Varian Alpha SARS-CoV-2: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
k variant of concern -> varian yang memprihatinkan |
k Hungaria |
||
(16 revisi perantara oleh 13 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 16:
Pada 2 Februari 2021, [[Kesehatan Masyarakat Inggris]] (PHE) melaporkan bahwa mereka telah menemukan dalam jumlah terbatas genom B.1.1.7 VOC-202012/01 dengan mutasi [[E484K]]<ref name="E484K">{{cite report |title=Investigation of novel SARS-CoV-2 variant Variant of Concern 202012/01: Technical briefing 5 |date=2 Februari 2021 |publisher=[[Kesehatan Masyarakat Inggris|Public Health England]] |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/957504/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_5_England.pdf |access-date=2 Februari 2021 |language=en}}</ref> yang mereka sebut dengan Variant of Concern 202102/02 (VOC-202102/02).<ref name="PHE202102">{{cite web |url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data |author=[[Kesehatan Masyarakat Inggris|Public Health England]] |date=16 Februari 2021 |title=Variants: distribution of cases data |website=GOV.UK |access-date=17 Februari 2021 |language=en}}</ref> Salah satu mutasinya (N501Y) juga ada dalam [[Varian Beta SARS-CoV-2|varian Beta]] dan [[Varian Gamma SARS-CoV-2|Gamma]].
[[Organisasi Kesehatan Dunia]] (WHO) melabeli varian ini sebagai varian '''Alpha''' bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik.<ref>{{cite web |url=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants |title=Tracking SARS-CoV-2 variants |website=www.who.int |access-date=30 Juni 2021 |language=en}}</ref> WHO menganggapnya sebagai varian yang
== Nama ==
Varian ini dikenal dalam berbagai nama. Dalam laporan pemerintah Britania Raya dan media massa, ia disebut dengan ''UK COVID-19 variant'', ''UK coronavirus variant'', ''UK variant'',<ref>Untuk daftar lengkap sumber berita yang memakai istilah-istilah ini, lihat [[:en:Talk:U.K. Covid-19 variant|UK Covid-19 variant]], [[:en:Talk:U.K. Coronavirus variant|UK coronavirus variant]], dan [[:en:Talk:U.K. variant|UK variant]].</ref> atau (khususnya di luar Britania Raya) ''varian Britania Raya'' atau ''varian Inggris''. Ia terkadang disebut ''varian Kent'' karena ditemukan pertama kali di [[Kent]].<ref name="BBC202102">{{cite news |last=Roberts |first=Michelle |date=2 Februari 2021 |title=UK variant has mutated again, scientists say |website=BBC News |url=https://www.bbc.co.uk/news/health-55900625 |access-date=2 Februari 2021 |language=en}}</ref><ref>{{cite news |last=Boseley |first=Sarah |date=10 Februari 2021 |title=Mutated Kent Covid variant must be taken seriously, warns UK scientist |website=The Guardian |url=https://www.theguardian.com/society/2021/feb/10/mutated-kent-covid-variant-must-be-taken-seriously-warns-uk-scientist |access-date=10 Februari 2021 |language=en}}</ref>
