Serpin: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Tidak ada ringkasan suntingan |
Add 1 book for Wikipedia:Pemastian (20210209)) #IABot (v2.0.8) (GreenC bot |
||
| (27 revisi perantara oleh 2 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 1:
{{Pfam_box
| Symbol = Serpin, SERPIN ([https://www.genenames.org/cgi-bin/genefamilies/ root symbol] of family)
| Name = Serpin (serine protease inhibitor)
| image = serpin_(stressed).png
| width =
| caption = Sebuah molekul serpin (putih) dengan 'loop pusat reaktif'-nya (biru) terikat dengan [[protease]] (abu-abu). Ketika protease mencoba mengkatalisis enzim, maka ia akan dihambat secara irreversibel. ({{PDB|1K9O}})
| Pfam = PF00079
| InterPro = IPR000215
| SMART =
| Prosite = PDOC00256
| SCOP = 1hle
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd00172
| PDB =
{{PDB3|1m37}}A:1-378 {{PDB3|1hle}}B:349-379 {{PDB3|1jrr}}A:1-415
{{PDB3|1by7}}A:1-415 {{PDB3|1ova}}A:1-385 {{PDB3|1uhg}}A:1-385
Baris 42:
}}
'''Serpin''' atau '''Serine Protease Inhibitor''' adalah sebuah kelompok besar [[protein]] yang bekerja sebagai penghambat [[protease]] dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak
== Struktur ==
Serpin terdiri dari 350-400 [[asam amino]] dan memiliki berat molekul 40-50 kDa. Penyusunnya adalah 3 lembaran beta (A, B, C) dan 8-9 heliks alfa (hA-hI).<ref>{{Cite web|url=https://new.hindawi.com/journals/jaa/2011/606797/|title=Serpin Inhibition Mechanism: A Delicate Balance between Native Metastable State and Polymerization|last=Khan|first=Mohammad Sazzad|last2=Singh|first2=Poonam|date=2011|website=Journal of Amino Acids|language=en|access-date=2020-01-19|last3=Azhar|first3=Asim|last4=Naseem|first4=Asma|last5=Rashid|first5=Qudsia|last6=Kabir|first6=Mohammad Anaul|last7=Jairajpuri|first7=Mohamad Aman}}</ref>
Sebagai [[penghambat protease]], serpin memiliki struktur lingkaran yang berguna untuk berhubungan dengan celah aktif [[protease]]. Berbeda dengan penghambat protease serin lainnya yang memiliki lingkaran pusat reaktif (LPR) yang pendek dan kaku, serpin memiliki LPR yang panjang dan lentur.<ref>{{Cite journal|last=Huntington|first=J. A.|date=2011|title=Serpin structure, function and dysfunction|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1538-7836.2011.04360.x|journal=Journal of Thrombosis and Haemostasis|language=en|volume=9|issue=s1|pages=26–34|doi=10.1111/j.1538-7836.2011.04360.x|issn=1538-7836}}</ref>
== Pembagian ==
Serpin dibagi dalam beberapa ''clade'' yaitu:<ref>{{cite book|title=Molecular And Cellular Aspects Of The Serpinopathies And Disorders In Serpin Activity|url=https://archive.org/details/molecularcellula00gary|author=Silverman, Gary A.|first=|author2=Lomas, David A|date=|publisher=World Scientific Publishing|year=2007|isbn=978-981-256-963-9|location=Singapore|pages=[https://archive.org/details/molecularcellula00gary/page/n39 9]-10|language=Inggris|ref={{sfnRef|Silverman Gary A. & Lomas David A. 2007}}|last-author-amp=yes}}</ref>{{Sfn|Gettins, Peter G.W., 2002}}
* Clade A (Antitripsin-like)
* Clade B (Ovalbumin-like)
* Clade C (Antitrombin)
* Clade D (Heparin Kofaktor II)
* Clade E (PAI-1/GDN)
* Clade F (PEDF)
* Clade G (Penghambat C1)
* Clade H (Protein peredam panas 47)
* Clade I (Neuroserpin)
* Clade J (Belangkas)
* Clade K (Serangga)
* Clade L (Nematoda)
* Clade M (Schistosoma)
* Clade N (Viral SPI1-2/Crm-A-like)
* Clade O (Viral SPI3-like)
* Clade P (Tumbuhan)
== Persebaran ==
Serpin terdapat pada semua makhluk hidup eukariota seperti binatang dan tumbuhan kecuali jamur dan klorofita. Serpin juga dapat ditemukan pada sebagian bakteri dan virus yang menginfeksi makhluk hidup eukariota.
=== Virus ===
Sejauh ini serpin baru ditemukan pada virus poxviridae. Serpin dari cabang Orthopoxvirus (pox sapi, ectromelia, vaccinia, variola dan pox kelinci) tergabung dalam 2 clade, yaitu clade n, mengandung serpin SPI-1-like dan SPI-2-like, dan clade o, mengandung serpin SPI-3-like.
=== Chordata ===
Serpin pada eukariota yang lebih tinggi dapat dibagi menjadi 2 kelompok besar, yaitu serpin intraselulkar (serpin-ov) dan serpin ekstraselular. Serpin-ov membentuk clade (b) dan merupakan nenek moyang dari serpin ekstraseluler.
