Teori kuman penyakit: Perbedaan antara revisi

[[Berkas:Cholera_bacteria_SEMCholera bacteria SEM.jpg|jmpl|Gambar yang dihasilkan [[mikroskop elektron]] untuk bakteri ''[[Vibrio cholerae]]''. Bakteri ini menyebabkan penyakit kolera.]]

Perkembangan pencarian asal muasal penyakit sudah dimulai dari abad kuno, seperti dari teori miasma yang menjadi teori predominan mengenai penyebaran penyakit yang kemudian ditinggalkan. Kemudian, berkembang di beragam kebudayaan seperti Israel Kuno, Yunani dan Roma, India Kuno, serta penemuan beberapa tokoh dipada abad pertengahan dan periode modern awal.

[[Berkas:Cholera_artCholera art.jpg|jmpl|Penggambaran wabah kolera oleh [[Robert Seymour (ilustrator)|Robert Seymour]] yang menggambarkan penyebaran penyakit melalui udara beracun.]]

Teori miasma merupakan sebuah teori kedokteran kuno yang menyatakan bahwa beberapa penyakit disebabkan oleh ''miasma''   (μίασμα atau polusi), udara buruk (atau biasa disebut ''night air)'' yang dinilai berbahaya. Udara buruk tersebut diduga berasal dari materi organik yang membusuk.<ref>{{cite book |last1=John |first1=M. |title=A Dictionary of Public Health |url=https://archive.org/details/dictionaryofpubl0000last |date=2007 |publisher=Oxford University Press |isbn=978-0-19-516090-1}}</ref> Teori ini sebetulnya sudah banyak disampaikan oleh Hippokrates pada Abad ke-4 SM.<ref>{{cite book |last1=van der Eijk |first1=P. J. |title=Hippocrates in Context: Papers Read at the XIth International Hippocrates Colloquium |date=2005 |isbn=9789004377271 |page=17}}</ref> Hippokrates berpendapat bahwa miasma terdapat di dalam udara dan ditransmisikan melalui pernapasan, bukan dengan sentuhan. Akan tetapi, teori ini baru populer dan banyak diyakini orang ketika wabah kolera melanda Britania Raya pada Abad ke-19. Meskipun teori miasma saat ini sudah tergantikan oleh teori yang lebih sahih, teori ini telah memberikan banyak perubahan dalam bidang infrastruktur kota sejak beberapa abad yang lalu.

Jensen Carr, seorang asisten profesor arsitektur, urbanisme, dan lanskap di Northeastern University berpendapat bahwa ketakutan akan miasma memicu terciptanya lingkungan yang lebih baik.<ref>{{cite web |last1=Widyaningrum |first1=Gita Laras |title=Saat Wabah Kolera Picu Pemerintah untuk Membangun Ruang Terbuka Hijau |url=https://nationalgeographic.grid.id/read/132167476/saat-wabah-kolera-picu-pemerintah-untuk-membangun-ruang-terbuka-hijau?page=al |website=National Gepgraphic Indonesia |access-date=20 Oktober 2021}}</ref> Carr berpendapat bahwa pemasangan sistem limbah bawah tanah diharapkan dapat menghilangkan penumpukan sampah sebagai sumber miasma. Dalam bukunya, ''The Topography of Wellness: Health and the American Urban Landscape'', Carr menyatakan bahwa saluran air minum dan air kotor akan lebih mudah dipasang jika terdapat sebuah jalanan aspal yang panjang. Pengaspalan wilayah berbatu ini membuat   terjadinya perluasan industri dan perumahan. Terdapat tokoh lain yang sejalan dengan Carr, yaitu, Frederick Law Olmsted, seorang arsitek lanskap yang anaknya meninggal akibat penyakit kolera. Olmsted memperjuangkan adanya ruang terbuka hijau dalam kota sebagai sumber udara segar dan penyaring udara kotor. Omsted berpendapat bahwa dedaunan dan sinar matahari dapat mendesinfeksi kota. Bersama Calvert Vaux, Olmsted membangun Central Park dan ratusan taman umum dan tempat rekreasi di Boston, Buffalo, Chicago, dan Detroit.

Baru pada abad ke-6, filsuf pra-Sokrates seperti [[Pythagoras]], Alcmaeon, dan [[Empedokles]] menyatakan bahwa lingkungan memainkan peran yang penting dalam menyebabkan timbulnya suatu penyakit. Pada abad ini juga terdapat sebuah wabah yang bernama [[Wabah Yustinianus]]. Wabah ini menginspirasi ilmuwan untuk mencari penyebabnya.<ref name=":1">{{Cite journal|last=Karamanou|first=Marianna|last2=Panayiotakopoulos|first2=George|last3=Tsoucalas|first3=Gregory|last4=Kousoulis|first4=Antonis|last5=Androutsos|first5=George|date=2012-03-01|title=From miasmas to germs: A historical approach to theories of infectious disease transmission|url=https://www.researchgate.net/publication/223957556_From_miasmas_to_germs_A_historical_approach_to_theories_of_infectious_disease_transmission|journal=Le infezioni in medicina : rivista periodica di eziologia, epidemiologia, diagnostica, clinica e terapia delle patologie infettive|volume=20|pages=58–62}}</ref> Sebelum munculnya teori miasma, terdapat satu teori pendahulu yaitu Teori Hippokrates yang dibuat oleh [[Hippokrates]]. Teori ini dimuat dalam buku karyanya sendiri yang berjudul "''On Airs, Waters, and Places''". Dalam teorinya, Hippokrates menyebutkan bahwa penyakit dapat disebabkan oleh dua hal, yakni karena adanya kontak dengan jasad hidup dan karena pengaruh lingkungan internal dan eksternal seseorang. <ref name=":2">{{Cite book|last=Irwan|first=Irwan|date=1 Maret 2017|title=Epidemologi Penyakit Menular|location=Yogyakarta|publisher=CV. ABSOLUTE MEDIA|isbn=978-602-1083-64-2|pages=2|url-status=live}}</ref> Karya Hippokrates menjadi penanda mulainya kedokteran barat memahami penyakit sebagai suatu peristiwa yang alami daripada supernatural serta dokter diharapkan untuk mencari penyebab fisis dari suatu penyakit seperti udara, air, dan tempat, juga mengenai hubungan dengan iklim, diet, dan kondisi tempat tinggal pengidap penyakit.<ref name=":15" /><ref name=":14">{{Cite web|title=history of medicine {{!}} History & Facts|url=https://www.britannica.com/science/history-of-medicine|website=Encyclopedia Britannica|language=en|access-date=2021-10-18}}</ref><ref name=":15" />