Dalam dunia ilmiah, varian ini diberi nama ''the first Variant Under Investigation in December 2020 (VUI – 202012/01)'' pada awalnya oleh Kesehatan Masyarakat Inggris (PHE),<ref>{{cite web |url=https://www.gov.uk/government/news/phe-investigating-a-novel-strain-of-covid-19 |title=PHE investigating a novel strain of COVID-19 |date=14 Desember 2020 |publisher=[[Kesehatan Masyarakat Inggris|Public Health England]] |language=en}} {{OGL-attribution|version=3.0}}</ref>{{efn|Nama ini ditulis sebagai '''VUI 202012/01 (Variant Under Investigation, year 2020, month 12, variant 01)''' oleh [[GISAID]]<ref>{{cite web |url=https://www.gisaid.org/references/gisaid-in-the-news/uk-reports-new-variant-termed-vui-20201201/ |title=UK reports new variant, termed VUI 202012/01 |publisher=GISAID |access-date=20 Desember 2020 |language=en |archive-date=2020-12-20 |archive-url=https://web.archive.org/web/20201220220828/https://www.gisaid.org/references/gisaid-in-the-news/uk-reports-new-variant-termed-vui-20201201/ |dead-url=yes }}</ref> dan [[Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa|ECDC]].<ref>{{cite report |url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/SARS-CoV-2-variant-multiple-spike-protein-mutations-United-Kingdom.pdf |title=Threat Assessment Brief: Rapid increase of a SARS-CoV-2 variant with multiple spike protein mutations observed in the United Kingdom |date=20 Desember 2020 |publisher=European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) |language=en}}</ref>}} tetapi diklasifikasikan ulang menjadi Variant of Concern (''Variant of Concern 202012/01'', disingkat ''VOC-202012/01'') oleh Meera Chand dan koleganya dalam laporan yang dipublikasikan oleh PHE pada 21 Desember 2020.<ref name="Chand2020">{{cite report |last1=Chand |first1=Meera |last2=Hopkins |first2=Susan |last3=Dabrera |first3=Gavin |last4=Achison |first4=Christina |last5=Barclay |first5=Wendy |last6=Ferguson |first6=Neil |last7=Volz |first7=Erik |last8=Loman |first8=Nick |last9=Rambaut |first9=Andrew |last10=Barrett |first10=Jeff |date=21 Desember 2020 |title=Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01 |publisher=[[Kesehatan Masyarakat Inggris|Public Health England]] |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/947048/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf |access-date=23 Desember 2020 |language=en}} {{OGL-attribution|version=3.0}}</ref>{{efn|Perbedaan di antara keduanya dijelaskan oleh PHE, {{blockquote|SARS-CoV-2 variants, if considered to have concerning epidemiological, immunological, or pathogenic properties, are raised for formal investigation. At this point they are designated Variant Under Investigation (VUI) with a year, month, and number. Following a risk assessment with the relevant expert committee, they may be designated Variant of Concern (VOC).<ref>{{cite web |url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data#variant1 |title=Variants: distribution of cases data |date=28 Januari 2021 |at=Pada "Differences between a Variant of Concern and Varaint Under Investigation" |website=GOV.UK |access-date=19 Februari 2021 |language=en}} {{OGL-attribution|version=3.0}}</ref>}}}} Dalam laporan yang ditulis oleh Andrew Rambaut dkk. yang mewakili [[Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19]], dengan alat [[Pangolin (alat)|Pangolin]], varian ini disebut ''Lineage B.1.1.7'',<ref>{{cite report |author1=Rambaut, Andrew |author2=Loman, Nick |author3=Pybus, Oliver |author4=Barclay, Wendy |author5=Barrett, Jeff |author6=Carabelli, Alesandro |author7=Connor, Tom |author8=Peacock, Tom |author9=L. Robertson, David |author10=Vol, Erik |year=2020 |title=Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations |publisher=Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK |url=https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563 |access-date=20 Desember 2020 |language=en}}</ref> sedangkan [[Nextstrain]] menyebutnya dengan ''20I/501Y.V1''.<ref>{{cite journal |last=Callaway |first=Ewen |date=15 Januari 2021 |title=‘A bloody mess’: Confusion reigns over naming of new COVID variants |journal=[[Nature|Nature News & Comment]] |doi-access=free |doi=10.1038/d41586-021-00097-w |url=https://www.nature.com/articles/d41586-021-00097-w |access-date=18 Januari 2021 |quote=... Emma Hodcroft, a molecular epidemiologist at the University of Bern, Switzerland, who is part of Nextstrain, the SARS-CoV-2 naming effort that called the ‘UK variant’ 20I/501Y.V1. |language=en}}</ref>
Nama ''VOC-202102/02'' merujuk pada varian dengan mutasi [[E484K]] (baca {{slink||Mutasi E484K}}).<ref name="PHE202102" />
Baris 106:
=== Mutasi E484K ===
Pada 2 Februari 2021, [[Kesehatan Masyarakat Inggris]] melaporkan bahwa mereka menemukan beberapa genom VOC-202012/01 dengan mutasi [[E484K]]<ref name="E484K" /> yang juga muncul dalam [[Varian Beta SARS-CoV-2|varian Beta]] dan [[Varian Gamma SARS-CoV-2|Gamma]]. Mutasi ini bisa mengurangi efektivitas vaksin.<ref name="BBC202102" />
== Statistik ==
=== Tabel ===
{| class="dapat diurutkan menurut wiki"
! colspan="3" |Kasus menurut negara (Diperbarui per 14 Juli 2021) GISAID<ref name="CovLineages1Jul">{{Cite web|title=GISAID - Varian hCov19|url=https://www.gisaid.org/ hcov19-variants/|access-date=2021-07-14|website=www.gisaid.org}}</ref>
|-
! scope="col" |Negara
! scope="col" |Kasus terkonfirmasi
! scope="col" |Kasus Terakhir Dilaporkan
|-
|Britania Raya
|266.195
|27 Juni 2021
|-
|Kanada
|226.246<ref>{{cite web|url=https://www.ctvnews.ca/health/coronavirus/tracking-variants-of-the-novel-coronavirus-in-canada-1.5296141|title=Melacak varian dari Novel Coronavirus di Kanada|website=CTV News|date=4 Februari 2021|access-date=14 Juli 2021}}</ref>
| 6 Juli 2021
|-
|AS
|21,185
|29 Juni 2021
|-
|Jerman
|101.697
|28 Juni 2021
|-
|Denmark
|59.856
|29 Juni 2021
|-
|Swedia
|56,325
|21 Juni 2021
|-
|Prancis
|32.208
|28 Juni 2021
|-
|Belanda
|27.660
|25 Juni 2021
|-
|Jepang
|27.404<ref>{{cite web|url=https://www.niid.go.jp/niid/ja/idwr-dl/2021.html|title=Laporan Mingguan Penyakit Menular|website=Institut Penyakit Menular Nasional |access-date=14 Juli 2021}}</ref>
| 1 Juli 2021
|-
|Italia
|24.075
|30 Juni 2021
|-
|Swiss
|21.690
|26 Juni 2021
|-
|Spanyol
|19.360
|05 Juli 2021
|-
| Belgia
|20,355
|01 Juli 2021
|-
|Polandia
|14.723
|21 Juni 2021
|-
|Irlandia
|14.875
|23 Juni 2021
|-
|Lituania
|9,208
|11 Juni 2021
|-
|Israel
|8.019
|24 Juni 2021
|-
|Norwegia
|8.056
|23 Juni 2021
|-
|Slovenia
|7,930
|20 Juni 2021
|-
|Finlandia
|5.865
|25 Mei 2021
|-
|Yunani
|5.440
|07 Juni 2021
|-
|Portugal
|4.961
|23 Juni 2021
|-
|Slovakia
|4,206
|19 Juni 2021
|-
