Ralstonia eutropha: Perbedaan antara revisi

Jelajahi riwayat secara interaktif

← Revisi sebelumnya

Konten dihapus Konten ditambahkan

VisualTeks wiki

Revisi per 7 April 2014 15.36 sunting BP62Stevanus (bicara \| kontrib) 1.213 suntingan →Bioremediasi Tag: BP2014 ← Revisi sebelumnya		Revisi terkini sejak 2 Januari 2023 02.47 sunting balikkan Arya-Bot (bicara \| kontrib) Bot, Pengecualian blokir IP 261.428 suntingan k →Bioremediasi: clean up Tag: AWB
(36 revisi perantara oleh 5 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1: {{Taxobox ~~{{inuseBP\|BP62Stevanus\|1 April 2014\|1 April 2014}}~~ \| color = lightgrey \| image= Cupriavidus necator.jpg \| image_caption = \| regnum = [[Bacteria]] \| phylum = [[Proteobacteria]] \| ordo = [[Burkholderiales]] \| familia = [[Burkholderiaceae]] \| genus = ''[[Cupriavidus]]'' \| species = '''''C. necator''''', (dahulu) ''R. eutropha'' \| binomial = ''Cupriavidus necator'', (dahulu) ''Ralstonia eutropha'' \| binomial_authority = Makkar and Casida, 1987 }} '''''Ralstonia eutropha''''' (disingkat '''''R. eutropha'''''), yang kini dikenal sebagai '''''Cupriavidus necator''''', adalah sebuah [[bakteri]] [[Gram negatif]] yang tergolong dalam kelas ''[[beta-~~proteobakteria~~proteobacteria]]''.<ref name="B"/> Bakteri ini merupakan [[organisme model]] untuk mempelajari metabolisme [[polihidroksi alkanoat]].<ref name="F"/>. ▼ == Deskripsi dan Taksonomi ==▼ ▲'''''Ralstonia eutropha''''' (disingkat '''''R. eutropha'''''), yang kini dikenal sebagai '''''Cupriavidus necator''''', adalah sebuah [[bakteri]] [[Gram negatif]] yang tergolong dalam kelas [[beta-proteobakteria]]. Bakteri ini merupakan [[organisme model]] untuk mempelajari metabolisme [[polihidroksi alkanoat]]<ref name="F"/>. ''R. eutropha'' termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama.<ref name="A"/> Pada awalnya ''R. eutropha'' disebut sebagai ''[[Alcaligenes eutrophus]]'', kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama ''Cupriavidus necator''.<ref name="A">{{en}} {{cite book▼ \| last = Ramos JL, Levesque LC.▼ \| first = ▼ \| authorlink = ▼ \| title = Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues▼ \| publisher = Springer▼ \| year = 2006 ▼ \| id = ISBN ~~0306483785~~0-306-48378-5, 9780306483783}}▼ </ref>.▼ ''R. eutropha'' merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan [[flagella]] yang berbentuk [[peritrikus]].<ref name="B"/> ''R. eutropha'' mempunyai aktivitas [[katalase]] dan [[oksidase]].<ref name="B"/> Bakteri ini tahan terhadap berbagai [[ion]] [[logam]] dan mampu menggunakan beberapa [[asam amino]] sebagai sumber [[karbon]] dan [[nitrogen]] tunggal. Konten basa [[Guanin]] dan [[Sitosin]] pada bakteri dalam genus ''Cupriavidus'' adallah sekitar 63 sampai 69 [[mol]]%.<ref name="B"/> ''R. eutropha'' adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah .<ref name="B">{{en}} {{cite journal▼ ▲==Deskripsi dan Taksonomi== ▲''R. eutropha'' termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama. Pada awalnya ''R. eutropha'' disebut sebagai ''Alcaligenes eutrophus'', kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama ''Cupriavidus necator''<ref name="A">{{en}}{{cite book ▲ \| last = Ramos JL, Levesque LC. ▲ \| first = ▲ \| authorlink = ▲ \| title = Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues ▲ \| publisher = Springer ▲ \| year = 2006 ▲ \| id = ISBN 0306483785, 9780306483783}} ▲</ref>. ▲''R. eutropha'' merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan [[flagella]] yang berbentuk [[peritrikus]]. ''R. eutropha'' mempunyai aktivitas [[katalase]] dan [[oksidase]]. Bakteri ini tahan terhadap berbagai [[ion]] [[logam]] dan mampu menggunakan beberapa [[asam amino]] sebagai sumber [[karbon]] dan [[nitrogen]] tunggal. Konten basa [[Guanin]] dan [[Sitosin]] pada bakteri dalam genus ''Cupriavidus'' adallah sekitar 63 sampai 69 [[mol]]%. ''R. eutropha'' adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah <ref name="B">{{en}}{{cite journal \| author = Vandamme P, Coenye T. \| year = 2004 Baris 29 ⟶ 40: \| accessdate = 6 April 2014 }} </ref>. == Kemampuan Metabolisme == ''R. eutropha'' adalah termasuk bakteri [[litoautotrof]] yang mampu meng[[oksidasi]] gas [[hidrogen]].