Nukleosida trifosfat: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
refrensi |
menambah referensi dan pranala |
||
| (10 revisi perantara oleh 6 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 1:
Sebuah '''nukleosida trifosfat''' adalah [[molekul]] yang mengandung [[Basa nukleotida|basa nitrogen]] terikat pada gula 5-karbon (baik [[Ribosom|ribosa]] atau [[deoksiribosa]]), dengan tiga gugus [[Ortofosfat|fosfat]] terikat pada [[gula]].<ref>{{Cite journal|date=2008-11-28|title=PLoS Genetics Issue Image {{!}} Vol. 4(11) November 2008|url=http://dx.doi.org/10.1371/image.pgen.v04.i11|journal=PLoS Genetics|volume=4|issue=11|pages=ev04.i11|doi=10.1371/image.pgen.v04.i11|issn=1553-7404}}</ref>Ini adalah contoh nukleotida. Mereka adalah prekursor molekul [[Asam deoksiribonukleat|DNA]] dan [[Asam ribonukleat|RNA]], yang merupakan rantai nukleotida yang dibuat melalui proses [[Replikasi DNA|replikasi]] dan [[Transkripsi|transkripsi
▲Sebuah '''nukleosida trifosfat''' adalah molekul yang mengandung [[Basa nukleotida|basa nitrogen]] terikat pada gula 5-karbon (baik [[Ribosom|ribosa]] atau [[deoksiribosa]]), dengan tiga gugus [[Ortofosfat|fosfat]] terikat pada gula.<ref>{{Cite journal|date=2008-11-28|title=PLoS Genetics Issue Image {{!}} Vol. 4(11) November 2008|url=http://dx.doi.org/10.1371/image.pgen.v04.i11|journal=PLoS Genetics|volume=4|issue=11|pages=ev04.i11|doi=10.1371/image.pgen.v04.i11|issn=1553-7404}}</ref>Ini adalah contoh nukleotida. Mereka adalah prekursor molekul [[Asam deoksiribonukleat|DNA]] dan [[Asam ribonukleat|RNA]], yang merupakan rantai nukleotida yang dibuat melalui proses [[Replikasi DNA|replikasi]] dan [[Transkripsi|transkripsi DN]]A.<ref>{{Cite book|date=1960|url=https://www.worldcat.org/oclc/820457150|title=The nucleic acids. Volume III|location=New York|publisher=Academic Press|isbn=978-0-323-14477-3|others=Erwin Chargaff, J. N. Davidson|oclc=820457150}}</ref> Trifosfat nukleosida juga berfungsi sebagai sumber energi untuk reaksi seluler <ref>{{Cite journal|date=2017-11|title=PS1 Original focuses on increased efficiency|url=http://dx.doi.org/10.1016/s0262-1762(18)30019-1|journal=World Pumps|volume=2017|issue=11|pages=11|doi=10.1016/s0262-1762(18)30019-1|issn=0262-1762}}</ref> dan terlibat dalam jalur sinyal. <ref>{{Cite journal|last=Seybold|first=Patricia|date=2011-03|title=Nature's Scitable: Going Mobile|url=http://dx.doi.org/10.1571/cs03-31-11cc|location=Boston, MA}}</ref>