Perkembangan pesat dari teori kuman penyakit tidak telepas dari perkembangan teknologi mikroskop. [[Mikroskop]] dengan memanfaatkan pembiasan cahaya yang melewati lensa, dapat membuat bayangan benda-benda kecil menjadi berkali-kali lipat ukuran aslinya. Oleh karena itu, objek-objek kecil yang tidak bisa dilihat dengan mata telanjang seperti keberadaan bakteri akhirnya akhirnya dapat diobservasi pertama kali oleh [[Antony van Leeuwenhoek|Anton van Leeuwenhoek]] pada 1676.<ref>{{Cite web|title=The discovery of bacteria {{!}} American Association for the Advancement of Science|url=https://www.aaas.org/discovery-bacteria|website=www.aaas.org|language=en|access-date=2021-10-18}}</ref> Pada akhirnya, dipada abad-19 teori kuman penyakit ini berkembang dan dikenal oleh masyarakat.<ref name=":3" />

Abad ke-19 ini menjadi era kejayaan bagi teori kuman penyakit karena teori ini telah dikenal oleh masyarakat luas. Sejak saat itu, masyarakat percaya bahwa beberapa penyakit yang menyerang manusia selama berabad-abad tenyata disebabkan oleh invasi mikroorganisme ke dalam tubuh manusia. Teori kuman penyakit ini memberikan dampak yang sangat besar bagi perkembangan [[Epidemiologi|epidemologi]] penyakit infeksi. Berkat teori ini juga, banyak penyakit yang akhirnya dapat dicegah dan juga disembuhkan. Teori kuman penyakit ini mengarahkan para ilmuwan untuk menghasilkan obat-obatan antibiotik dan antimikroba seperti [[vaksin]], [[sterilisasi]], [[preurisasi]], dan [[Kesehatan masyarakat|program sanitasi publik]]. Teori ini terus berkembang hingga ke level molekul pada abad ke-20. <ref name=":2" />

[[Hukum Musa]] atau Taurat Musa (1000 SM) merupakan salah satu bukti pemikiran-pemikiran awal tentangyang membahas mengenai penularan dalam penyebaran penyakit, yang bertentangan dengan tradisi medis klasik dan tulisan-tulisan oleh Hippokrates<ref>{{Cite book|last=McGrew|first=Roderick|date=1985|title=Encyclopedia of medical history|location=London|publisher=Macmillan|url-status=live}}</ref>. Dalam Hukum Musa, hal ini disebut dengan ''contagium animatum'' atau penyebaran penyakit yang tak kasat mata melalui kontak fisik yang berdekatan.<ref>{{Cite web|last=Gillen|first=Dr. Alan L.|last2=Oliver|first2=Douglas|date=2009|title=Creation and the Germ Theory|url=https://answersingenesis.org/biology/microbiology/creation-and-the-germ-theory/|website=Answers in Genesis web site|access-date=17 Oktober 2021}}</ref>. Untuk mencegah penyebaran penyakit tersebut, Hukum Musa membahas tentang pentingnya memberlakukan peraturan kebersihan dalam masyarakat, menjaga kesehatan reproduksi, dan memerintahkan karantina bagi penderita kusta atau penyakit kelamin.<ref>{{Cite book|last=McGrew|first=Roderick|date=1985|title=Encyclopedia of medical history|url=https://archive.org/details/encyclopediaofme0000mcgr_u2p1|location=London|publisher=Macmillan|url-status=live}}</ref> Termasuk di antara bentuk-bentuk tanggung jawab kesehatan individual dan masyarakat adalah kebersihan makanan, tempat tinggal atau rumah, waktu untuk istirahat, pembuangan sampah yang benar, dan akses air bersih.<ref name=":8">{{Cite journal|last=Tulchinsky|first=Theodore|last2=Varavikova|first2=Elena|date=2014|title=A History of Public Health|journal=The New Public Health}}</ref>. Masyarakat Israel Kuno juga diperintahkan untuk mencuci tangan dan benda lain sebagai bentuk pemurnian. Selain itu, terdapat juga larangan untuk memakan daging binatang yang sakit atau kotor, serta tata cara penyembelihan binatang agar bisa disimpan lebih lama.

Menurut Tafsir [[Talmud]] mengenai hukum Alkitab, terdapat dua prinsip yang membahas tentang kebersihan dan kesehatan manusia. Prinsip yang pertama adalah ''Pikuah Nefesh'' atau kesucian hidup.<ref name=":8" />. Prinsip ini menyebutkan bahwa bahwa penyelamatan satu nyawa manusia dianggap sebagai menyelamatkan seluruh dunia. Lalu prinsip yang kedua adalah ''Tikkun Olam,'' yang menekankan tentang pentingnya peningkatan kualitas hidup seluruh makhluk hidup di dunia.<ref name=":8" />.

Pada abad ke-5 SM, [[Thukidides|Thucydides]] ([[460 SM]] – [[395 SM]]), yang merupakan sejarawan Yunani, mengatakan bahwa seseorang yang sering berinteraksi dengan orang yang sakit akan berpotensi tertular penyakit tersebut. Dengan kata lain, suatu penyakit yang diderita seseorang orang bisa menular jika terjadi interaksi atau kontak dengan orang lain. Beliau menuliskan pandangannya dalam catatannya tentang [[wabah Athena]] dan beliau adalah orang pertama yang menuliskan pandangan itu.<ref name=":5" /> <ref name=":6" />