|Luksemburg
|3,975
|25 Mei 2021
|-
|Kroasia
|3.941
|11 Juni 2021
|-
|Austria
|3,666
|20 Juni 2021
|-
|Republik Ceko
|3.831
|24 Juni 2021
|-
|India
|3.812
|01 Juni 2021
|-
|Latvia
|3,145
|28 Mei 2021
|-
|Estonia
|2,842
|08 Mei 2021
|-
|Bulgaria
|2,889
|17 Mei 2021
|-
|Meksiko
|1,476
|24 Juni 2021
|-
|Thailand
|736
|20 Juni 2021
|-
|Rumania
|646
|15 Juni 2021
|-
|Filipina
|1.027
|30 Maret 2021
|-
|Turki
|606
|25 Mei 2021
|-
|Korea Selatan
|589
|08 Juni 2021
|-
|Aruba
|549
|16 Juni 2021
|-
|Brasil
|496
|01 Juni 2021
|-
|Australia
|500
|04 Juli 2021
|-
|Kenya
|452
|03 Juni 2021
|-
|Kamboja
|348
|26 Juni 2021
|-
|Sint Maarten
|334
|24 Juni 2021
|-
|Rusia
|331
|12 Juni 2021
|-
|Curacao
|311
|19 Mei 2021
|-
|Sri Lanka
|321
|25 Juni 2021
|-
|Ghana
|367
|24 April 2021
|-
| Makedonia Utara
|249
|22 April 2021
|-
|Qatar
|257
|23 Mei 2021
|-
|Singapura
|189
|17 Juni 2021
|-
|Pakistan
|180
|28 Mei 2021
|-
|Bonaire
|174
|15 Juni 2021
|-
|Kazakhstan
|174
|27 April 2021
|-
|Selandia Baru
|150
|14 Juni 2021
|-
|Malta
|148
|11 Juni 2021
|-
|Cile
|155
|12 Juni 2021
|-
|Nigeria
|143
|19 Maret 2021
|-
|Afrika Selatan
|166
|17 Juni 2021
|-
|Gibraltar
|131
|08 Maret 2021
|-
|Argentina
|126
|07 Mei 2021
|-
|Ekuador
|147
|17 Juni 2021
|-
|Cina
|116
|07 Juni 2021
|-
|Kepulauan Canary
|110
|10 Maret 2021
|-
|Maroko
|101
|22 April 2021
|-
|Kosta Rika
|115
|24 Mei 2021
|-
|Bangladesh
|91
|08 Juni 2021
|-
|Kolombia
|87
|25 Mei 2021
|-
|Yordania
|81
|04 Mei 2021
|-
|Bosnia dan Herzegovina
|66
|21 Juni 2021
|-
|Irak
|70
|09 Maret 2021
|-
|Guadeloupe
|70
|08 Juni 2021
|-
|Reuni
|60
|08 Juni 2021
|-
|Angola
|58
|23 April 2021
|-
|Gambia
|53
|25 Maret 2021
|-
|Indonesia
|56
|28 Juni 2021
|-
|Ukraina
|52
|18 Maret 2021
|-
|Iran
|52
|08 Mei 2021
|-
|Bahrain
|51
|14 Juni 2021
|-
|Guyana Prancis
|44
|22 Mei 2021
|-
|Guam
|39
|11 Mei 2021
|-
|Gabon
|35
|05 Mei 2021
|-
|Guinea Bissau
|33
|05 Februari 2021
|-
|Taiwan
|32
|29 Mei 2021
|-
|Djibouti
|62
|31 Maret 2021
|-
|Hungaria
|29
|26 Februari 2021
|-
|Albania
|27
|11 Maret 2021
|-
|Palestina
|27
|09 April 2021
|-
|Vietnam
|26
|06 Mei 2021
|-
|Georgia
|23
|06 April 2021
|-
|Serbia
|23
|11 Maret 2021
|-
|Kuwait
|25
|05 Juni 2021
|-
|Martinik
|22
|25 Mei 2021
|-
|Togo
|21
|25 Februari 2021
|-
|Uni Emirat Arab
|21
|29 Desember 2020
|-
|Barbados
|20
|21 Mei 2021
|-
|Islandia
|20
|05 Januari 2021
|-
|Santo Lucia
|20
|29 April 2021
|-
|Senegal
|24
|30 April 2021
|-
|Uganda
|17
|15 Juni 2021
|-
|Libanon
|16
|03 Mei 2021
|-
| Pantai Gading
|15
|09 Maret 2021
|-
|Jamaika
|15
|12 Februari 2021
|-
|Suriname
|15
|14 Mei 2021
|-
|Armenia
|14
|18 Maret 2021
|-
|Kamerun
|14
|17 April 2021
|-
|Mesir
|13
|17 Mei 2021
|-
| Guinea
|12
| -
|-
|Malaysia
|11
|04 Juni 2021
|-
|Nepal
|11
|02 Juni 2021
|-
|Siprus
|10
|27 Januari 2021
|-
|Wallis dan Futuna
|10
|19 April 2021
|-
|Trinidad dan Tobago
|9
|04 Mei 2021
|-
|Republik Demokratik Kongo
|8
|28 Maret 2021
|-
|Republik Dominika
|8
|14 April 2021
|-
|Peru
|15
|07 April 2021
|-
|Liechtenstein
|7
|16 Mei 2021
|-
|Montenegro
|7
|21 Januari 2021
|-
|Rwanda
|7
|21 Mei 2021
|-
|Antigua dan Barbuda
|5
|06 Mei 2021
|-
|Kepulauan Cayman
|5
|15 Mei 2021
|
|-