Sedangkan serpin ekstraselular dapat dibagi ke dalam 8 clade, yang paling besar adalah clade a. Serpin dalam kelompok ini terlibat dalam banyak proses, paling umum adalah penghambatan proteinase serin.<ref>{{cite journal |vauthors=Irving J.A et.al |title=Phylogeny of the Serpin Superfamily: Implications of Patterns of Amino Acid Conservation for Structure and Function |journal=Genome Research |volume= |issue= |pages= |year=2000 |pmid=|doi=10.1101/gr.147800}}</ref>
=== Manusia ===
Sampai saat ini serpin yang ditemukan pada manusia berjumlah 34 buah yang berasal dari sembilan clade. Serpin pada manusia berfungsi dalam proses penggumpalan darah, fibrinolisis dan peradangan. Sebanyak 7 serpin pada manusia tidak berfungsi sebagai penghambat proteinase.<ref>{{Cite journal|last=Gettins|first=Peter G. W.|date=2002-12-01|title=Serpin Structure, Mechanism, and Function|url=https://doi.org/10.1021/cr010170+|journal=Chemical Reviews|volume=102|issue=12|pages=4751–4804|doi=10.1021/cr010170+|issn=0009-2665}}</ref>
{| class="navbox collapsible collapsed" style="border:0; margin-top:0.2em;"
|-
! style="text-align: center"| Serpin pada Manusia<ref name="Law_2006"/>
|-
{| class="wikitable sortable"
! Nama Gen
! Nama Umum
! Letak
! Fungsi
|-
| SERPINA1
| Antitripsin
| Ekstraselular
| Menghambat elastase neutrofil
|-
| SERPINA2
| Protein terkait Antitripsin
| Extracellular
| Kemungkinan pseudogen
|-
| SERPINA3
| Antikimotripsin
| Ekstracellular
| Menghambat katepsin G
|-
| SERPINA4
| Kallistatin (PI4)
| Extracellular
| Menghambat kalikrein
|-
| SERPINA5
| Penghambat Protein C (PAI-3)
| Extracellular
| Menghambat protein C aktif
|-
| SERPINA6
| Globulin Pengikat Kortikosteroid
| Extracellular
| Mengikat kortisol
|-
| SERPINA7
| Globulin Pengikat Tiroksin
| Extracellular
| Mengikat tiroksin
|-
| SERPINA8
| Angiotensinogen
| Extracellular
| Memotong amino-terminal dengan renin protease mengakibatkan pelepasan angiotensin I
|-
| SERPINA9
| Centerin
| Extracellular
| Memelihara sel B naive
|-
| SERPINA10
| Penghambat Proteinase Protein Z-dependen
| Extracellular
| Menghambat faktor Z dan XI teraktivasi
|-
| SERPINA11
| XP_170754.3
| Extracellular
|
|-
| SERPINA12
| Vaspin
| Extracellular
| Adipositokin pemeka insulin
|-
| SERPINA13
| XM_370772
| Extracellular
| Menghambat elastase neutrofil
|-
| SERPINB1
| Penghambat Elastase Neutrofil Monosit
| Intracellular
| Menghambat uPA
|-
| SERPINB2
| Penghambat Pengaktif Plasminogen 2 (PAI2)
| Intracellular/extracellular
| Menghambat katepsin L dan V
|-
| SERPINB3
| Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 1
| Intracellular
| Menghambat katepsin G dan kimase
|-
| SERPINB4
| Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 2
| Intracellular
| Menghambat metastasis
|-
| SERPINB5
| Maspin
| Intracellular
| Menghambat katepsin G
|-
| SERPINB6
| Penghambat Proteinase 6 (PI6)
| Intracellular
| Pematangan megakariosit
|-
| SERPINB7
| Megsin
| Intracellular
| Menghambat furin
|-
| SERPINB8
| Antiproteinase sitoplasmik 8 (PI8)
| Intracellular
| Menghambat granzim B
|-
| SERPINB9
| Antiproteinase sitoplasmik 9 (PI9)
| Intracellular
| Menghambat trombin dan tripsin
|-
| SERPINB10
| Bomapin (PI10)
| Intracellular
| -
|-
| SERPINB11
| Epipin
| Intracellular
| Menghambat tripsin
|-
| SERPINB12
| Yukopin
| Intracellular
| Menghambat katepsin L dan K
|-
| SERPINB13
| Headpin (PI13)
| Intracellular
| Menghambat trombin dan faktor Xa
|-
| SERPINC1
| Antitrombin
| Extracellular
| Menghambat trombin
|-
| SERPIND1
| Kofaktor Heparin II
| Extracellular
| Menghambat trombin, uPA, tPA dan plasmin
|-
| SERPINE1
| Penghambat Aktivator Plasminogen 1 (PAI1)
| Extracellular
| Menghambat uPA dan tPA
|-
| SERPINE2]
| Neksin Protease I (PI7)
| Ekstracellular
|
|-
| SERPINF1
| Hs.512272
| Extracellular
| Molekul anti-angiogenik poten
|-
| SERPINF2
| Faktor Turunan Epitelium Pigmen
| Extracellular
| Penghambat plasmin
|-
| SERPING1
| Antiplasmin Alfa 2
| Extracellular
| Penghambat esterase C1
|-
| SERPINH1
| Protein Penyekat Panas 47kDa
| Intracellular
| Molekul Kaperon untuk kolagen
|-
| SERPINI1
| Neuroserpin
| Extracellular
| Penghambat tPA, uPA dan plasmin
|-
| SERPINI2
| Penghambat Proteinase Serin Turunan Myoepitelium
| Extracellular
| Menghambat metastasis kanker
|}
== Sumber ==
| |||