Biologi molekuler: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
kTidak ada ringkasan suntingan
k Pengembalian suntingan oleh 180.251.146.204 (bicara) ke revisi terakhir oleh Ariandi Lie
Tag: Pengembalian
 
(16 revisi perantara oleh 7 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1:
{{Ilmu}}
{{refimprove}}
{{Ilmu}}
'''Biologi molekuler''' atau '''biologi molekul''' merupakan salah satu cabang [[biologi]] yang merujuk kepada pengkajian mengenai [[kehidupan]] pada skala [[molekul]]. Ini termasuk penyelidikan tentang interaksi molekul dalam benda hidup dan kesannya, terutama tentang interaksi berbagai sistem dalam [[sel]], termasuk interaksi [[DNA]], [[RNA]], dan [[sintesis protein]], dan bagaimana interaksi tersebut diatur. Bidang ini bertumpang tindih dengan bidang [[biologi]] (dan [[kimia]]) lainnya, terutama [[genetika]] dan [[biokimia]].<ref>{{Cite web |url=https://jurnal.ugm.ac.id/teknosains/article/view/7973 |title=RESENSI Biologi Molekular adalah Ilmu yang Menyenangkan (jurnal UGM) |access-date=2020-03-09 |archive-date=2020-05-27 |archive-url=https://web.archive.org/web/20200527181408/https://jurnal.ugm.ac.id/teknosains/article/view/7973 |dead-url=no }}</ref>
 
== Keterkaitan dengan ilmu hayati "skala-molekul" lainnya ==
Baris 21:
=== Reaksi berantai polimerase (PCR) ===
{{utama|Reaksi berantai polimerase}}
''PolymeraseReaksi chain reaction'' ("reaksi [be]rantaiberantai polimerase", PCR) merupakan teknik yang sangat berguna dalam membuat salinan [[DNA]]. PCR memungkinkan sejumlah kecil sekuens DNA tertentu disalin (jutaan kali) untuk diperbanyak (sehingga dapat dianalisis), atau dimodifikasi secara tertentu. Sebagai contoh, PCR dapat digunakan untuk menambahkan situs enzim [[restriksi]], atau untuk me[[mutasi]]kan (mengubah) basa tertentu pada DNA. PCR juga dapat digunakan untuk mendeteksi keberadaan sekuens DNA tertentu dalam sampel.
 
PCR memanfaatkan enzim [[DNA polimerase]] yang secara alami memang berperan dalam perbanyakan DNA pada proses [[replikasi]]. Namun, tidak seperti pada [[organisme]] hidup, proses PCR hanya dapat menyalin fragmen pendek DNA, biasanya sampai dengan 10 kb (kb=''kilo base pairs''=1.000 [[pasang basa]]). Fragmen tersebut dapat berupa suatu [[gen]] tunggal, atau hanya bagian dari suatu gen.
Baris 31:
[[Elektroforesis]] gel merupakan salah satu teknik utama dalam biologi molekuler. Prinsip dasar teknik ini adalah bahwa [[DNA]], [[RNA]], atau [[protein]] dapat dipisahkan oleh [[medan listrik]]. Dalam hal ini, molekul-molekul tersebut dipisahkan berdasarkan laju perpindahannya oleh [[gaya gerak listrik]] di dalam matriks gel. Laju perpindahan tersebut bergantung pada ukuran molekul bersangkutan. Elektroforesis gel biasanya dilakukan untuk tujuan analisis, tetapi dapat pula digunakan sebagai teknik preparatif untuk memurnikan molekul sebelum digunakan dalam metode-metode lain seperti [[spektrometri massa]], [[PCR]], [[kloning]], [[sekuensing]] DNA, atau ''immuno-blotting'' yang merupakan metode-metode karakterisasi lebih lanjut.
 
