Wikipedia

Serpin: Perbedaan antara revisi

Jelajahi riwayat secara interaktif
← Revisi sebelumnya
Konten dihapus Konten ditambahkan
VisualTeks wiki
Tag: Suntingan visualeditor-wikitext
InternetArchiveBot (bicara | kontrib)
Bot
664.389 suntingan
Add 1 book for Wikipedia:Pemastian (20210209)) #IABot (v2.0.8) (GreenC bot
 
(15 revisi perantara oleh 2 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1:
{{inuse}}
{{Pfam_box
| Symbol = Serpin, SERPIN ([https://www.genenames.org/cgi-bin/genefamilies/ root symbol] of family)
| Name = Serpin (serine protease inhibitor)
| image = serpin_(stressed).png
| width =
| caption = Sebuah molekul serpin (putih) dengan 'loop pusat reaktif'-nya (biru) terikat dengan [[protease]] (abu-abu). Ketika protease mencoba mengkatalisis enzim, maka ia akan dihambat secara irreversibel. ({{PDB|1K9O}})
| Pfam = PF00079
| InterPro = IPR000215
| SMART =
| Prosite = PDOC00256
| SCOP = 1hle
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd00172
| PDB =
{{PDB3|1m37}}A:1-378 {{PDB3|1hle}}B:349-379 {{PDB3|1jrr}}A:1-415
{{PDB3|1by7}}A:1-415 {{PDB3|1ova}}A:1-385 {{PDB3|1uhg}}A:1-385
Baris 43 ⟶ 42:
}}
 
'''Serpin''' atau '''Serine Protease Inhibitor''' adalah sebuah kelompok besar [[protein]] yang bekerja sebagai penghambat [[protease]] dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak tersebarditemui pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada [[binatang]], [[tumbuhan]], [[virus pox]] dan [[bakteri]]. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target.<ref name="Law_2006">[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1779521/{{cite journal | vauthors = Law RH, Zhang Q, McGowan S, Buckle AM, Silverman GA, Wong W, Rosado CJ, Langendorf CG, Pike RN, Bird PI, Whisstock JC | title = An overview of the serpin superfamily] | journal = Genome Biology | volume = 7 | issue = 5 | pages = 216 | year = 2006 | pmid = 16737556 | pmc = 1779521 | doi = 10.1186/gb-2006-7-5-216 }}</ref>
 
== Struktur ==
Serpin terdiri dari 350-400 [[asam amino]] dan memiliki berat molekul 40-50 kDa. Penyusunnya adalah 3 lembaran beta (A, B, C) dan 8-9 heliks alfa (hA-hI).<ref>[{{Cite web|url=https://wwwnew.hindawi.com/journals/jaa/2011/606797/ |title=Serpin Inhibition Mechanism: A Delicate Balance between Native Metastable State and Polymerization]|last=Khan|first=Mohammad Sazzad|last2=Singh|first2=Poonam|date=2011|website=Journal of Amino Acids|language=en|access-date=2020-01-19|last3=Azhar|first3=Asim|last4=Naseem|first4=Asma|last5=Rashid|first5=Qudsia|last6=Kabir|first6=Mohammad Anaul|last7=Jairajpuri|first7=Mohamad Aman}}</ref>
 
Sebagai [[penghambat protease]], serpin memiliki struktur lingkaran yang berguna untuk berhubungan dengan celah aktif [[protease]]. Berbeda dengan penghambat protease serin lainnya yang memiliki lingkaran pusat reaktif (LPR) yang pendek dan kaku, serpin memiliki LPR yang panjang dan lentur.<ref>[{{Cite journal|last=Huntington|first=J. A.|date=2011|title=Serpin structure, function and dysfunction|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/fullabs/10.1111/j.1538-7836.2011.04360.x|journal=Journal Serpinof structure, functionThrombosis and dysfunction]Haemostasis|language=en|volume=9|issue=s1|pages=26–34|doi=10.1111/j.1538-7836.2011.04360.x|issn=1538-7836}}</ref>
 