Nukleosida trifosfat tidak dapat diserap dengan baik, sehingga biasanya disintesis di dalam [[sel]].<ref>{{Cite book|url=http://dx.doi.org/10.5040/9781472927002.0277|title=Melignomon eisentrauti Louette. Yellow-footed Honeyguide; Eisentraut’s Honeyguide; Coe’s Honeyguide. Indicateur de Eisentraut.|publisher=Academic Press Limited}}</ref> Jalur sintesis berbeda tergantung pada [[nukleosida]] trifosfat spesifik yang dibuat, tetapi mengingat banyak peran penting nukleosida trifosfat, sintesis diatur secara ketat dalam semua kasus.<ref>{{Cite journal|last=Wyngaarden|first=James B.|date=1976-01|title=Regulation of purine biosynthesis and turnover|url=http://dx.doi.org/10.1016/0065-2571(76)90006-6|journal=Advances in Enzyme Regulation|volume=14|pages=25–42|doi=10.1016/0065-2571(76)90006-6|issn=0065-2571}}</ref> [[Analog nukleosida]] juga dapat digunakan untuk mengobati infeksi [[virus]].<ref>{{Cite journal|last=Galmarini|first=CM|last2=Mackey|first2=JR|last3=Dumontet|first3=C|date=2001-06|title=Nucleoside analogues: mechanisms of drug resistance and reversal strategies|url=http://dx.doi.org/10.1038/sj.leu.2402114|journal=Leukemia|volume=15|issue=6|pages=875–890|doi=10.1038/sj.leu.2402114|issn=0887-6924}}</ref> Misalnya, azidothymidine (AZT) adalah analog [[nukleosida]] yang digunakan untuk mencegah dan mengobati [[HIV/AIDS
== Penamaan ==▼
Istilah [[nukleosida]] mengacu pada [[basa nitrogen]] terkait dengan gula 5-karbon (baik [[ribosa]] atau [[deoksiribosa]]).<ref>{{Cite
Nukleotida biasanya disingkat dengan 3 huruf (4 atau 5 untuk deoksi- atau dideoksi-nukleotida). Huruf pertama menunjukkan identitas basa nitrogen (misalnya A untuk [[Adenina|adenin]], G untuk [[Guanina|guanin]]), huruf kedua menunjukkan jumlah fosfat (mono, di, tri), dan huruf ketiga adalah P, singkatan dari fosfat.
Karbon gula dalam nukleosida trifosfat diberi nomor di sekitar cincin karbon mulai dari [[karbonil]] asli gula. Secara konvensional, nomor karbon dalam gula diikuti dengan simbol prima (‘) untuk membedakannya dari karbon basa nitrogen. Basa nitrogen dihubungkan dengan karbon 1 'melalui ikatan glikosidik, dan gugus fosfat terikat secara kovalen dengan karbon 5'.
== Sintesis DNA dan RNA ==
Proses seluler [[Replikasi DNA|replikasi]] dan [[Transkripsi (genetik)|transkripsi DNA]] melibatkan sintesis DNA dan RNA, masing-masing. Sintesis DNA menggunakan dNTP sebagai substrat, sedangkan sintesis RNA menggunakan NTP sebagai substrat.<ref name=":8">{{cite book | url = https://books.google.com/books?id=o0xA2udqufwC&q=nucleic+acid+synthesis&pg=PP1 | title = The Nucleic Acids | vauthors = Chargaff E | date=2012-12-02|publisher=Elsevier|isbn=9780323144773}}</ref> NTP tidak dapat dikonversi langsung ke dNTP. DNA mengandung empat basa nitrogen yang berbeda: [[Adenina|adenin]], [[Guanina|guanin]], [[Sitosina|sitosin]], dan [[Timina|timin]]. RNA juga mengandung adenin, guanin, dan sitosin, tetapi menggantikan timin dengan [[urasil]].<ref>{{Cite news|url=https://www.thoughtco.com/dna-versus-rna-608191|title=Do You Know the Differences Between DNA and RNA?|work=ThoughtCo|access-date=2017-11-11}}</ref> Dengan demikian, sintesis DNA membutuhkan dATP, dGTP, dCTP, dan dTTP sebagai substrat, sedangkan sintesis RNA membutuhkan ATP, GTP, CTP, dan UTP.
