!Keterangan!! Gambar
|-
| rowspan="2"|[[kereta api Ambarawa Ekspres{{KA|Ambarawa Ekspres]]}} || rowspan="2"| {{sta|Semarang Poncol}} – {{sta|Surabaya Pasarturi}} || rowspan="2"|2 kali keberangkatan || Baja nirkarat || Surabaya Pasarturi || 1 April 2022 || Menggunakan rangkaian ''idle'' [[Keretakereta api Kertajaya]] || [[Berkas:MaharaniPremium.jpg|x50px]]
|-
| rowspan=3 | Baja ringan || rowspan=3 | Semarang Poncol || 4 Oktober 2016 || style="text-align:center;"|— || [[Berkas:KA_Ambarawa_Eks_BBT.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Tawang Jaya{{KA|Tawang Jaya]]}} || {{sta|Pasar Senen}} – Semarang–Semarang Poncol || 1 kali keberangkatan || 14 Mei 1984 || rowspan=2 | Semarang Poncol || style="text-align:center;"|— || [[Berkas:Kereta_api_Tawang_Jaya_TB.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Menoreh{{KA|Menoreh]]}} || Pasar Senen – Senen–{{sta|Semarang Tawang}} || 1 kali keberangkatan || 21 September 2012 || style="text-align:center;"|— || [[Berkas:Menoreh_Vintage.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Kertajaya{{KA|Kertajaya]]}} || rowspan="2"| Pasar Senen – SurabayaSenen–Surabaya Pasarturi || 1 kali keberangkatan || Baja nirkarat || rowspan="2"|Surabaya Pasarturi || 1993/1994 (?) || Jadwal sore || [[Berkas:Kereta_api_Kertajaya_TB.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Airlangga{{KA|Airlangga]]}} || 1 kali keberangkatan || rowspan=3 | Baja ringan || 1 Oktober 2021 || Jadwal siang || [[Berkas:PLB_7050_Airlangga_Melintas_Langsung_Tambun.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Majapahit{{KA|Majapahit]]}} || rowspan="2"| Pasar Senen – Senen–{{sta|Malang}} via {{sta|Semarang Tawang}} || 1 kali keberangkatan || Baja nirkarat || Malang || 21 September 2012 || Jadwal malam || [[Berkas:Majapahit_Pasarsenen.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Matarmaja{{KA|Matarmaja]]}} || 1 kali keberangkatan || Baja ringan || Solo Balapan || 28 September 1983 || Jadwal pagi, bertukar rangkaian dengan [[Kereta api Bengawan]] ||
|-
! colspan="8" | Lintas tengah Jawa
!Keterangan!! Gambar
|-
| [[kereta api Kutojaya Utara{{KA|Kutojaya Utara]]}} || {{sta|Jakarta Kota}}–{{sta|Kutoarjo}} || 1 kali keberangkatan || Baja nirkarat || Kutoarjo || 1977 || Penjenamaan dari Sawunggalih Ekonomi || [[Berkas:Kutojaya_Utara_TB.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Progo{{KA|Progo]]}} || {{sta|Pasar Senen}} – {{sta|Lempuyangan}} || 1 kali keberangkatan || rowspan=4| Baja ringan || Yogyakarta || 2002 || ||
|-
| [[kereta api Jaka Tingkir{{KA|Jaka Tingkir]]}} || rowspan="2"| Pasar Senen – Senen–{{sta|Purwosari}} || 1 kali keberangkatan || rowspan="2"|Solo Balapan || 8 Desember 2013 || style="text-align:center;"|— || [[Berkas:KA_Jaka_Tingkir.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Bengawan{{KA|Bengawan]]}} || 1 kali keberangkatan || 1994 || Bertukar rangkaian dengan [[Kereta api Matarmaja]] || [[Berkas:KA_Bengawan_TB.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Jayakarta{{KA|Jayakarta]]}} || Pasar Senen – Senen–{{sta|Surabaya Gubeng}} || 1 kali keberangkatan || Jakarta Kota || 28 September 2017 || Penjenamaan dari Gaya Baru Malam Selatan Premium || [[Berkas:Jayakarta_TB.jpg|x50px]]
|-
! colspan="8" | Lintas selatan Jawa
!Keterangan!! Gambar
|-
| [[kereta api Cikuray{{KA|Cikuray]]}} || {{sta|Pasar Senen}} – {{sta|Garut}} || 1 kali keberangkatan || rowspan=6 | Baja ringan || Jakarta Kota|| 25 Maret 2022 || – || [[Berkas:Cikuray_BKS.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Kutojaya Selatan{{KA|Kutojaya Selatan]]}} || {{sta|Kiaracondong}} – {{sta|Kutoarjo}} || 1 kali keberangkatan || Kutoarjo || style="text-align:center;"|— || style="text-align:center;"|— || [[Berkas:Kutojaya_Selatan_Cipeundeuy.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Serayu{{KA|Serayu]]}} || Pasar Senen – Senen–{{sta|Purwokerto}} (via {{sta|Kiaracondong}}) || 2 kali keberangkatan || Purwokerto || 15 November 1990 || Dahulu dikenal sebagai kereta api Cipuja dan Citrajaya || [[Berkas:CC_203_98_05_ft_KA_302_Serayu.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Sri Tanjung{{KA|Sri Tanjung]]}} || {{sta|Lempuyangan}} – {{sta|Ketapang|3=Banyuwangi}} (via {{sta|Surabaya Kota}}) || 1 kali keberangkatan || Ketapang || 1986 || style="text-align:center;"|—Dahulu bernama kereta api Argopuro || [[Berkas:SriTanjungbyRstazz.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Pasundan{{KA|Pasundan]]}} || Kiaracondong – Kiaracondong–{{sta|Surabaya Gubeng}} || 1 kali keberangkatan || rowspan=2 | Bandung || 1997 || Penerus Kereta api Badrasurya || [[Berkas:Pasundan_MN.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Kahuripan{{KA|Kahuripan]]}} || Kiaracondong – Kiaracondong–{{sta|Blitar}} || 1 kali keberangkatan || 26 Juli 1995 || style="text-align:center;"|— || [[Berkas:KA_Kahuripan_di_Jembatan_Gembongan.jpg|x50px]]
|-
! colspan="8" | Lintas timur Jawa
!Keterangan!! Gambar
|-
| [[kereta api Probowangi{{KA|Probowangi]]}} || {{sta|Surabaya Gubeng}} – {{sta|Ketapang|3=|Banyuwangi}} || 1 kali keberangkatan || rowspan=23 | Baja ringan || Sidotopo || style="text-align:center;"|— || style="text-align:center;"|—Dahulu bernama kereta api Blambangan || [[Berkas:Kereta_Api_Probowangi.jpg|x50px]]
|-
| [[kereta api Tawang Alun{{KA|Tawang Alun]]}} || {{sta|Malang Kotalama}} – Ketapang–Ketapang || 1 kali keberangkatan || Ketapang || 2002 || DahuluPenerus bernama Keretakereta api Rengganis || [[Berkas:Tawang_Alun_ML_2020.jpg|x50px]]
|-
! colspan="8" | Kereta api lokal dan aglomerasi
|