Peptida: Perbedaan antara revisi

[[Berkas:C-Peptide.svg|Kerangka Gambar Peptida|thumbjmpl|300px]]

'''Peptida''' merupakan molekul yang terbentuk dari dua atau lebih [[asam amino]]. Jika jumlah asam amino masih di bawah 50 molekul disebut peptida, namuntetapi jika lebih dari 50 molekul disebut dengan [[protein]]. Asam amino saling berikatan dengan ikatan peptida. [[Ikatan peptida]] terjadi jika [[atom]] [[nitrogen]] pada salah satu asam amino berikatan dengan [[gugus karboksil]] dari asam amino lain. Contoh dari peptida yang terbentuk dari [[alanina]] dan [[glisina]] adalah [[alaniglisina]], dimana penamaan tersebut menggambarkan pembentukan suatu ikatan peptida.<ref>{{Cite book|last=Fessenden, Ralph J., 1932-|date=1986|url=http://worldcat.org/oclc/16720613|title=Organic chemistry.|publisher=Wadsworth|isbn=0-534-05089-1|oclc=16720613}}</ref>

Peptida terdapat pada setiap [[makhluk hidup]] dan berperan pada beberapa aktivitas [[biokimia]]. Peptida dapat berupa [[enzim]], [[hormon]], [[antibiotik]], dan [[reseptor (biokimia)|reseptor]]. <ref name="Oleg">Oleg L. 2010. Welcome to Peptide Guide. [terhubung berkala]. http://www.peptideguide.com/index.html [16 Mei 2010].</ref>

== Sintesis Peptidapeptida ==

[[Berkas:Peptide synthesizer.jpg|''ABI Synergy peptide synthesizer''|thumbjmpl|300px|leftkiri]]

Sintesis peptida dilakukan dengan menggabungkan [[gugus karboksil]] salah satu asam amino dengan [[gugus amina]] dari asam amino yang lain. Sintesis peptida dimulai dari C-terminus (gugus karkobsilkarboksil) ke N-terminus (gugus amin), seperti yang terjadi secara alami pada organisme.

Untuk menghindari asam amino berikatan tidak terkendali, perlu dilakukan perlindungan dan kontrol terhadap ikatan peptida yang akan terjadis sehingga ikatan yang terbentuk sesuai dengan yang diinginkan. Langkah-langkah sintesis peptida adalah sebagai berikut: asam amino ditambahkan gugus proteksi. Kemudian asam amino yang diproteksi dilarutkan dalam pelarut seperti dimetyhlformamide (DMF) yand digabungkan dengan ''coupling reagents'' dipompa melalui kolom sintesis. Grup proteksi dihilangkan dari asam amino melalui reaksi deproteksi. Kemudian [[Pereaksi kimia|pereaksi]] deproteksi dihilangkan agar tercipta suasana penggabungan yang bersih. Coupling reagents, contohnya N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (DCCI), membantu pembentukan ikatan peptida. Setelah reaksi ''coupling'' terbentuk, ''coupling reagents'' dicuci untuk menciptakan suasana deproteksi yang bersih. Proses proteksi, deproteksi, dan coupling ini terus dilakukan berulang-ulang hingga tercipta peptida yang diinginkan.<ref name="Peptide">[Peptide Station]. 2006. Peptide Synthesis. [terhubung berkala]. http://www.peptidestationextremepeptides.com/blog/peptide-synthesis/ {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20140419012009/http://www.extremepeptides.com/blog/peptide-synthesis/ |date=2014-04-19 }} [16 Mei 2010].</ref>

== Kelas Peptidapeptida ==

=== Peptida non-Ribosomalribosomal ===

Peptida non-Ribosomal disintesis dengan kompleks enzim. Peptida ini terdapat pada organisme [[uniselularribosomal]], [[tanaman]],disintesis dandari [[fungi]]translasi mRNA. Pada peptidaPeptida ini terdapatberfungsi struktursebagai inti yang komplekshormon dan mengandungmolekul pengaturansignal yangpada berbeda-beda untuk melakukan manipulasi kimia untuk menghasilkanorganisme suatutingkat produktinggi. Secara umum, peptida ini berbentukmempunyai siklik, walaupun ada juga yang berbentukstrukstur [[linear]].<ref name="2006b2006a">[Peptide Station]. 2006b2006a. Non-ribosomalRibosomal peptides. [terhubung berkala]. http://www.peptidestation.com/nonribosomal-peptides/ {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20110525131258/http://www.peptidestation.com/ribosomal-peptides/ |date=2011-05-25 }} [16 Mei 2010].</ref>

=== Peptida Hasil Digesti (''Digested peptides'')non-ribosomal ===

Peptida non-ribosomal disintesis dengan kompleks enzim. Peptida ini terbentukterdapat daripada hasilorganisme [[proteolisisuniselular]], non-spesifik dalam[[tanaman]], siklusdan digesti[[fungi]]. PeptidaPada hasilpeptida digestiini secaraterdapat umumstruktur merupakaninti peptidayang ribosomal,kompleks akandan tetapimengandung tidakpengaturan dibentukyang dariberbeda-beda translasiuntuk mRNA.melakukan Peptidamanipulasi inikimia jugauntuk dapatmenghasilkan dibentuksuatu dariproduk. proteinSecara [yangumum, didigestipeptida denganini [[protease]]berbentuk spesifiksiklik, sepertiwalaupun digestiada trypsinjuga yang sering dilakukan sebelum ''mass spectrometry peptideberbentuk analysis''linear.<ref name="2006c2006b">[Peptide Station]. 2006c2006b. DigestedNon-ribosomal peptides. [terhubung berkala]. http://www.peptidestation.com/digestednon-ribosomal-peptides/ {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20110525131319/http://www.peptidestation.com/non-ribosomal-peptides/ |date=2011-05-25 }} [16 Mei 2010].</ref>

[[Kategori:BiologiPeptida| molekular]]