Wabah Pes pertama ([[Wabah Yustinianus]]) terjadi di daerah Romawi pada tahun 542 - 544. Wabah ini disebabkan oleh bakteri ''[[Yersinia pestis]]'' yang berasal dari sisa era neolitik akhir 5000 sampai 6000 tahun lalu.<ref>{{Cite journal|last=Rascovan|first=Nicolás|last2=Sjögren|first2=Karl-Göran|last3=Kristiansen|first3=Kristian|last4=Nielsen|first4=Rasmus|last5=Willerslev|first5=Eske|last6=Desnues|first6=Christelle|last7=Rasmussen|first7=Simon|date=2019-01-10|title=Emergence and Spread of Basal Lineages of Yersinia pestis during the Neolithic Decline|url=https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(18)31464-8|journal=Cell|language=English|volume=176|issue=1|pages=295–305.e10|doi=10.1016/j.cell.2018.11.005|issn=0092-8674|pmid=30528431}}</ref> Bakteri ini dapat menular melalui kutu tikus (''[[Xenopsylla cheopis]])''. Wabah ini tersebar pertama kali di kota-kota Mediterania tenggara dan Eropa, dan menyebar cepat ke negara [[Konstantinopel]] (ibukota kekaisaran Romawi). Setelah itu wabah ini terus menyebar ke negara-negara mediterania selama 250 tahun, dan wabah ini menghilang pada tahun 750.<ref>{{Cite journal|last=Sarris|first=Peter|date=2002-08|title=The Justinianic plague: origins and effects|url=https://www.cambridge.org/core/journals/continuity-and-change/article/abs/justinianic-plague-origins-and-effects/F48D7B45421836E3F25613CF68EE6F30|journal=Continuity and Change|language=en|volume=17|issue=2|pages=169–182|doi=10.1017/S0268416002004137|issn=1469-218X}}</ref><ref name="Sabbatani 125–139">{{Cite journal|last=Sabbatani|first=Sergio|last2=Manfredi|first2=Roberto|last3=Fiorino|first3=Sirio|date=2012-06|title=[The Justinian plague (part one)]|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22767313/|journal=Le Infezioni in Medicina|volume=20|issue=2|pages=125–139|issn=1124-9390|pmid=22767313}}</ref>

Wabah Yustinianus juga menyebabkan efek makro pada berbagai negara. Negara yang terkena dampak dari wabah pes ini mengalami kelaparan dan inflasi. Kelaparan ini disebabkan oleh kurangnya pekerja sektor pertanian akibat kematian wabah dan pemulihan dari gejala wabah yang berkepanjangan. Wabah juga diduga menjadi salah satu penyebab runtuhnya kerajaan Romawi.<ref>{{Cite web|last=Wazer|first=Caroline|date=2016-03-16|title=The Plagues That Might Have Brought Down the Roman Empire|url=https://www.theatlantic.com/science/archive/2016/03/plagues-roman-empire/473862/|website=The Atlantic|language=en|access-date=2021-10-18}}</ref> Hal ini dibuktikan oleh McCormick dengan ditemukannya DNA ''Yersinia pestis'', bakteri penular wabah Yustinianus, pada tulang bekas mayat dari kerajaan Romawi yang dikubur di pemakaman Aschheim, yaitu tempat pemakaman penduduk kota kecil pada saat itu.<ref>{{Cite journal|lastname="Sabbatani|first=Sergio|last2=Manfredi|first2=Roberto|last3=Fiorino|first3=Sirio|date=2012-06|title=[The Justinian plague (part one)]|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22767313/|journal=Le Infezioni in Medicina|volume=20|issue=2|pages=125–139|issn=1124-9390|pmid=22767313}}<"/ref><ref>{{Cite book|date=2006|url=https://www.cambridge.org/core/books/plague-and-the-end-of-antiquity/84893FF179E8D8521E2F65F838D0731D|title=Plague and the End of Antiquity: The Pandemic of 541–750|location=Cambridge|publisher=Cambridge University Press|isbn=978-0-521-84639-4|editor-last=Little|editor-first=Lester K.}}</ref>

[[Sushruta]] merupakan orang pertama yang tercatat dalam sejarah yang menyarankan sterilisasi ruang operasi menggunakan asap mustard putih (''Brassica hirta''). Sterilisasi tersebut dilakukan dengan cara menyalakan dupa di ruang operasi. Metode tersebut memprediksi metode sterilisasi udara, jauh sebelum diketahuinya eksistensi kuman atau pun teori kuman penyakit itu sendiri .<ref>{{Cite journal|last=Raveenthiran|first=Venkatachalam|date=2011-11-01|title=Knowledge of ancient Hindu surgeons on Hirschsprung disease: evidence from Sushruta Samhita of circa 1200-600 bc|url=https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022346811006269|journal=Journal of Pediatric Surgery|language=en|volume=46|issue=11|pages=2204–2208|doi=10.1016/j.jpedsurg.2011.07.007|issn=0022-3468}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Muthu|first=C.|date=1913-05|title=A Short Review of the History of Ancient Hindu Medicine.|url=http://journals.sagepub.com/doi/10.1177/003591571300601515|journal=Proceedings of the Royal Society of Medicine|language=en|volume=6|issue=Sect_Hist_Med|pages=177–190|doi=10.1177/003591571300601515|issn=0035-9157}}</ref>. Selain sterilisasi dan keperluan medis lainnya, penggunaan dupa pada era India Kuno juga dipercaya memberikan efek penyembuhan .<ref>{{Cite journal|last=Prasad|first=Goli Penchala|last2=Pratap|first2=G. Penchala|last3=Neelima|first3=M.|last4=Satyanrayanashastry|first4=Vd Pammi|date=2008|title=Historical perspective on the usage of perfumes and scented Articles in ancient Indian literatures|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3336354/|journal=Ancient Science of Life|volume=28|issue=2|pages=33–39|issn=0257-7941|pmc=3336354|pmid=22557310}}</ref>.

Francesco Redi beberapa kali melakukan eksperimen untuk membuktikan generasi spontan itu tidak logis. Salah satu eksperimennya yang populer adalah membiarkan mayat ular Aesculapius (''Coluber longissimus'') yang masih segar membusuk di sebuah kotak. Tidak butuh waktu yang lama, muncul ulat-ulat kecil yang menghabiskan daging ular tersebut hingga hanya tersisa tulang dan kemudian ulat-ulat itu menghilang. Redi mencoba untuk melakukan eksperimennya kembali, namun kali ini dengan menutup kotak tersebut agar ulat-ulat tersebut tidak menghilang. Lalu, di akhir eksperimen ia menemukan lalat keluar dari kotak itu. Ia kembali melakukan eksperimen itu menggunakan daging hewan lainnya dan hasilnya tetap sama. Dari eksperimen itu ia menemukan bahwa lalat dewasa menjatuhkan telurnya pada daging mentah, kemudian dari telur itulah lahir ulat-ulat yang muncul di daging. Menurut Redi, daging, tanaman, dan bangkai lainnya berperan sebagai sarang bagi telur, anakan, atau segala bentuk benih lainnya pada saat musim berkawin.<ref name="Redi 1687">{{Cite book|last=Redi|first=Francesco|last2=Raillard|first2=Giacomo|date=1687|url=http://dx.doi.org/10.5962/bhl.title.152348|title=Esperienze intorno alla generazione degl'insetti /|location=Napoli :|publisher=Nella stamperia di Giacomo Raillard,}}</ref>