|Kepulauan Turks dan Caicos
|5
|22 Maret 2021
|-
|Dominika
|4
|01 April 2021
|-
|Paraguay
|4
|08 April 2021
|-
|Puerto Riko
|4
|11 Juni 2021
|-
|Azerbaijan
|3
|07 Februari 2021
|-
|Belarus
|3
|24 Februari 2021
|-
|Burkina Faso
|3
|03 Februari 2021
|-
|Etiopia
|3
|04 Februari 2021
|-
|Kosovo
|3
|06 Januari 2021
|-
|Malta
|3
|10 Juni 2021
|-
|Moldova
|3
|03 Maret 2021
|-
|Monako
|3
|17 April 2021
|-
|Republik Kongo
|4
|05 Maret 2021
|-
|Tunisia
|7
|08 Maret 2021
|-
|Anguila
|2
|23 Maret 2021
|-
|Bermuda
|2
|05 Januari 2021
|-
|Republik Afrika Tengah
|2
|
|-
|Kepulauan Faroe
|2
|04 Mei 2021
|-
|Grenada
|2
|08 April 2021
|-
|Malawi
|2
|08 Maret 2021
|-
|Mayotte
|2
|21 Mei 2021
|-
|Montserrat
|2
|05 Februari 2021
|-
|Myanmar
|2
|28 Mei 2021
|-
|Somalia
|6
|05 Maret 2021
|-
|Zambia
|2
|11 Februari 2021
|-
| Belize
| 1
|20 Januari 2021
|-
|Kepulauan Virgin Inggris
| 1
|19 April 2021
|-
|Guinea Khatulistiwa
| 1
|09 Februari 2021
|-
| Guatemala
| 1
|07 April 2021
|-
|Haiti
| 1
|19 Mei 2021
|-
|Honduras
| 1
|23 April 2021
|-
|Mauritius
| 1
|10 Januari 2021
|-
|Mozambik
| 1
|21 April 2021
|-
|Kepulauan Mariana Utara
| 1
|29 April 2021
|-
|Oman
|30
|22 Desember 2020
|-
|Arab Saudi
| 1
|15 April 2021
|-
|Niger
| 1
|9 Januari 2021
|-
|Libya
| 1
|5 Juni 2021
|-
|Sudan Selatan
| 1
|3 April 2021
|-
|Burundi
| 1
|27 Mei 2021
|-
|Dunia (160 negara)
|Jumlah: '''1.208.985'''
|<small>Total per 14 Juli 2021</small>
|}
== Penyebaran ==
Baris 111 ⟶ 767:
Kasus varian Alpha (B.1.1.7) mungkin lebih rendah di kebanyakan negara karena pengujian yang dipakai tidak membedakan varian ini dengan varian SARS-CoV-2 lainnya, terlebih lagi banyak infeksi SARS-CoV-2 yang tidak terdeteksi sama sekali. Pengurutan RNA diperlukan untuk mendeteksi varian ini.<ref>{{cite web |url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEA.pdf |title=Risk related to spread of new SARSCoV-2 variants of concern in the EU/EEA |date=29 Desember 2020 |website=www.ecdc.europa.eu |access-date=1 Februari 2021 |language=en}}</ref>
Pada tanggal 2 Maret 2021, [[Pandemi COVID-19 di Indonesia|Indonesia]] melaporkan kasus pertamanya untuk varian ini.<ref>{{cite news |title=Dua Kasus Mutasi Corona Asal Inggris Ditemukan di Indonesia |date=2 Maret 2021 |work=CNN Indonesia |url=https://www.cnnindonesia.com/nasional/20210302120516-20-612595/dua-kasus-mutasi-corona-asal-inggris-ditemukan-di-indonesia |access-date=2 Maret 2021}}</ref><ref>{{cite news |title=Wamenkes Laporkan 2 Kasus Pertama Mutasi Corona B117 di Indonesia |date=2 Maret 2021 |work=detikHealth |url=https://health.detik.com/berita-detikhealth/d-5477409/wamenkes-laporkan-2-kasus-pertama-mutasi-corona-b117-di-indonesia |access-date=2 Maret 2021}}</ref><ref>{{cite news |author=Jawahir Gustav Rizal |editor=Sari Hardiyanto |date=2 Maret 2021 |title=Mutasi Virus Corona B.1.1.7 Sudah Masuk Indonesia |work=Kompas.com |url=https://www.kompas.com/tren/read/2021/03/02/131116365/mutasi-virus-corona-b117-sudah-masuk-indonesia-ini-informasi-lengkapnya?page=all |access-date=2 Maret 2021}}</ref>
== Lihat pula ==
Baris 134 ⟶ 790:
{{portal bar|Penyakit koronavirus 2019|Kedokteran|Virus}}
{{COVID-19
{{authority control}}
|