Ralstonia eutropha: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Tidak ada ringkasan suntingan Tag: BP2014 |
k →Bioremediasi: clean up |
||
| (48 revisi perantara oleh 5 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 1:
{{Taxobox
| color = lightgrey
| image= Cupriavidus necator.jpg
| image_caption =
| regnum = [[Bacteria]]
| phylum = [[Proteobacteria]]
| ordo = [[Burkholderiales]]
| familia = [[Burkholderiaceae]]
| genus = ''[[Cupriavidus]]''
| species = '''''C. necator''''', (dahulu) ''R. eutropha''
| binomial = ''Cupriavidus necator'', (dahulu) ''Ralstonia eutropha''
| binomial_authority = Makkar and Casida, 1987
}}
'''''Ralstonia eutropha''''' (disingkat '''''R. eutropha'''''), yang kini dikenal sebagai '''''Cupriavidus necator''''', adalah sebuah [[bakteri]] [[Gram negatif]] yang tergolong dalam kelas ''[[beta-proteobacteria]]''.<ref name="B"/> Bakteri ini merupakan [[organisme model]] untuk mempelajari metabolisme [[polihidroksi alkanoat]].<ref name="F"/>
== Deskripsi dan Taksonomi ==
''R. eutropha'' termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama.<ref name="A"/> Pada awalnya ''R. eutropha'' disebut sebagai ''[[Alcaligenes eutrophus]]'', kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama ''Cupriavidus necator''.<ref name="A">{{en}} {{cite book
|last = Ramos JL, Levesque LC.
|first =
|authorlink =
|title = Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues
|publisher = Springer
|year = 2006
|id = ISBN 0-306-48378-5, 9780306483783}}
</ref>
''R. eutropha'' merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan [[flagella]] yang berbentuk [[peritrikus]].<ref name="B"/> ''R. eutropha'' mempunyai aktivitas [[katalase]] dan [[oksidase]].<ref name="B"/> Bakteri ini tahan terhadap berbagai [[ion]] [[logam]] dan mampu menggunakan beberapa [[asam amino]] sebagai sumber [[karbon]] dan [[nitrogen]] tunggal. Konten basa [[Guanin]] dan [[Sitosin]] pada bakteri dalam genus ''Cupriavidus'' adallah sekitar 63 sampai 69 [[mol]]%.<ref name="B"/> ''R. eutropha'' adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah.<ref name="B">{{en}} {{cite journal
| author = Vandamme P, Coenye T.
| year = 2004
| month = June
| title = Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found
| journal = International journal of systematic and evolutionary microbiology
| volume = 54
| issue = 6
| pages = 2285-2289
| doi =10.1099/ijs.0.63247-0
| id =
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15545472
| format =
| accessdate = 6 April 2014
}}
</ref>
== Kemampuan Metabolisme ==
''R. eutropha'' adalah termasuk bakteri [[litoautotrof]] yang mampu meng[[oksidasi]] gas [[hidrogen]].<ref name="C">{{en}} {{cite journal
| author = Pohlmann A, ''et al''.
| year = 2006
| month = April
| title = Genome sequence of the bioplastic-producing "Knallgas" bacterium Ralstonia eutropha H16
| journal = Nature biotechnology
| volume = 24
| issue = 10
| pages = 1257-1262
| doi =10.1038/nbt1244
| id =
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16964242
| format =
| accessdate = 6 April 2014
}}
</ref> Bakteri ini dapat hidup sebagai [[autotrof]] maupun [[heterotrof]].<ref name="C"/> Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun [[molekul organik]] dapat digunakan sebagai sumber [[energi]].<ref name="C"/> Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat [[karbon dioksida]] melalui [[jalur pentosa-fosfat]], dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui [[siklus Krebs]].<ref name="D">{{en}} {{cite journal
| author = Cramm R
| year = 2009
| month = Oktober
| title = Genomic view of energy metabolism in ''Ralstonia eutropha'' H16.
| journal = Journal of molecular microbiology and biotechnology
| volume = 16
| issue = 1-2
| pages = 38-52
| doi =10.1159/000142893
| id =
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18957861
| format =
| accessdate = 6 April 2014
}}
</ref> Terlebih lagi, ''R. eutropha'' memiliki kemampuan untuk memecah senyawa [[aromatik]], hal ini memberikan potensi kepada ''R. eutropha'' dalam aplikasi [[bioremediasi]].<ref name="E">{{en}} {{cite journal
| author = Lykidis A, ''et al''.