Pada tahun 1668, Redi melakukan eksperimen infestasi lalat melalui tiga buah toples. Masing-masing toples diisi sepotong daging dan telur. Satu toples disegel rapat, satu toples ditutup menggunakan kain, dan toples terakhir tidak ditutup atau disegel. Eksperimen ini dilakukan Redi selama beberapa hari. Dari eksperimen tersebut, ia menemukan bahwa daging yang ditempatkan di dalam toples terbuka penuh dengan belatung. Hal serupa terjadi juga pada daging yang ditempatkan pada toples yang hanya ditutup kain karena lalat menaruh benihnya atas permukaan kain dan menyebabkan kain terinfestasi oleh belatung. Sementara, toples yang disegel tidak berbelatung sama sekali. Dari hasil tersebut ditemukan bahwa belatung hanya dapat ditemukan di permukaan yang dapat dijangkau oleh lalat. Redi berpendapat selama buah-buahan, sayur-sayuran, dan daging, baik dalam keadaan mentah atau matang, jika disimpan di tempat yang tertutup rapat, maka tidak akan terinfestasi oleh larva atau belatung.<ref>{{Cite book|lastname="Redi|first=Francesco|last2=Raillard|first2=Giacomo|date= 1687|url=http://dx.doi.org/10.5962/bhl.title.152348|title=Esperienze intorno alla generazione degl'insetti /|location=Napoli :|publisher=Nella stamperia di Giacomo Raillard,}}<"/ref> Eksperimen menjelaskan bahwa larva tidak muncul pada hewan mati, kecuali hewan hidup lainnya tidak menaruh benih di dalamnya. Peletakkan benih tersebut dapat dicegah secara efektif menggunakan tempat yang disegel ketat. Berdasarkan eksperimen itu, Redi berhasil menyimpulkan bahwa belatung tidak muncul secara spontan dari daging dan generasi spontan terbukti tidak logis.<ref>{{Cite journal|last=GOTTDENKER|first=PAULA|date=1979|title=FRANCESCO REDI AND THE FLY EXPERIMENTS|url=https://www.jstor.org/stable/44450950|journal=Bulletin of the History of Medicine|volume=53|issue=4|pages=575–592|issn=0007-5140}}</ref>

[[Antony van Leeuwenhoek|Anton van Leeuwenhoek]] secara universal diakui sebagai bapak [[mikrobiologi]]. Dia merupakan seorang penjajak dalam ilmu mikrobiologi, pada tahun 1670-an. Dia berhasil menemukan [[protista]] dan [[bakteri]].<ref>{{Cite journal|last=Leewenhoeck|first=Anton Van|date=1667|title=Observation, communicated to the publisher|journal=Phil. Trans.|volume=12|pages=821– 831|doi=10.1098/rstl.1677.0003}}</ref> Ia adalah orang yang pertama kali melihat dunia ‘makhluk hidup’ yang tak terbayangkan dan yang pertama kali berpikir untuk bisa melihat hal tersebut menggunakan mikroskop berlensa tunggal sederhana. Van Leeuwenhoek dikatakan sebagai orang pertama yang melihat dan menggambarkan bakteri, tanaman khamir/ragi, kehidupan yang mengambang di dalam setetes air, serta sirkulasi sel darah di dalam pembuluh kapiler. Kata "bakteri" pada waktu itu belum ada dan ia menamakan organisme mikroskopik itu sebagai ''animalcule'', yang berarti "binatang kecil". Ia mengisolasi berbagai animalcule itu dari berbagai sumber, seperti air hujan, air sumur dan kolam, serta mulut dan usus manusia.  van Leeuwenhoek sempat mendapatkan keraguan dan cemoohan dari ilmuwan lain karena latar belakangnya yang tidak bersekolah serta metodenya yang tergolong baru dan sulit dipercaya. Ia tetap melaporkan penemuannya dalam lebih dari 100 surat kepada Royal Society of England dan Akademi Prancis. Laporan pertama Leewuwenhoek kepada Royal Society pada tahun 1673 menggambarkan bagian mulut lebah, kutu, dan jamur. Ia mempelajari struktur sel tumbuhan dan kristal, serta struktur sel manusia seperti darah, otot, kulit, gigi, dan rambut. Ia bahkan mengikis plak dari sela-sela giginya untuk mengamati bakteri di sana, yang ditemukan Leewenhoek, mati setelah meminum kopi. Sejak berhasil diverifikasi oleh para filsuf alam dari Royal Society, sains masuk ke dalam aturan dasar baru yang masih menggambarkan biologi masa kini. Penemuan van Leeuwenhoek ditransmisikan secara langsung selama berabad-abad kepada para ahli biologi saat ini. Ahli mikrobiologi dan filogenetik terus berdebat tentang sifat hewan kecil van Leeuwenhoek.<ref>{{Cite journal|last=Lane|first=Nick|date=April 19, 2015|title="The Unseen World: Reflections on Leeuwenhoek (1677) 'Concerning Litlle Animals."|journal=Philosopical Transactions of the Royal Society of London Series B|volume=BIological Sciences 370 (1666)|doi=20140344}}</ref>

