Serpin: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
Tag: Suntingan visualeditor-wikitext
InternetArchiveBot (bicara | kontrib)
Add 1 book for Wikipedia:Pemastian (20210209)) #IABot (v2.0.8) (GreenC bot
 
(8 revisi perantara oleh satu pengguna lainnya tidak ditampilkan)
Baris 1:
{{inuse}}
{{Pfam_box
| Symbol = Serpin, SERPIN ([https://www.genenames.org/cgi-bin/genefamilies/ root symbol] of family)
| Name = Serpin (serine protease inhibitor)
| image = serpin_(stressed).png
| width =
| caption = Sebuah molekul serpin (putih) dengan 'loop pusat reaktif'-nya (biru) terikat dengan [[protease]] (abu-abu). Ketika protease mencoba mengkatalisis enzim, maka ia akan dihambat secara irreversibel. ({{PDB|1K9O}})
| Pfam = PF00079
| InterPro = IPR000215
| SMART =
| Prosite = PDOC00256
| SCOP = 1hle
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd00172
| PDB =
{{PDB3|1m37}}A:1-378 {{PDB3|1hle}}B:349-379 {{PDB3|1jrr}}A:1-415
{{PDB3|1by7}}A:1-415 {{PDB3|1ova}}A:1-385 {{PDB3|1uhg}}A:1-385
Baris 43 ⟶ 42:
}}
 
'''Serpin''' atau '''Serine Protease Inhibitor''' adalah sebuah kelompok besar [[protein]] yang bekerja sebagai penghambat [[protease]] dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak tersebarditemui pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada [[binatang]], [[tumbuhan]], [[virus pox]] dan [[bakteri]]. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target.<ref name="Law_2006">{{cite journal | vauthors = Law RH, Zhang Q, McGowan S, Buckle AM, Silverman GA, Wong W, Rosado CJ, Langendorf CG, Pike RN, Bird PI, Whisstock JC | title = An overview of the serpin superfamily | journal = Genome Biology | volume = 7 | issue = 5 | pages = 216 | year = 2006 | pmid = 16737556 | pmc = 1779521 | doi = 10.1186/gb-2006-7-5-216 }}</ref>
 
 
== Struktur ==
Serpin terdiri dari 350-400 [[asam amino]] dan memiliki berat molekul 40-50 kDa. Penyusunnya adalah 3 lembaran beta (A, B, C) dan 8-9 heliks alfa (hA-hI).<ref>[{{Cite web|url=https://wwwnew.hindawi.com/journals/jaa/2011/606797/ |title=Serpin Inhibition Mechanism: A Delicate Balance between Native Metastable State and Polymerization]|last=Khan|first=Mohammad Sazzad|last2=Singh|first2=Poonam|date=2011|website=Journal of Amino Acids|language=en|access-date=2020-01-19|last3=Azhar|first3=Asim|last4=Naseem|first4=Asma|last5=Rashid|first5=Qudsia|last6=Kabir|first6=Mohammad Anaul|last7=Jairajpuri|first7=Mohamad Aman}}</ref>
 
Sebagai [[penghambat protease]], serpin memiliki struktur lingkaran yang berguna untuk berhubungan dengan celah aktif [[protease]]. Berbeda dengan penghambat protease serin lainnya yang memiliki lingkaran pusat reaktif (LPR) yang pendek dan kaku, serpin memiliki LPR yang panjang dan lentur.<ref>[{{Cite journal|last=Huntington|first=J. A.|date=2011|title=Serpin structure, function and dysfunction|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/fullabs/10.1111/j.1538-7836.2011.04360.x|journal=Journal Serpinof structure, functionThrombosis and dysfunction]Haemostasis|language=en|volume=9|issue=s1|pages=26–34|doi=10.1111/j.1538-7836.2011.04360.x|issn=1538-7836}}</ref>
 
== Pembagian ==
Serpin dibagi dalam beberapa ''clade'' yaitu:<ref>{{cite book|title=Molecular And Cellular Aspects Of The Serpinopathies And Disorders In Serpin Activity|url=https://archive.org/details/molecularcellula00gary|author=Silverman, Gary A.|first=|author2=Lomas, David A|date=|publisher=World Scientific Publishing|year=2007|isbn=978-981-256-963-9|location=Singapore|pages=[https://archive.org/details/molecularcellula00gary/page/n39 9]-10|language=Inggris|ref={{sfnRef|Silverman Gary A. & Lomas David A. 2007}}|last-author-amp=yes}}</ref>{{Sfn|Gettins, Peter G.W., 2002}}
* Clade A (Antitripsin-like)
* Clade B (Ovalbumin-like)
Baris 82 ⟶ 80:
 