Sintesis asam nukleat dikatalisis oleh [[DNA polimerase]] atau [[RNA polimerase]] masing-masing untuk sintesis DNA dan RNA.<ref>{{Cite web|url=http://www.differencebetween.com/difference-between-dna-polymerase-and-vs-rna-polymerase/|title=Difference Between DNA Polymerase and RNA Polymerase|access-date=2017-11-11|date=2011-12-24}}</ref> Enzim-enzim ini secara kovalen menghubungkan gugus -OH bebas pada karbon 3' dari rantai nukleotida yang sedang tumbuh ke -fosfat pada karbon 5' NTP berikutnya, melepaskan gugus - dan -fosfat sebagai [[pirofosfat]] (PPi).<ref name=":2">{{cite book | vauthors = Lodish H, Berk A, Zipursky SL, Matsudaira P, Baltimore D, Darnell J |date=2000|title=Nucleic Acid Synthesis|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21644/}}</ref> Ini menghasilkan hubungan fosfodiester antara dua (d)NTP. Pelepasan PPi memberikan energi yang diperlukan untuk terjadinya reaksi.<ref name=":2" /> Penting untuk dicatat bahwa sintesis asam nukleat terjadi secara eksklusif dalam arah 5 'ke 3'.
== Referensi ==
[[Kategori:Asam nukleat]]
[[Kategori:Nukleotida|trifosfat]]
[[Kategori:Ester fosfat]]
▲== Penamaan ==
▲Istilah nukleosida mengacu pada basa nitrogen terkait dengan gula 5-karbon (baik ribosa atau deoksiribosa).<ref>{{Cite journal|last=Berk|first=Arnold|last2=Baltimore|first2=David|last3=Lodish|first3=Harvey|last4=Darnell|first4=James|last5=Matsudaira|first5=Paul|last6=Zipursky|first6=S. Lawrence|date=1996-12-31|title=Molekulare Zellbiologie|url=http://dx.doi.org/10.1515/9783110810578|doi=10.1515/9783110810578}}</ref> Nukleotida adalah nukleosida yang terikat secara kovalen dengan satu atau lebih gugus fosfat.<ref>{{Cite journal|last=Secrist|first=Jack|date=2005-09-01|title=John A. Montgomery, March 29, 1924–May 24, 2004|url=http://dx.doi.org/10.1080/15257770500482340|journal=Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids|volume=24|issue=10-12|pages=1387–1394|doi=10.1080/15257770500482340|issn=1525-7770}}</ref> Untuk memberikan informasi tentang jumlah fosfat, nukleotida dapat disebut sebagai nukleosida (mono, di, atau tri) fosfat. Jadi, nukleosida trifosfat adalah jenis nukleotida.[10]
▲Nukleotida biasanya disingkat dengan 3 huruf (4 atau 5 untuk deoksi- atau dideoksi-nukleotida). Huruf pertama menunjukkan identitas basa nitrogen (misalnya A untuk adenin, G untuk guanin), huruf kedua menunjukkan jumlah fosfat (mono, di, tri), dan huruf ketiga adalah P, singkatan dari fosfat.[11 ] Nukleosida trifosfat yang mengandung ribosa sebagai gula secara konvensional disingkat sebagai NTP, sedangkan nukleosida trifosfat yang mengandung deoksiribosa sebagai gula disingkat dNTP. Misalnya, dATP adalah singkatan dari deoxyribose adenosine triphosphate. NTP adalah bahan penyusun RNA, dan dNTP adalah bahan penyusun DNA.[12]
▲Karbon gula dalam nukleosida trifosfat diberi nomor di sekitar cincin karbon mulai dari karbonil asli gula. Secara konvensional, nomor karbon dalam gula diikuti dengan simbol prima (‘) untuk membedakannya dari karbon basa nitrogen. Basa nitrogen dihubungkan dengan karbon 1 'melalui ikatan glikosidik, dan gugus fosfat terikat secara kovalen dengan karbon 5'.[13] Gugus fosfat pertama yang terikat dengan gula disebut -fosfat, yang kedua adalah -fosfat, dan yang ketiga adalah -fosfat.[14]
| |||