Selama tahun 1714 hingga 1721, Richard Bradley, yang merupakan Profesor Botani pertama di Universitas Cambridge, mengajukan teori yang unik tentang penyebab penyakit menular pada tumbuhan dan hewan serta wabah manusia. Teorinya berasal dari studi eksperimental tanaman dan penyakit dari pengamatan mikroskopis ''animalcule'' di lingkungan alami dan buatan yang berbeda. Dia mengemukakan bahwa terdapat "serangga" yang hidup dan berkembang biak pada kondisi yang sesuai dan bahwa penyakit menular pada tanaman disebabkan oleh "serangga" tersebut, yang hanya tampak ketika dilihat dengan mikroskop.<ref>{{Cite book|last=Santer|first=Melvin|date=2009|title=Richard Bradley: A Unified, Living Agent Theory of the Cause of Infectious Diseases of Plants, Animals, and Humans in the First Decades of the 18th Century|publisher=in Perspectives in Biology and Medicine|pages=566–578|url-status=live}}</ref>   Karena ada kesamaan struktural dan fungsional antara tumbuhan dan hewan, Bradley menyimpulkan bahwa organisme mikroskopis juga menyebabkan penyakit menular pada manusia dan hewan. Namun, kala itu teori penyakit menular tidak diterima oleh masyarakat ilmiah kontemporer. Sementara itu, pada tahun 1762, seorang dokter Austria, [[Marcus Antonius von Plenciz]], menerbitkan buku berjudul ''Opera medico-physica''. Buku ini menggambarkan teori penyebaran penyakit. Di dalamnya dikatakan bahwa ''animalcule'' yang terdapat di tanah dan udara merupakan penyebab penyakit tertentu. Von Plenciz membuat pembedaan antara penyakit yang dapat menular dan mewabah, seperti campak dan disenteri, dengan penyakit yang menular tetapi tidak mewabah, seperti rabies dan kusta.<ref>{{Cite journal|last=Winslow|first=Charles-Edward Amory|date=1967|title=Conquest of Epidemic Disease: A Chapter in the History of Ideas. Hafner Publishing Co Ltd|url=https://archive.org/details/conquestofepidem0000wins_w2c0|journal=Hadner Publishing Co Ltd|issue=ISBN 978-0028548807}}</ref>  Pada saat itu, pendapat medis yang diterima adalah bahwa penyakit itu disebarkan oleh apa yang dikenal sebagai miasma, uap atau kabut beracun, berbau busuk dan terdiri dari partikel-partikel dari bahan-bahan yang membusuk.<ref>{{Cite web|last=Fone|first=Martin|date=14 Maret 2020|title=Curious Questions: Who first discovered that washing your hands stops the spread of disease?, Country Life|url=https://www.countrylife.co.uk/comment-opinion/curious-questions-who-first-discovered-that-washing-your-hands-stops-the-spread-of-disease-212879|website=Country Life|access-date=18 Oktober 2021}}</ref> Dia juga mampu membuktikan bahwa bakteri adalah penyebab sepsis fatal yang telah diidentifikasi oleh [[Ignaz Semmelweis]]. Pembuktian ini membuka jalan bagi pengembangan vaksin dan membuka jalan bagi penemuan Fleming yang mengarah pada pengembangan antibiotik.<ref>{{Cite web|last=Grenville|first=Andrew|date=9 April 2020|title=Social Distancing and Germ Theory”: How Good Ideas Spread.|url=https://www.marugroup.net/insights/blog/social-distancing-germ-theory-good-ideas-spread,|website=Maru Group Ltd|access-date=18 Oktober 2021}}{{Pranala mati|date=Januari 2023 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}</ref> Meskipun demikian, teori yang dikemukakan oleh von Plenciz tidak diterima oleh komunitas medis.

[[:en:Agostino_BassiAgostino Bassi|Agostino Bassi]] lahir pada tanggal 25 September 1773 di [[Mairago]], Provinsi Lodi, Italia. Ia adalah seorang ahli [[entomologi]] dan menjadi orang pertama yang menuangkan ide etiologi tentang genesis mikrobiologi penyakit dalam sebuah penelitian. <ref name="Mazzarello">{{Cite journal|last=Mazzarello|first=Paolo|last2=Garbarino|first2=Carla|last3=Cani|first3=Valentina|date=2013-09-01|title=Bassi, Agostino|url=https://www.researchgate.net/publication/283483135_Bassi_Agostino|journal=eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester|doi=10.1002/9780470015902.a0025074}}</ref>

Pada tahun 1807, ia mulai melakukan penelitian terhadap penyakit di ulat sutra, ''mal de segno'', yang mulai tahun 1800-an merusak peternakan ulat sutra dan menyebabkan kerugian ekonomi yang serius di Italia dan Prancis. [[Ngengat sutra|Ulat sutra]] (''Bombyx mori'') yang sakit tidak menunjukkan tanda-tanda sakit sampai mereka hampir mati. Pada titik ini mereka berhenti makan dan gerakan tubuh melambat. Setelah mati, tubuh mereka yang lembut akan menjadi keras, kering, rapuh seperti kaca dan dilapisi bubuk putih. Terkadang, tanda-tanda kematian ini akan muncul pada ulat sutra yang sudah dekat dengan kematiannya. Oleh karena itu, penyakit ini disebut dengan ''sign disease'' (penyakit tanda). Selain itu, karena adanya bubuk putih yang menyelimuti ulat sutra yang mati, disebut juga ''calcinaccio'' (''calce'' berarti kapur).<ref>{{Cite journal|lastname="Mazzarello|first=Paolo|last2=Garbarino|first2=Carla|last3=Cani|first3=Valentina|date=2013-09-01|title=Bassi, Agostino|url=https://www.researchgate.net/publication/283483135_Bassi_Agostino|journal=eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester|doi=10.1002/9780470015902.a0025074}}<"/ref>

Ia kemudian melakukan beberapa eksperimen untuk mereproduksi penyakit calcinaccio berdasarkan asumsi dari pembudidaya bahwa penyakit ini muncul secara spontan melalui faktor lingkungan, seperti: makanan, suasana, dan metode pembudidayaan.<ref>{{Cite journal|last=Porter|first=J R|date=1973-09|title=Agostino Bassi bicentennial (1773-1973)|url=https://journals.asm.org/doi/10.1128/br.37.3.284-288.1973|journal=Bacteriological Reviews|language=en|volume=37|issue=3|pages=284–288|doi=10.1128/br.37.3.284-288.1973|issn=0005-3678|access-date=2021-10-18|archive-date=2021-10-20|archive-url=https://web.archive.org/web/20211020125641/https://journals.asm.org/doi/10.1128/br.37.3.284-288.1973|dead-url=yes}}</ref> Setelah memberikan berbagai zat beracun, mineral, [[Korosif|zat korosif]] dan [[Natrium hidroksida|kaustik]], tidak ada satupun yang membuahkan hasil. Pada akhirnya, ia berhasil mereproduksi penyakit yang mirip dengan calcinaccio dengan memasukkan ulat sutra ke dalam kantong kertas dari cerobong asap. Namun, Agostino menyadari bahwa ulat sutra ini tidak mengidap penyakit yang dimaksud.