=== Manusia ===
Sampai saat ini serpin yang ditemukan pada manusia berjumlah 34 buah yang berasal dari sembilan clade. Serpin pada manusia berfungsi dalam proses penggumpalan darah, fibrinolisis dan peradangan. Sebanyak 7 serpin pada manusia tidak berfungsi sebagai penghambat proteinase.<ref>[http://pubs{{Cite journal|last=Gettins|first=Peter G.acs.org/doi/abs/10.1021/cr010170%2B W.|date=2002-12-01|title=Serpin Structure, Mechanism, and Function]|url=https://doi.org/10.1021/cr010170+|journal=Chemical Reviews|volume=102|issue=12|pages=4751–4804|doi=10.1021/cr010170+|issn=0009-2665}}</ref>
 
{| class="navbox collapsible collapsed" style="border:0; margin-top:0.2em;"
|-
! style="text-align: center"| Serpin pada Manusia<ref name="Law_2006"/>
|-
{| class="wikitable sortable"
Baris 95 ⟶ 93:
|-
| SERPINA1
| Antitripsin
| Alpha-1 antitripsin
| Ekstraselular
| Menghambat elastase neutrofil
Baris 105 ⟶ 103:
|-
| SERPINA3
| Antikimotripsin
| Alpha 1-antichymotrypsin
| Ekstracellular
| Menghambat katepsin G
|-
| SERPINA4
| Kallistatin (PI4)
| Extracellular
| Menghambat kalikrein
|-
| SERPINA5
| Penghambat Protein C inhibitor(PAI-3)
| Extracellular
| Menghambat protein C aktif
|-
| SERPINA6
| Globulin Pengikat Kortikosteroid
| Transcortin
| Extracellular
| Mengikat kortisol
|-
| SERPINA7
| Globulin Pengikat Tiroksin
| Thyroxine-binding globulin
| Extracellular
| Mengikat tiroksin
Baris 135 ⟶ 133:
|-
| SERPINA9
| Centerin / GCET1
| Extracellular
| Memelihara sel B naive
|-
| SERPINA10
| Penghambat Proteinase Protein Z-dependen
| Protein Z-related protease inhibitor
| Extracellular
| Menghambat faktor Z dan XI teraktivasi
|-
| SERPINA11
| XP_170754.3
|
| Extracellular
|
|-
| SERPINA12
| Vaspin
| Extracellular
| Adipositokin pemeka insulin
|-
| SERPINA13
| XM_370772
|
| Extracellular
| Menghambat elastase neutrofil
|-
| SERPINB1
| Penghambat Elastase Neutrofil Monosit
|
| Intracellular
| Menghambat uPA
|-
| SERPINB2
| Penghambat Pengaktif Plasminogen 2 (PAI2)
|
| Intracellular/extracellular
| Menghambat katepsin L dan V
|
|-
| SERPINB3
| Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 1
|
| Intracellular
| Menghambat katepsin G dan kimase
|-
| SERPINB4
| Antigen Karsinoma Sel Skuamosa 2
|
| Intracellular
| Menghambat metastasis
|
|-
| SERPINB5
Baris 187 ⟶ 183:
|-
| SERPINB6
| Penghambat Proteinase 6 (PI6)
| PI-6
| Intracellular
| Pematangan megakariosit
Baris 197 ⟶ 193:
|-
| SERPINB8
| Antiproteinase sitoplasmik 8 (PI8)
| PI-8
| Intracellular
| Menghambat granzim B
|-
| SERPINB9
| Antiproteinase sitoplasmik 9 (PI9)
| PI-9
| Intracellular
| Menghambat trombin dan tripsin
|-
| SERPINB10
| Bomapin (PI10)
| Intracellular
| -
|-
| SERPINB11
| Epipin
| Intracellular
| Menghambat tripsin
Baris 222 ⟶ 218:
|-
| SERPINB13
| Hurpin/Headpin (PI13)
| Intracellular
| Menghambat trombin dan faktor Xa
|-
| SERPINC1
| Antitrombin
| Antithrombin
| Extracellular
| Menghambat trombin
|-
| SERPIND1
| HeparinKofaktor cofactorHeparin II
| Extracellular
| Menghambat trombin, uPA, tPA dan plasmin
|-
| SERPINE1
| Penghambat Aktivator Plasminogen 1 (PAI1)
|
| Extracellular
| Menghambat uPA dan tPA
|-
| SERPINE2]
| Neksin Protease I (PI7)
|
| Ekstracellular
|
|-
| [[SERPINF1]]
| Hs.512272
|
| Extracellular
| Molekul anti-angiogenik poten
|-
| [[SERPINF2]]
| Faktor Turunan Epitelium Pigmen
|
| Extracellular
| Penghambat plasmin
|-
| SERPING1
| Antiplasmin Alfa 2
| C1-inhibitor
| Extracellular
| Penghambat esterase C1
|-
| SERPINH1
| Protein Penyekat Panas 47kDa
|
| Intracellular
| Molekul Kaperon untuk kolagen
Baris 272 ⟶ 268:
|-
| SERPINI2
| Penghambat Proteinase Serin Turunan Myoepitelium
| Pancpin
| Extracellular
| Menghambat metastasis kanker