| year = 2010
| month = February
| title = The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader
| journal = PloS one
| volume = 5
| issue = 3
| pages = e9729
| doi =10.1371/journal.pone.0009729
| id =
| url =http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2842291&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
| format =
| accessdate = 6 April 2014
}}
</ref>
Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme ''R. eutropha'' secara mendalam, [[genom]] ''R. eutropha'' [[galur]] H16 telah diurutkan (di-''[[Sequence]]'') secara menyeluruh.<ref name="C"/> Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa.<ref name="C"/> Genom terdiri dari dua [[kromosom]] dan satu [[megaplasmid]].<ref name="C"/>
== Aplikasi ==
=== Produksi PHA ===
''R. eutropha'' diketahui mampu mengakumulasi polihidroksi alkanoat (PHA), senyawa [[hidrokarbon]] yang dapat dimanfaatkan sebagai [[bioplasik]].{{fact}} PHA dikumpulkan oleh ''R. eutropha'' di dalam sel ketika sumber [[karbon]] berlebih sementara sumber [[nitrogen]] atau [[fosfat]] terbatas.<ref name="F">{{en}} Brigham CJ, Zhila N, Shishatskaya E, Volova TG, Sinskey AJ. 2012. Chapter 17: Manipulation of Ralstonia eutropha Carbon Storage Pathways to Produce Useful Bio-Based Products. Di Dalam: Wang X, Chen J Quinn PJ. 2012. ''Reprogramming Microbial Metabolic Pathways''. Dordrecht: Springer.</ref> Bakteri ini mampu menghasilkan PHA dengan produktivitas yang mencapai 80% dari bobot sel keringnya.<ref name="F"/> Bakteri ini digunakan sebagai organisme model untuk mempelajari biosintesis PHA karena bakteri tersebut mudah dimanipulasi secara [[genetika]].<ref name="F"/>
Bakteri ''R. eutropha'' terbilang relevan dalam industri PHA dan [[bioproduk]] lainnya karena memiliki sifat-sifat berikut:
* Dapat di[[rekayasa genetika]]. Hal ini mempermudah mencari galur unggul produksi bioproduk<ref name="F"/>
* Mampu mengggunakan berbagai sumber karbon dalam jangkauan yang luas. ''R. eutropha'' mampu menggunakan substrat karbon yang relatif murah untuk produksi bioproduk, sehingga ongkos produksi dapat ditekan<ref name="F"/>
* Memiliki metabolisme penyimpanan karbon yang kuat, dapat mengakumulasi PHA dalam kemurniann dan produktivitas yang tinggi di dalam sel<ref name="F"/>
* Bersifat autorof, sehingga dapat mengikat karbon dioksida untuk produksi berbagai bioproduk<ref name="F"/>
* Tidak [[patogen]], sehingga meningkatkan keamanan pekerja<ref name="F"/>
* Relatif tahan terhadap beberapa materi beracun, termasuk [[karbon monoksida]]<ref name="F"/>
=== Bioremediasi ===
Selain untuk memproduksi PHA, ''R.eutropha'' mempunyai aplikasi bioteknologi yang luas.<ref name="G"/><ref name="I"/> Bakteri ini dikenal mampu men[[degradasi]] berbagai senyawa aromatik, sehingga aplikasinya dalam bidang bioremediasi dapat dipertimbangkan.<ref name="G">{{en}} Park JM, Kim TY, Lee SY. 2011. [http://www.biomedcentral.com/1752-0509/5/101 Genome-scale reconstruction and in silico analysis of Ralstonia eutropha H16 for polyhydroxyalkanoate synthesis, lithoautothrophic growth, and 2-methyl citric acid production]. BMC System Biol 5: DOI: 101-113.10.1186/1752-0509-5-101</ref> Selain senyawa aromatik, ''R. eutropha'' juga pernah dilaporkan mampu mendegradasi senyawa [[polutan]] lain seperti [[formaldehida]] dan [[etanatiol]].<ref name="I">{{en}}Sedighi M, Vahabzadeh F, Morteza F, Naderifar A. 2013. Ethanatiol degradation by ''Ralstonia eutropha''. ''Biotech Bioprocess Eng'' 18: 827-833.</ref><ref name="H">{{en}}Habibi A, Vahabzadeh F. 2012. Degradation of formaldehide in packed-bed immobilized ''Ralstonia eutropha''. ''Biotechnol Bioprocess Eng'' 18: 455-464.doi:10.1007/s12257-012-0200-5</ref>
=== Produksi Bioproduk Lainnya ===
''R.eutropha'' juga dikenal secara alami mampu memproduksi enzim yang mempunyai aplikasi industri seperti [[esterase]] dan [[lipase]].<ref name="J">{{en}}Song S, Hein S, Steinbuchel A. 2000. Cloning, nucleotide sequence and primary biochemical characterization of esterase EstA from Ralstonia eutropha CH34. ''Biotechnol let'' 22: 444-449.</ref><ref name="K">{{en}} Lu J, Bringham CJ, Rha C, Sinskey AJ. 2013 Characterization of extracellular lipase and its chaperone from Ralstonia eutropha H16. Appl Microbiol Biotechnol 97: 2443-2454.doi:10.1007/s00253-012-4115-z</ref> Lebih jauh lagi, rekayasa genetika pada bakteri ini dapat dilakukan untuk menghasilkan berbagai produk yang memiliki nilai tambah.<ref name="K"/> ''R.eutropha'' telah berhasil direkayasa untuk produksi [[isobutanol]].<ref name="K"/> ''R.eutropha'' juga telah direkayasa hingga mampu memproduksi produksi [[vanilin]] yang berperan dalam memperkaya rasa pada produk makanan.<ref name="F"/> [[Rekayasa genetika]] ''R.eutropha'' untuk produksi [[asam metilsitrat]] untuk industri [[farmasi]] juga pernah dilaporkan.<ref name="L">{{en}} Ewerwing C, Heuser F, Benolken JK, Bramer CO, Steinbuchel A. 2006. Metabolic engineering of strains of ''Ralstonia eutropha'' and ''Pseudomonas putida'' for biotechnological production of 2-methylcitric acid. ''Metab Eng'' 8: 587-602.</ref>
== Referensi ==
<references/>
== Pranala luar ==
* [http://www.researchgate.net/...Ralstonia_eutropha.../79e4150869c541ff42.pdf Artikel komprehensif mengenai ''R. eutropha'']
{{Taxonbar|from=Q12740362}}
[[Kategori:Bakteri]]
| |||