Agostino kemudian mulai mengeksplorasi hipotesis baru sebagai alternatif hipotesis bahwa penyakit ini terjadi secara spontan melalui lingkungan. Hingga akhirnya, sebelum tahun 1826, para [[naturalis]] menyimpulkan bahwa penyebab penyakit adalah organisme hidup, vegetatif, dan merupakan tanaman dari keluarga [[Kriptogamae|kriptogam]], jamur parasit. <ref>{{Cite journal|lastname="Mazzarello|first=Paolo|last2=Garbarino|first2=Carla|last3=Cani|first3=Valentina|date=2013-09-01|title=Bassi, Agostino|url=https:"//www.researchgate.net/publication/283483135_Bassi_Agostino|journal=eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester|doi=10.1002/9780470015902.a0025074}}</ref>

Agostino merumuskan sebuah siklus penting, yaitu penyakit calcinaccio ini ditularkan dari satu pembibitan ulat sutra ke pembibitan ulat sutra lainnya. Begitu pula dari satu tempat budidaya ulat sutra ke yang lainnya hingga menyebar ke seluruh negeri. Metode ini sama dengan penyakit menular dalam tubuh manusia yang dapat menyebar secara bertahap. Dinamika penularan calcinaccio atau ''sign disease'' (penyakit tanda) ini dapat mencerminkan penularan penyakit secara umum, sehingga kesimpulan dari penelitian ini memperoleh validasi umum. <ref>{{Cite journal|lastname="Mazzarello|first=Paolo|last2=Garbarino|first2=Carla|last3=Cani|first3=Valentina|date=2013-09-01|title=Bassi, Agostino|url=https:"//www.researchgate.net/publication/283483135_Bassi_Agostino|journal=eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester|doi=10.1002/9780470015902.a0025074}}</ref>

Pada tahun 1835, Agostino Bassi menuliskan penemuannya dalam buku ''Del mal del segno, calcinaccio o moscardino'' (“''The Disease of the Sign, Calcinaccio or Muscardine''”). Penemuan Agostino merupakan terobosan dalam sejarah ilmu alam dan kedokteran. Ini adalah pembuktian pertama bahwa penyakit disebabkan oleh [[mikroorganisme]] dan memiliki rantai penularan. Hal ini menjadi pelopor teori kuman penyakit oleh [[Robert Koch]] dan [[Louis Pasteur]]. <ref>{{Cite web|title=Agostino Bassi {{!}} Italian bacteriologist|url=https://www.britannica.com/biography/Agostino-Bassi|website=Encyclopedia Britannica|language=en|access-date=2021-10-18}}</ref>

[[Berkas:Ignaz Semmelweis Ignác 1857 aquarelleCanzi Ágost.jpg|kiri|jmpl|[[Ignaz Semmelweis]] awalnya tidak dipercaya ketika ia menyarankan dokter mencuci tangan sebelum membantu persalinan]]

[[Ignaz Semmelweis]] lahir pada tanggal 1 Juli 1818 di Taban, Hungaria. Ignaz Semmelweis dikenal sebagai “Bapak Pengendalian Infeksi”.<ref name=":4">{{Cite journal|last=Best|first=M|date=2004-06-01|title=Ignaz Semmelweis and the birth of infection control|url=https://qualitysafety.bmj.com/lookup/doi/10.1136/qshc.2004.010918|journal=Quality and Safety in Health Care|language=en|volume=13|issue=3|pages=233–234|doi=10.1136/qshc.2004.010918|issn=1475-3898|pmc=PMC1743827|pmid=15175497}}</ref> Ia adalah seorang dokter kandungan dari [[HongariaHungaria]] yang bekerja di [[Rumah Sakit Umum Wina]] (''Allgemeines Krankenhaus'') pada tahun 1847. Rumah Sakit Umum Wina memiliki dua klinik kebidanan. Di klinik pertama terdapat ahli bedah, dokter, dan mahasiswa kedokteran dan Ignaz bekerja di klinik pertama sebagai ahli bedah, dokter, dan instruktur mahasiswa. Sedangkan, di klinik dua yang bekerja adalah para bidan. Selama bekerja di rumah sakit itu, Ignaz mengamati bahwa di klinik kedua terdapat 10 kali lebih sedikit kematian akibat demam puerperal dibandingkan dengan klinik pertama.<ref>{{Cite journal|last=E., & D|first=Dastur Adi & Tank, P|date=2008|title=Ignaz Philipp Semmelweis and Puerperal Fever|journal=https://jogi.co.in/may_jun_2008/02_milestone_ignaz_philipp.pdf}}</ref> Karena reputasi mengenai klinik pertama yang kurang baik, para pasien memohon dan meminta untuk dimasukkan ke klinik kedua. Ignaz lalu mencatat bahwa terdapat angka kematian ibu yang sangat besar akibat [[demam puerperal]], terutama di klinik pertama.

Dengan menyatakan bahwa demam puerperal adalah penyakit menular dan zat dari otopsi dapat bercampur dengan tubuh ibu. Lalu, Ignaz meminta para dokter mencuci tangan dengan air limun yang diklorinasi sebelum membantu ibu hamil. Ia kemudian mencatat bahwa terdapat penurunan drastis dan tiba-tiba pada angka kematian ibu,  dari 18% menjadi 2,2% dalam jangka waktu satu tahun. Meskipun memiliki bukti ini, ia dan teorinya ditolak oleh ilmu kedokteran pada waktu itu. Atasannya, Professor Klein, menolak hipotesisnya. Klein berpendapat bahwa penurunan angka kematian disebabkan sistem ventilasi baru di rumah sakit.<ref name=":4" />

A Scientifc Biography of Ignaz Semmelweis|location=New York|publisher=Greenwood Press|isbn=1-4128-0467-1|pages=9|url-status=live}}</ref> Ignaz lalu dipecat dari rumah sakit dan dipaksa untuk pindah ke Budapest. Konflik ini juga menyebabkan Ignaz menjadi kecewa dan tertekan.