<ref name="C">{{en}} {{cite journal \| author = Pohlmann A, ''et al''. \| year = 2006 Baris 47 ⟶ 58: \| accessdate = 6 April 2014 }} </ref>. Bakteri ini dapat hidup sebagai [[autotrof]] maupun [[heterotrof]].<ref name="C"/>. Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun [[molekul organik]] dapat digunakan sebagai sumber [[energi]].<ref name="C"/>. Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat [[karbon dioksida]] melalui [[jalur pentosa-fosfat]], dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui [[siklus Krebs]].<ref name="D">{{en}} {{cite journal \| author = Cramm R \| year = 2009 Baris 62 ⟶ 73: \| accessdate = 6 April 2014 }} </ref>. Terlebih lagi, ''R. eutropha'' memiliki kemampuan untuk memecah senyawa [[aromatik]], hal ini memberikan potensi kepada ''R. eutropha'' dalam aplikasi [[bioremediasi]].<ref name="E">{{en}} {{cite journal \| author = Lykidis A, ''et al''. \| year = 2010 Baris 77 ⟶ 88: \| accessdate = 6 April 2014 }} </ref>. Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme ''R. eutropha'' secara mendalam, [[genom]] ''R. eutropha'' [[galur]] H16 telah diurutkan (di-''[[Sequence]]'') secara menyeluruh.<ref name="C"/>. Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa.<ref name="C"/>. Genom terdiri dari dua [[kromosom]] dan satu [[megaplasmid]].<ref name="C"/>. == Aplikasi ==▼ === Produksi PHA ===▼ ''R. eutropha'' diketahui mampu mengakumulasi polihidroksi alkanoat (PHA), senyawa [[hidrokarbon]] yang dapat dimanfaatkan sebagai [[bioplasik]].{{fact}} PHA dikumpulkan oleh ''R. eutropha'' di dalam sel ketika sumber [[karbon]] berlebih sementara sumber [[nitrogen]] atau [[fosfat]] terbatas .<ref name="F">{{en}} Brigham CJ, Zhila N, Shishatskaya E, Volova TG, Sinskey AJ. 2012. Chapter 17: Manipulation of Ralstonia eutropha Carbon Storage Pathways to Produce Useful Bio-Based Products. Di Dalam: Wang X, Chen J Quinn PJ. 2012. ''Reprogramming Microbial Metabolic Pathways''. Dordrecht: Springer.</ref>. Bakteri ini mampu menghasilkan PHA dengan produktivitas yang mencapai 80% dari bobot sel keringnya.<ref name="F"/>. Bakteri ini digunakan sebagai organisme model untuk mempelajari biosintesis PHA karena bakteri tersebut mudah dimanipulasi secara [[genetika]].<ref name="F"/>.▼ ▲==Aplikasi== ▲===Produksi PHA=== ▲''R. eutropha'' diketahui mampu mengakumulasi polihidroksi alkanoat (PHA), senyawa [[hidrokarbon]] yang dapat dimanfaatkan sebagai [[bioplasik]]. PHA dikumpulkan oleh ''R. eutropha'' di dalam sel ketika sumber [[karbon]] berlebih sementara sumber [[nitrogen]] atau [[fosfat]] terbatas <ref name="F">{{en}}Brigham CJ, Zhila N, Shishatskaya E, Volova TG, Sinskey AJ. 2012. Chapter 17: Manipulation of Ralstonia eutropha Carbon Storage Pathways to Produce Useful Bio-Based Products. Di Dalam: Wang X, Chen J Quinn PJ. 2012. ''Reprogramming Microbial Metabolic Pathways''. Dordrecht: Springer.