== Pembagian ==
Serpin dibagi dalam beberapa ''clade'' yaitu:<ref>{{Sfncite book|title=Molecular And Cellular Aspects Of The Serpinopathies And Disorders In Serpin Activity|url=https://archive.org/details/molecularcellula00gary|author=Silverman, Gary A. & |first=|author2=Lomas, David A.,|date=|publisher=World Scientific Publishing|year=2007|pisbn=978-981-256-963-9|location=Singapore|pages=[https://archive.org/details/molecularcellula00gary/page/n39 9]-10|language=Inggris|ref={{sfnRef|Silverman Gary A. & Lomas David A. 2007}}|last-author-amp=yes}}</ref>{{Sfn|Gettins, Peter G.W., 2002}}
* Clade A (Antitripsin-like)
* Clade B (Ovalbumin-like)
Baris 71 ⟶ 70:
== Persebaran ==
Serpin terdapat pada semua makhluk hidup eukariota seperti binatang dan tumbuhan kecuali jamur dan klorofita. Serpin juga dapat ditemukan pada sebagian bakteri dan virus yang menginfeksi makhluk hidup eukariota.
 
Sampai saat ini serpin yang ditemukan pada manusia berjumlah 34 buah yang berasal dari sembilan clade. Serpin pada manusia berfungsi dalam proses penggumpalan darah, fibrinolisis dan peradangan. Sebanyak 7 serpin pada manusia tidak berfungsi sebagai penghambat proteinase.<ref>[http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/cr010170%2B Serpin Structure, Mechanism, and Function]</ref>
 
=== Virus ===
Baris 78 ⟶ 75:
 
=== Chordata ===
Serpin pada eukariota yang lebih tinggi dapat dibagi menjadi 2 kelompok besar, yaitu serpin intraselulkar (serpin-ov) dan serpin ekstraselular. Serpin-ov membentuk clade (b) dan merupakan nenek moyang dari serpin ekstraseluler.
 
Sedangkan serpin ekstraselular dapat dibagi ke dalam 8 clade, yang paling besar adalah clade a. Serpin dalam kelompok ini terlibat dalam banyak proses, paling umum adalah penghambatan proteinase serin.<ref>{{cite journal |vauthors=Irving J.A et.al |title=Phylogeny of the Serpin Superfamily: Implications of Patterns of Amino Acid Conservation for Structure and Function |journal=Genome Research |volume= |issue= |pages= |year=2000 |pmid=|doi=10.1101/gr.147800}}</ref>
 
=== Manusia ===
Sampai saat ini serpin yang ditemukan pada manusia berjumlah 34 buah yang berasal dari sembilan clade. Serpin pada manusia berfungsi dalam proses penggumpalan darah, fibrinolisis dan peradangan. Sebanyak 7 serpin pada manusia tidak berfungsi sebagai penghambat proteinase.<ref>{{Cite journal|last=Gettins|first=Peter G. W.|date=2002-12-01|title=Serpin Structure, Mechanism, and Function|url=https://doi.org/10.1021/cr010170+|journal=Chemical Reviews|volume=102|issue=12|pages=4751–4804|doi=10.1021/cr010170+|issn=0009-2665}}</ref>
 