Sebagian besar ahli bedah pada masa Lister percaya bahwa infeksi disebabkan oleh miasma.<ref>{{Cite web|title=Bloody hands, dirty knives: The horrors of Victorian medicine|url=https://www.aamc.org/news-insights/bloody-hands-dirty-knives-horrors-victorian-medicine|website=AAMC|language=en|access-date=2021-10-18}}</ref> Bau pembusukkan di rumah sakit diasosiasikan dengan resikorisiko penyakit. Sebagian yang lain percaya penyakit terbentuk secara spontan pada materi organik yang membusuk dan menyebar melalui udara. Karena hal ini, menjaga luka tetap bersih bukanlah sesuatu yang diperhatikan oleh ahli bedah saat itu.<ref name=":9" /><ref name=":11" />

Penerapan metode Lister dalam dunia bedah sangat berpengaruh pada perkembangan dunia bedah modern. Sebelum masa Lister, ungkapan yang umum dalam dunia bedah adalah “operasi berhasil akan tetapi pasien meninggal”. Perkembangan dari sistem antiseptik yang dikembangkan oleh Joseph Lister secara signifikan merubah  resiko risiko kematian dari pascaoperasi yang sebelumnya mencapai 40% menjadi kurang dari 3% pada tahun 1910. Keberhasilan Lister ini dipublikasikan secara luas, sehingga praktisi lainnya dapat melihat bagaimana Lister menggunakan keahliannya dalam membangun metode baru dalam dunia bedah. <ref>{{Cite web|title=Lord Lister, 'Father of antiseptic surgery' {{!}} Feature from King's College London|url=https://www.kcl.ac.uk/lord-lister-father-of-antiseptic-surgery-2|website=www.kcl.ac.uk|language=en-GB|access-date=2021-10-18}}</ref>

Selain itu, keduabelas ilustrasi tersebut dilengkapi oleh Mantell dengan penjelasan tentang karakteristik umum masing-masing ''animalcule'' pada bagian awal bukunya. Penjelasan tentang struktur dan karakteristik umum tersebut didasarkan dari pada hasil penelitian ahli terdahulu, yakni [[:en:Abraham_TrembleyAbraham Trembley|Trembley]] (pada bagian Hydra), [[Christian Gottfried Ehrenberg|Ehrenberg]]:(pada bagian Infusoria), dan beberapa ahli lain di bagian lainnya.

[[Berkas:Hydra_illustration_on_Hydra illustration on "Thoughts_on_animalThoughts on animal"_by_Mantell by Mantell.jpg|jmpl|Hydra atau polip pada air bersih]]

Penelitian yang lebih formal mengenai hubungan antara kuman dan penyakit dilaksanakan oleh Louis Pasteur di antara tahun 1860 dan 1864. Ia menemukan patologi demam puerperal dan vibrio piogenik di dalam darah.<ref>{{cite book|title=Comptes Rendus de l'Académie des Sciences|last=Pasteur|first=Louis|others=Ernst, H.C. (trans)|year=1880|volume=XC|pages=1033–44|chapter=(translated from French)|trans-chapter=On the extension of the germ theory to the etiology of certain common diseases|origyear=May 1880|chapterurl=http://ebooks.adelaide.edu.au/p/pasteur/louis/exgerm/complete.html|access-date=2020-04-20|archive-date=2017-09-08|archive-url=https://web.archive.org/web/20170908042333/https://ebooks.adelaide.edu.au/p/pasteur/louis/exgerm/complete.html|dead-url=yes}}</ref> Ia kemudian menyarankan penggunaan [[asam borik]] untuk membunuh mikroorganisme ini sebelum dan setelah isolasi.

Pada tahun 1854, Louis Pasteur diminta untuk membantu memecahkan masalah yang berhubungan dengan produksi [[alkohol]], dan dengan demikian ia memulai serangkaian penelitian mengenai fermentasi. Saat itu, Pasteur menyelidiki berbagai aspek pada proses [[fermentasi]], termasuk produksi senyawa asam laktat pada proses pengasaman susu. Pada awalnya, terdapat gagasan oleh dua ahli kimia terkemuka bernama [[Justus Liebig|Justus von Liebig]] dari Jerman dan [[Jacob Berzelius]] dari Swedia yang mengemukakan bahwa fermentasi alkohol sebagian besar merupakan aktivitas kimiawi, bukan biologis. Liebig percaya bahwa fermentasi adalah proses dekomposisi dari kapang yang terpapar air dan udara. <ref name=":12">{{Cite book|date=1957|url=https://www.worldcat.org/oclc/979880864|title=Conant, James Bryant ; Nash, Leonard K. ; Roller, Duane ; Roller, Duane H.D.: Harvard Case Histories in Experimental Science. Volume II.|location=Cambridge, Mass.|isbn=978-0-674-59871-3|oclc=979880864}}</ref> Pernyataan ini diperkuat oleh pengamatan Liebig bahwa materi terurai lainnya, misalnya bagian tumbuhan atau hewan yang buruk, berinteraksi dengan gula dengan cara yang sama seperti ragi.<ref name=":12" /><ref>{{Cite book|last=Ben-Menahem|first=Ari|date=2009|url=https://www.worldcat.org/oclc/318545341|title=Historical encyclopedia of natural and mathematical sciences|location=Berlin|publisher=Springer|isbn=978-3-540-68832-7|oclc=318545341}}</ref>