</ref>. Bakteri ini mampu menghasilkan PHA dengan produktivitas yang mencapai 80% dari bobot sel keringnya<ref name="F"/>. Bakteri ini digunakan sebagai organisme model untuk mempelajari biosintesis PHA karena bakteri tersebut mudah dimanipulasi secara [[genetika]]<ref name="F"/>. Bakteri ''R. eutropha'' terbilang relevan dalam industri PHA dan [[bioproduk]] lainnya karena memiliki sifat-sifat berikut: * Dapat di[[rekayasa genetika]]. Hal ini mempermudah mencari galur unggul produksi bioproduk<ref name="F"/>. * Mampu mengggunakan berbagai sumber karbon dalam jangkauan yang luas. ''R. eutropha'' mampu menggunakan substrat karbon yang relatif murah untuk produksi bioproduk, sehingga ongkos produksi dapat ditekan<ref name="F"/>. * Memiliki metabolisme penyimpanan karbon yang kuat, dapat mengakumulasi PHA dalam kemurniann dan produktivitas yang tinggi di dalam sel<ref name="F"/>. * Bersifat autorof, sehingga dapat mengikat karbon dioksida untuk produksi berbagai bioproduk<ref name="F"/>. * Tidak [[patogen]], sehingga meningkatkan keamanan pekerja<ref name="F"/>. * Relatif tahan terhadap beberapa materi beracun, termasuk [[karbon monoksida]]<ref name="F"/>. === Bioremediasi === Selain untuk memproduksi PHA, ''R.eutropha'' mempunyai aplikasi bioteknologi yang luas.<ref name="G"/><ref name="I"/> Bakteri ini dikenal mampu men[[degradasi]] berbagai senyawa aromatik, sehingga aplikasinya dalam bidang bioremediasi dapat dipertimbangkan.<ref name="G">{{en}} Park JM, Kim TY, Lee SY. 2011. [http://www.biomedcentral.com/1752-0509/5/101 Genome-scale reconstruction and in silico analysis of Ralstonia eutropha H16 for polyhydroxyalkanoate synthesis, lithoautothrophic growth, and 2-methyl citric acid production]. BMC System Biol 5: DOI: 101-113.10.1186/1752-0509-5-101</ref>~~, sehingga aplikasinya dalam bidang bioremediasi dapat dipertimbangkan.~~ Selain senyawa aromatik, ''R. eutropha'' juga pernah dilaporkan mampu mendegradasi senyawa [[polutan]] lain seperti [[formaldehida]] dan [[etanatiol]].<ref ~~(Habibi~~name="I">{{en}}Sedighi &M, Vahabzadeh ~~2013;~~F, ~~Sedighi~~Morteza etF, Naderifar alA. 2013). Ethanatiol degradation by ''Ralstonia eutropha''. ''Biotech Bioprocess Eng'' 18: 827-833.</ref><ref name="H">{{en}}Habibi A, Vahabzadeh F. 2012. Degradation of formaldehide in packed-bed immobilized ''Ralstonia eutropha''. ''Biotechnol Bioprocess Eng'' 18: 455-464.doi:10.1007/s12257-012-0200-5</ref> === Produksi Bioproduk Lainnya === ''R.eutropha'' juga dikenal secara alami mampu memproduksi enzim yang mempunyai aplikasi industri seperti [[esterase]] dan [[lipase]].<ref (name="J">{{en}}Song etS, alHein S, Steinbuchel A. 2000;. Cloning, nucleotide sequence and primary biochemical characterization of esterase EstA from Ralstonia eutropha CH34. ''Biotechnol let'' 22: 444-449.</ref><ref name="K">{{en}} Lu etJ, alBringham CJ, Rha C, Sinskey AJ. 2013) Characterization of extracellular lipase and its chaperone from Ralstonia eutropha H16. Appl Microbiol Biotechnol 97: 2443-2454.doi:10.1007/s00253-012-4115-z</ref> Lebih jauh lagi, rekayasa genetika pada bakteri ini dapat dilakukan untuk menghasilkan berbagai produk yang memiliki nilai tambah.<ref name="K"/> ''R.eutropha'' telah berhasil direkayasa untuk produksi [[isobutanol]] ~~(Lu et al~~.<ref ~~2012).~~name="K"/> ''R.eutropha'' juga telah direkayasa hingga mampu memproduksi produksi [[vanilin]] yang berperan dalam memperkaya rasa pada produk makanan.<ref name="F"/>. [[Rekayasa genetika]] ''R.eutropha'' untuk produksi [[asam metilsitrat]] untuk industri [[farmasi]] juga pernah dilaporkan.<ref name="L">{{en}} (Ewerwing etC, Heuser F, Benolken JK, Bramer CO, Steinbuchel alA. 2006). Metabolic engineering of strains of ''Ralstonia eutropha'' and ''Pseudomonas putida'' for biotechnological production of 2-methylcitric acid. ''Metab Eng'' 8: 587-602.</ref> == Referensi == <references/> == Pranala luar == * [http://www.researchgate.net/...Ralstonia_eutropha.../79e4150869c541ff42.pdf Artikel komprehensif mengenai ''R. eutropha''] {{Taxonbar\|from=Q12740362}} [[Kategori:Bakteri]]