Pemantauan genetik: Perbedaan antara revisi

'''Pemantauan genetik''' adalah penggunaan pernyataan [[fenotipe]] (misalnya warna bulu dan [[Morfologi (biologi)|morfologi]] kerangka)<ref>{{Cite web|title=Genetic Monitoring|url=http://www.dar.emory.edu/vetcare/genetic_monit.php|website=www.dar.emory.edu|access-date=2021-09-08}}</ref> atau [[penanda genetik]] (''genetic marker'') seperti [[mitokondria]], [[DNA mitokondria|MtDNA]], [[:en:Alloenzyme|alozim,]][[mikrosatelit]], dan SNP (''[[Single nucleotide polymorphism|single-nucleotide polymorphism]]'') untuk mengetahui tingkat kemurnian [[genom]] serta perubahan antropogenik pada populasi alami. Metode pengambilan sampel yang digunakan dalam pemantauan genetik adalah metode MIS (''minimally invasive sampling'').<ref>{{Cite journal|last=Carroll|first=Emma L.|last2=Bruford|first2=Mike W.|last3=DeWoody|first3=J. Andrew|last4=Leroy|first4=Gregoire|last5=Strand|first5=Alan|last6=Waits|first6=Lisette|last7=Wang|first7=Jinliang|date=2018-03-24|title=Genetic and genomic monitoring with minimally invasive sampling methods|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6050181/|journal=Evolutionary Applications|volume=11|issue=7|pages=1094–1119|doi=10.1111/eva.12600|issn=1752-4571|pmc=6050181|pmid=30026800}}</ref>. Pemantauan genetik berperan dalam pendataan perubahan [[Populasi (biologi)|populasi]] dan keanekaragaman [[spesies]] maupun individu. Dalam penelitian, pemantauan genetik digunakan dalam mempersiapkan produksi model penelitian dan pemeliharaan koloni.

Merupakan penggunaan penanda genetik untuk pemantauan [[populasi tradisional]] melalui identifikasi individu, spesies, dan populasi.<ref>{{Cite journal|date=2007-01-01|title=Genetic monitoring as a promising tool for conservation and management|url=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169534706002722|journal=Trends in Ecology & Evolution|language=en|volume=22|issue=1|pages=25–33|doi=10.1016/j.tree.2006.08.009|issn=0169-5347}}</ref>. Dibagi kembali menjadi '''kategori Ia''' untuk mengidentifikasi setiap individu dan '''kategori Ib''' untuk mengidentifikasi spesies dan tingkat [[taksonomi]] yang lebih tinggi.

'''Kategori Ia''' menggunakan penanda genetik mikrosatelit dan SNP (''single-nucleotide polymorphism''). Digunakan dalam (i) penghitungan kelimpahan populasi terutama pada spesies langka dan dilindungi (misalnya ''[https://animaldiversity.org/accounts/Petrogale_penicillata/ Petrogale penicillata]''<ref>{{Cite journal|last=Piggott|first=M. P.|last2=Banks|first2=S. C.|last3=Stone|first3=N.|last4=Banffy|first4=C.|last5=Taylor|first5=A. C.|date=2006|title=Estimating population size of endangered brush-tailed rock-wallaby (Petrogale penicillata) colonies using faecal DNA|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1365-294X.2005.02783.x|journal=Molecular Ecology|language=en|volume=15|issue=1|pages=81–91|doi=10.1111/j.1365-294X.2005.02783.x|issn=1365-294X}}</ref> dan ''[https://ecos.fws.gov/ecp/species/7642 Ursus arctos horribilis]'') dan (ii) ''vital rates,'' seperti laju kehidupan (''survival rate'').<gallery>

Berkas:Grizzly Bear (Ursus arctos ssp.).jpg|''[https://ecos.fws.gov/ecp/species/7642 Ursus arctos horribilis]''

'''Kategori Ib''' menggunakan identifikasi MtDNA, alozim, mikrosatelit, dan SNP (''single-nucleotide polymorphism''). Contoh penggunaan kategori ini adalah dalam mengetahui (i) perubahan jangkauan geografis dan efeknya pada spesies, (ii) persilangan (misalnya persilangan ''[[Bobcat|Lynx rufus]]'' dengan ''[[Lynx kanada|Lynx canadensis]]''<ref>{{Cite journal|last=Schwartz|first=Michael K.|last2=Pilgrim|first2=Kristine L.|last3=McKelvey|first3=Kevin S.|last4=Lindquist|first4=Edward L.|last5=Claar|first5=James J.|last6=Loch|first6=Steve|last7=Ruggiero|first7=Leonard F.|date=2004-06|title=Hybridization Between Canada Lynx and Bobcats: Genetic Results and Management Implications|url=http://dx.doi.org/10.1023/b:coge.0000031141.47148.8b|journal=Conservation Genetics|volume=5|issue=3|pages=349–355|doi=10.1023/b:coge.0000031141.47148.8b|issn=1566-0621}}</ref> dan ''[https://animaldiversity.org/accounts/Strix_occidentalis/ Strix occidentalis]''dengan ''[https://animaldiversity.org/accounts/Strix_varia/ Strix varia]''<ref>{{Cite journal|last=HAIG|first=SUSAN M.|last2=MULLINS|first2=THOMAS D.|last3=FORSMAN|first3=ERIC D.|last4=TRAIL|first4=PEPPER W.|last5=WENNERBERG|first5=LIV|date=2004-10|title=Genetic Identification of Spotted Owls, Barred Owls, and Their Hybrids: Legal Implications of Hybrid Identity|url=http://dx.doi.org/10.1111/j.1523-1739.2004.00206.x|journal=Conservation Biology|volume=18|issue=5|pages=1347–1357|doi=10.1111/j.1523-1739.2004.00206.x|issn=0888-8892}}</ref>), serta (iii) mengidentifikasi penularan dan prevalensi parasit dan organisme [[patogen]] lainnya.<gallery>

=== '''Kategori II parameter populasi genetik''' ===

Merupakan penggunaan penanda genetik (MtDNA, alozim, mikrosatelit, dan SNP) untuk memantau parameter genetik populasi. Contoh penggunaan kategori II adalah untuk mengetahui (i) variasi genetik, (ii) demografi populasi di alam liar maupun di penangkaran untuk mengetahui status [[konservasi]], (iii) analisis proporsi individu dalam populasi campuran (''mixed-stock''), (iv) melihat aliran gen, (v) identifikasi ukuran populasi efektif (misal pada ''[[:en:Brown_trout|Salmo trutta]]''<ref>{{Cite journal|last=Palm|first=Stefan|date=2003|title=Effective population size and temporal genetic change in stream resident brown trout (Salmo trutta, L.)|url=http://link.springer.com/10.1023/A:1024064913094|journal=Conservation Genetics|volume=4|issue=3|pages=249–264|doi=10.1023/A:1024064913094}}</ref>), serta (vi) analisis stuktur populasi dan [[migrasi]].<gallery>