|Kanada
|860
|21 Juni 2021
|-
|Cile
|4
|22 Mei 2021
|-
|Cina
|89
|4 Juni 2021
|-
|Kolombia
| 1
|13 April 2021
|-
|Kosta Rika
|12
|4 Mei 2021
|-
|Pantai Gading
|1
|6 Maret 2021
|-
|Kroasia
|41
|
|-
|Republik Ceko
|71
|10 Juni 2021
|-
|Republik Demokratik Kongo
|30
|20 April 2021
|-
|Denmark
|121
|29 Juni 2021
|-
|Djibouti
|22
|9 April 2021
|-
|Guinea Khatulistiwa
|43
|1 April 2021
|-
|Estonia
|37
|23 April 2021
|-
|Eswatini
|26
|23 Maret 2021
|-
|Finlandia
|1,123
|21 Mei 2021
|-
|Prancis
|2.149
|23 Juni 2021
|-
|Guyana Prancis
|2
|7 April 2021
|-
|Gabon
|4
|21 Februari 2021
|-
|Georgia
| 1
|23 Mei 2021
|-
|Jerman
|2.231
|19 Juni 2021
|-
|Ghana
|17
|8 April 2021
|-
|Yunani
|19
|29 April 2021
|-
|Guadeloupe
|4
|25 Mei 2021
|-
|Guam
|3
|28 April 2021
|-
|Guinea Bissau
|1
|1 Februari 2021
|-
|India
|208
|14 Juni 2021
|-
|Indonesia
|10
|2 Juni 2021
|-
|Iran
|2
|3 April 2021
|-
|Irak
| 1
|26 Februari 2021
|-
|Irlandia
|69
|19 April 2021
|-
|Israel
|240
|28 Mei 2021
|-
|Italia
|69
|1 Juni 2021
|-
|Jepang
|89
|13 Juni 2021
|-
|Yordania
|2
|18 April 2021
|-
|Kenya
|178
|31 Mei 2021
|-
|Kuwait
| 1
|21 Juni 2021
|-
|Latvia
|9
|13 Mei 2021
|-
|Lesotho
|14
|18 Januari 2021
|-
|Lituania
|11
|9 April 2021
|-
|Luksemburg
|744
|22 Mei 2021
|-
|Malawi
|312
|16 April 2021
|-
|Malaysia
|161
|10 Juni 2021
|-
|Malta
|3
|1 Juni 2021
|-
|Martinik
|2
|28 April 2021
|-
|Mauritius
|7
|12 Maret 2021
|-
|Mayotte
|32
|31 Januari 2021
|-
|Meksiko
|20
|16 Mei 2021
|-
|Mozambik
|328
|22 April 2021
|-
|Namibia
|9
|
|-
|Belanda
|693
|27 Mei 2021
|-
|Selandia Baru
|31
|25 Juni 2021
|-
|Makedonia Utara
|1
|10 Maret 2021
|-
|Norwegia
|362
|11 Juni 2021
|-
|Pakistan
|35
|5 Juni 2021
|-
|Panama
|2
|12 Januari 2021
|-
|Filipina
|1,213
|8 April 2021
|-
|Polandia
|45
|7 Juni 2021
|-
|Portugal
|99
|2 Juni 2021
|-
|Qatar
|650
|18 Mei 2021
|-
|Reuni
|400
|19 Juni 2021
|-
|Rumania
|7
|26 Mei 2021
|-
|Rusia
|23
|12 Juni 2021
|-
|Rwanda
|39
|15 Juni 2021
|-
|Arab Saudi
|3
|15 April 2021
|-
|Singapura
|100
|25 Juni 2021
|-
|Sint Maarten
|1
|24 Maret 2021
|-
|Slovakia
|31
|27 Mei 2021
|-
|Slovenia
|31
|6 April 2021
|-
|Somalia
|1
|
|-
|Afrika Selatan
|6.154
|21 Juni 2021
|-
|Korea Selatan
|19
|17 April 2021
|-
|Sudan Selatan
|3
|24 April 2021
|-
|Spanyol
|588
|18 Juni 2021
|-
|Sri Lanka
|4
|26 Maret 2021
|-
|Suriname
|5
|31 Maret 2021
|-
|Swedia
|2,322
|17 Juni 2021
|-
|Swiss
|225
|22 Juni 2021
|-
|Taiwan
|3
|26 April 2021
|-
|Thailand
|40
|25 Mei 2021
|-
|Togo
|2
|5 Februari 2021
|-
|Tunisia
| 1
|24 April 2021
|-
|Turki
|912
|24 Mei 2021
|-
|Uganda
|13
|2 April 2021
|-
|Uni Emirat Arab
|6
|27 April 2021
|-
|Britania Raya
|812
|24 Juni 2021
|-
|AS
|2.454
|28 Juni 2021
|-
|Zambia
|161
|28 April 2021
|-
|Zimbabwe
|331
|26 Februari 2021
|-
|Dunia (103 negara)
|Jumlah: '''28.380'''
|<small>Total per 21 Juli 2021</small>
|}
 
== Penyebaran ==
Baris 95 ⟶ 521:
Pada 23 Desember 2020, Menteri Kesehatan Britania Raya, [[Matt Hancock]], mengumumkan bahwa dua orang yang berkunjung dari Afrika Selatan ke Britania Raya terinfeksi dengan varian Beta (varian 501.V2).<ref name="hancock">{{cite web |url=https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-south-african-variant-of-sars-cov-2-as-mentioned-by-matt-hancock-at-the-downing-street-press-briefing/ |title=Expert reaction to South African variant of SARS-CoV-2, as mentioned by Matt Hancock at the Downing Street press briefing |date=23 Desember 2020 |publisher=Science Media Centre |access-date=24 Desember 2020 |quote=The South African variant ‘501.V2’ is characterised by N501Y, E484K and K417N mutations in the S protein – so it shares the N501Y mutation with the UK variant, but the other two mutations are not found in the UK variant. Similarly, the South African variant does not contain the 69-70del mutation that is found in the UK variant. |language=en}}</ref>
 
Pada 3 Mei 2021, varian ini telah masuk ke Indonesia.<ref>{{cite web |url=https://nasional.kompas.com/read/2021/05/04/06435261/varian-virus-corona-b117-b1617-dan-b1351-telah-masuk-ke-indonesia?page=all |last=Nugraheny |first=Dian Erika |editor-last=Prabowo |editor-first=Dani |date=4 Mei 2021 |title=Varian Virus Corona B.1.17, B.1.617, dan B.1.351 Telah Masuk ke Indonesia |publisher=Kompas.com |access-date=29 Juni 2021}}</ref> Per 20 Juni 2021, terdapat enam{{data kasus di Indonesia yang terkena varian Beta.<ref>{{citeSARS-CoV-2 web |url=https://twitter.com/KemenkesRI/status/1409032163064881161 |author=Kementerian Kesehatan Republikdi Indonesia |datevarian=27 Juni 2021 |title=Kemenkes RI di Twitter |website=Twitter |access-date=29 Juni 2021 |quote=Hingga 20 Juni, @litbangkemenkes tercatat telah melakukan pemeriksaan WGS terhadap 2.242 sequences. Hasilnya ditemukan 211 kasus yang terdiri dari 45 varian Alpha, 6 varian Beta dan 160 varian Delta.}}</ref>
 
== Lihat pula ==
Baris 114 ⟶ 540:
 
{{portal bar|Penyakit koronavirus 2019|Kedokteran|Virus}}
{{COVID-19|state=collapsed}}
{{varian SARS-CoV-2}}
{{authority control}}