Gel yang digunakan biasanya merupakan [[polimer]] bertautan silang (''crosslinked'') yang porositasnya dapat diatur sesuai dengan kebutuhan. Untuk memisahkan [[protein]] atau [[asam nukleat]] berukuran kecil ([[DNA]], [[RNA]], atau [[oligonukleotida]]), gel yang digunakan biasanya merupakan gel [[poliakrilamida]], dibuat dengan konsentrasi berbeda-beda antara [[akrilamida]] dan zat yang memungkinkan pertautan silang (''cross-linker''), menghasilkan jaringan poliakrilamida dengan ukuran rongga berbeda-beda. Untuk memisahkan asam nukleat yang lebih besar (lebih besar dari beberapa ratus [[basa]]), gel yang digunakan adalah [[agarosa]] (dari ekstrak [[rumput laut]]) yang sudah dimurnikan.
 
Dalam proses elektroforesis, sampel molekul ditempatkan ke dalam sumur (''well'') pada gel yang ditempatkan di dalam [[larutan penyangga]], dan [[listrik]] dialirkan kepadanya. Molekul-molekul sampel tersebut akan bergerak di dalam matriks gel ke arah salah satu [[kutub listrik]] sesuai dengan [[muatan listrik|muatannya]]. Dalam hal asam nukleat, arah pergerakan adalah menuju [[elektrode]] positif, disebabkan oleh muatan negatif alami pada rangka [[gula]]-[[fosfat]] yang dimilikinya. Untuk menjaga agar laju perpindahan asam nukleat benar-benar hanya berdasarkan ukuran (yaitu panjangnya), zat seperti [[natrium hidroksida]] atau [[formamida]] digunakan untuk menjaga agar asam nukleat berbentuk lurus. Sementara itu, protein didenaturasi dengan [[deterjen]] (misalnya natrium dodesil sulfat, SDS) untuk membuat protein tersebut berbentuk lurus dan bermuatan negatif.
 
Setelah proses elektroforesis selesai, dilakukan proses pewarnaan (''staining'') agar molekul sampel yang telah terpisah dapat dilihat. [[Etidium bromida]], [[perak]], atau pewarna "biru Coomassie" (''Coomassie blue'') dapat digunakan untuk keperluan ini. Jika molekul sampel berpendar dalam sinar [[ultraviolet]] (misalnya setelah "diwarnai" dengan etidium bromida), gel di[[foto]] di bawah sinar ultraviolet. Jika molekul sampel mengandung atom [[radioaktivitas|radioaktif]], [[autoradiogram]] gel tersebut dibuat.
 
Pita-pita (''band'') pada lajur-lajur (''lane'') yang berbeda pada gel akan tampak setelah proses pewarnaan; satu lajur merupakan arah pergerakan sampel dari "sumur" gel. Pita-pita yang berjarak sama dari sumur gel pada akhir elektroforesis mengandung molekul-molekul yang bergerak di dalam gel selama elektroforesis dengan kecepatan yang sama, yang biasanya berarti bahwa molekul-molekul tersebut berukuran sama. "Marka" atau [[penanda genetik|penanda]] (''marker'') yang merupakan campuran molekul dengan ukuran berbeda-beda dapat digunakan untuk menentukan ukuran molekul dalam pita sampel dengan meng-elektroforesis marka tersebut pada lajur di gel yang paralel dengan sampel. Pita-pita pada lajur marka tersebut dapat dibandingkan dengan pita sampel untuk menentukan ukurannya. Jarak pita dari sumur gel berbanding terbalik terhadap [[logaritma]] ukuran molekul.
 
== Lihat pula ==
Baris 45:
* [[Genom]]
* [[Proteom]]
 
== Referensi ==
{{reflist}}
 
== Bacaan lanjutan ==
Baris 52 ⟶ 55:
== Pranala luar ==
* {{en}} [http://plato.stanford.edu/entries/molecular-biology/ Entri tentang biologi molekuler] pada ''Stanford Encyclopedia of Philosophy''
* {{en}} [http://gslc.genetics.utah.edu/units/biotech/gel/ Demonstrasi animasi elektroforesis] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20050308044846/http://gslc.genetics.utah.edu/units/biotech/gel/ |date=2005-03-08 }} dari ''Genetic Science Learning Center'' Universitas Utah, AS
* {{id}} [http://www.eijkman.go.id/app.x/Beranda Lembaga Biologi Molekul Eijkman, Jakarta]{{Pranala mati|date=Februari 2021 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}
 
{{Biologi nav}}
 
[[Kategori:Biologi molekuler| ]]