Pada tahun 1863, tepatnya sesaat setelah Pasteur diangkat menjadi profesor geologi, fisika, dan kimia di École des Beaux-Arts (Sekolah Seni Rupa), ia mengalihkan perhatiannya ke krisis ulat sutra di Prancis. Pada pertengahan abad ke-19, sebuah penyakit menular yang bernama ‘pebrin’ dan ‘''flacherie''’ menyerang pembiakan ulat sutra.<ref>{{Cite journal|last=Casanova|first=Jean-Laurent|last2=Abel|first2=Laurent|date=2013-08-31|title=The Genetic Theory of Infectious Diseases: A Brief History and Selected Illustrations|url=https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-genom-091212-153448|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=14|issue=1|pages=215–243|doi=10.1146/annurev-genom-091212-153448|issn=1527-8204|pmc=PMC4980761|pmid=23724903|access-date=2021-10-18|archive-date=2021-10-18|archive-url=https://web.archive.org/web/20211018164038/https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-genom-091212-153448|dead-url=yes}}</ref><ref>{{Cite book|last=Pasteur|first=Louis|last2=Vallery-Radot|first2=Pasteur|date=1922|url=http://dx.doi.org/10.5962/bhl.title.22971|title=Oeuvres / réunies par Pasteur Vallery-Radot.|location=Paris :|publisher=Masson}}</ref> Akibatnya, telur-telur ulat sutra tersebut tidak bisa diproduksi dan diimpor ke negara lain. Penyakit ini telah menyebar ke seluruh Eropa, wilayah Kaukasus di Eurasia, Cina, dan Jepang. Penyakit ‘pebrin’ disebabkan oleh organisme mikroskopis (yang kemudian diketahui merupakan protozoa parasit) bernama ''Nosema bombycis''. Sedangkan penyakit serupa yang bernama ‘''flacherie''’ diyakini oleh Pasteur karena sumber nutrisi, dengan proliferasi bakteri usus. <ref name=":13" /> Peristiwa ini menyebabkan industri ulat sutra yang hampir hancur di Prancis dan sebagian kecil di Eropa barat pada tahun 1865. Atas permintaan mentor terdahulunya, Dumas, Pasteur yang hampir tidak mengetahui apapun mengenai ulat sutra menerima tawaran dan berkesempatan untuk mempelajari lebih lanjut terkait penyakit menular itu. Setelah lima tahun penelitian, ia berhasil menyelamatkan industri sutra melalui metode yang memungkinkan pelestarian telur ulat sutra yang sehat dan mencegah kontaminasi oleh organisme penyebab penyakit. <ref>{{Cite journal|last=Schwartz|first=M.|date=2001-10|title=The life and works of Louis Pasteur|url=http://dx.doi.org/10.1046/j.1365-2672.2001.01495.x|journal=Journal of Applied Microbiology|volume=91|issue=4|pages=597–601|doi=10.1046/j.1365-2672.2001.01495.x|issn=1364-5072}}</ref> Metode ini disebut sebagai ‘''graining''’ dengan pemeriksaan mikroskop yang memungkinkan penyeleksian telur ulat sutra yang sehat juga di saat yang bersamaan menghilangkan telur dari betina yang terinfeksi.<ref name=":13" /> Dalam beberapa tahun, metode ini diakui di seluruh Eropa dan masih digunakan hingga sekarang di negara-negara penghasil sutra. Penelitian ini kemudian yang dibawakan Pasteur sebagai teori kuman untuk menjelaskan banyak penyakit menular lainnya.

Postulat Koch dikembangkan dipada abad ke-19 dan berlaku sebagai metode dasar pengidentifikasian patogen yang dapat diisolasi dengan teknik yang tersedia pada masanya.<ref>{{cite journal|year=2006|title=Koch's postulates and infectious proteins|journal=Acta Neuropathologica|volume=112|issue=1|pages=1–4|doi=10.1007/s00401-006-0072-x|pmid=16703338|vauthors=Walker L, Levine H, [[Mathias Jucker (neuroscientist)|Jucker M]]}}</ref> Bahkan pada zaman Koch, orang sudah umum mengetahui bahwa beberapa agen infeksius memang menjadi penyebab penyakit, meskipun agen tersebut tidak memenuhi seluruh kriteria yang disebutkan postulat Koch.<ref name="Koch 18932">{{cite journal|author=Koch Robert|year=1893|title=Über den augenblicklichen Stand der bakteriologischen Choleradiagnose|url=https://zenodo.org/record/2077681|journal=Zeitschrift für Hygiene und Infektionskrankheiten|language=German|volume=14|pages=319–33|doi=10.1007/BF02284324}}</ref><ref name="Koch1884">{{cite book|title=Mittheilungen aus dem Kaiserlichen Gesundheitsamte|author=Koch Robert|year=1884|volume=2|pages=1–88|chapter=Die Aetiologie der Tuberkulose}}</ref> Di akhir abad ke-19, ada percobaan untuk menggunakan postulat Koch secara kaku untuk mendiagnosa penyakit viral. Pada masa itu, virus belum dapat terlihat atau diisolasi di dalam kultur. Percobaan ini diperkirakan menjadi penyebab mundurnya perkembangan bidang virologi.<ref>{{cite journal|author=Evans AS|date=May 1976|title=Causation and disease: the Henle-Koch postulates revisited|journal=Yale Journal of Biology and Medicine|volume=49|issue=2|pages=175–95|pmc=2595276|pmid=782050}}</ref><ref>{{cite book|title=Robert Koch: a life in medicine and bacteriology|url=https://archive.org/details/robertkochlifein0000broc_t5s7|author=Brock TD|publisher=American Society of Microbiology Press|year=1999|isbn=1-55581-143-4|location=Washington DC|author-link=Thomas D. Brock}}</ref> Di zaman sekarang, beberapa agen infeksius tetap dinyatakan sebagai penyebab penyakit meskipun tidak memenuhi seluruh postulat Koch.<ref>{{cite journal|year=2002|title=Natural history of ''Bartonella'' infections (an exception to Koch's postulate)|journal=Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology|volume=9|issue=1|pages=8–18|doi=10.1128/CDLI.9.1.8-18.2002|pmc=119901|pmid=11777823|vauthors=Jacomo V, Kelly P, Raoult D}}</ref> Meskipun postulat Koch memiliki kepentingan sejarah dan sampai sekarang tetap digunakan untuk pendekatan diagnosis mikrobiologis, kini pemenuhan keempat kriteria dalam postulat tersebut tidak dibutuhkan untuk menggambarkan sebab-akibat.

Meskipun telah banyak data dan fakta yang digunakan untuk memvalidasi teori kuman penyakit, namun ada orang-orang yang menyangkal teori ini. Kepercayaan yang menolak teori kuman penyakit, dalam bahasa Inggris, disebut sebagai ''germ theory denialism'' (denialisme teori kuman penyakit).   Kepercayaan ini berawal dari [[Antoine Béchamp]], seorang biokimiawan asal Prancis yang menghasilkan berbagai hasil penelitian pada pertengahan tahun 1800-an. Béchamp mempostulasikan bahwa mikroorganisme bukan merupakan penyebab dari penyakit, namun sebaliknya, jaringan tubuh yang sakitlah yang menyebabkan munculnya mikroorganisme. Sehingga, kesehatan dari suatu organisme, atau disebut ''terrain'', adalah penentu utama sakit atau tidaknya organisme tersebut, bukan keberadaan mikroorganisme. Ide ini disebut sebagai teori pleomorfik penyakit yang saat ini hanya digunakan oleh orang-orang yang menolak vaksinasi dan pengobatan alternatif yang mempercayai bahwa makanan adalah obat. <ref>{{Cite news|last=Pontin|first=Jason|title=The 19th-Century Crank Who Tried to Tell Us About the Microbiome|url=https://www.wired.com/story/the-19th-century-crank-who-tried-to-tell-us-about-the-microbiome/|newspaper=Wired|language=en-US|issn=1059-1028|access-date=2021-10-20}}</ref>