{| class="navbox collapsible collapsed" style="border:0; margin-top:0.2em;"
|-
! style="text-align: center"| Serpin pada Manusia<ref name="Law_2006"/>
|-
{| class="wikitable sortable"
! Nama Gen
! Nama Umum
! Letak
! Fungsi
|-
| SERPINA1
| Antitripsin
| Ekstraselular
| Menghambat elastase neutrofil
|-
| SERPINA2
| Protein terkait Antitripsin
| Extracellular
| Kemungkinan pseudogen
|-
| SERPINA3
| Antikimotripsin
| Ekstracellular
| Menghambat katepsin G
|-
| SERPINA4
| Kallistatin (PI4)
| Extracellular
| Menghambat kalikrein
|-
| SERPINA5
| Penghambat Protein C (PAI-3)
| Extracellular
| Menghambat protein C aktif
|-
| SERPINA6
| Globulin Pengikat Kortikosteroid
| Extracellular
| Mengikat kortisol
|-
| SERPINA7
| Globulin Pengikat Tiroksin
| Extracellular
| Mengikat tiroksin
|-
| SERPINA8
| Angiotensinogen
| Extracellular
| Memotong amino-terminal dengan renin protease mengakibatkan pelepasan angiotensin I
|-
| SERPINA9
| Centerin
| Extracellular
| Memelihara sel B naive
|-
| SERPINA10
| Penghambat Proteinase Protein Z-dependen
| Extracellular
| Menghambat faktor Z dan XI teraktivasi
|-
| SERPINA11
| XP_170754.3
| Extracellular
|
|-
| SERPINA12
| Vaspin
| Extracellular
| Adipositokin pemeka insulin
|-
| SERPINA13
| XM_370772
| Extracellular
| Menghambat elastase neutrofil
|-
| SERPINB1
| Penghambat Elastase Neutrofil Monosit
| Intracellular
| Menghambat uPA
|-
| SERPINB2
| Penghambat Pengaktif Plasminogen 2 (PAI2)
| Intracellular/extracellular
| Menghambat katepsin L dan V
|-
| SERPINB3
| Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 1
| Intracellular
| Menghambat katepsin G dan kimase
|-
| SERPINB4
| Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 2
| Intracellular
| Menghambat metastasis
|-
| SERPINB5
| Maspin
| Intracellular
| Menghambat katepsin G
|-
| SERPINB6
| Penghambat Proteinase 6 (PI6)
| Intracellular
| Pematangan megakariosit
|-
| SERPINB7
| Megsin
| Intracellular
| Menghambat furin
|-
| SERPINB8
| Antiproteinase sitoplasmik 8 (PI8)
| Intracellular
| Menghambat granzim B
|-
| SERPINB9
| Antiproteinase sitoplasmik 9 (PI9)
| Intracellular
| Menghambat trombin dan tripsin
|-
| SERPINB10
| Bomapin (PI10)
| Intracellular
| -
|-
| SERPINB11
| Epipin
| Intracellular
| Menghambat tripsin
|-
| SERPINB12
| Yukopin
| Intracellular
| Menghambat katepsin L dan K
|-
| SERPINB13
| Headpin (PI13)
| Intracellular
| Menghambat trombin dan faktor Xa
|-
| SERPINC1
| Antitrombin
| Extracellular
| Menghambat trombin
|-
| SERPIND1
| Kofaktor Heparin II
| Extracellular
| Menghambat trombin, uPA, tPA dan plasmin
|-
| SERPINE1
| Penghambat Aktivator Plasminogen 1 (PAI1)
| Extracellular
| Menghambat uPA dan tPA
|-
| SERPINE2]
| Neksin Protease I (PI7)
| Ekstracellular
|
|-
| SERPINF1
| Hs.512272
| Extracellular
| Molekul anti-angiogenik poten
|-
| SERPINF2
| Faktor Turunan Epitelium Pigmen
| Extracellular
| Penghambat plasmin
|-
| SERPING1
| Antiplasmin Alfa 2
| Extracellular
| Penghambat esterase C1
|-
| SERPINH1
| Protein Penyekat Panas 47kDa
| Intracellular
| Molekul Kaperon untuk kolagen
|-
| SERPINI1
| Neuroserpin
| Extracellular
| Penghambat tPA, uPA dan plasmin
|-
| SERPINI2
| Penghambat Proteinase Serin Turunan Myoepitelium
| Extracellular
| Menghambat metastasis kanker
|}
 
== Sumber ==
{{reflist}}
 
=== Buku ===
* {{cite book|title=Molecular And Cellular Aspects Of The Serpinopathies And Disorders In Serpin Activity|author=Silverman, Gary A.|first=|author2=Lomas, David A|date=|publisher=World Scientific Publishing|year=2007|isbn=978-981-256-963-9|location=Singapore|pages=9-10|language=Inggris|ref={{sfnRef|Silverman Gary A. & Lomas David A. 2007}}|last-author-amp=yes}}
 
 
 
[[Kategori:Protein]]
Diperoleh dari "https://wiki-indonesia.club/wiki/Serpin"