Replikasi DNA: Perbedaan antara revisi

 

== Garpu replikasi ==

 

DNA polimerase membentuk untaian DNA baru dengan menambahkan nukleotida—dalam hal ini, deoksiribonukleotida—ke ujung 3'-hidroksil bebas nukleotida rantai DNA yang sedang tumbuh. Dengan kata lain, rantai DNA baru disintesis dari arah 5'→3', sedangkan DNA polimerase bergerak pada DNA "induk" dengan arah 3'→5'. Namun demikian, salah satu untaian DNA induk pada garpu replikasi berorientasi 3'→5', sementara untaian lainnya berorientasi 5'→3', dan helikase bergerak membuka untaian rangkap DNA dengan arah 5'→3'. Oleh karena itu, replikasi harus berlangsung pada kedua arah berlawanan tersebut.<ref>{{Cite book|last=Lengeler|first=Joseph W.|last2=Drews|first2=Gerhart|last3=Schlegel|first3=Hans Günter|date=1999|url=https://books.google.co.id/books?id=MiwpFtTdmjQC&pg=PA347&dq=dna+replication+direction&hl=en&sa=X&ved=2ahUKEwiAoKrQ16rtAhXQc30KHdzpAlYQ6AEwBnoECAcQAg#v=onepage&q&f=false|title=Biology of the Prokaryotes|location=|publisher=Georg Thieme Verlag|isbn=978-3-13-108411-8|pages=347|language=en|url-status=live}}</ref>

Berhubung dengan kompleksitas struktur [[kromatin]], garpu replikasi pada eukariota bergerak hanya dengan kecepatan 50 pb tiap detik. Sebelum melakukan penyalinan, DNA harus dilepaskan dari [[nukleosom]] pada garpu replikasi sehingga gerakan garpu replikasi akan diperlambat menjadi sekitar 50 pb tiap detik. Dengan kecepatan seperti ini diperlukan waktu sekitar 30 hari untuk menyalin molekul DNA kromosom pada kebanyakan [[mamalia]].

 

 

Seperti halnya pada prokariota, satu atau beberapa DNA helikase dan Ssb yang disebut dengan protein replikasi A atau ''replication protein'' A (RP-A) diperlukan untuk memisahkan kedua untai DNA. Selanjutnya, tiga DNA polimerase yang berbeda terlibat dalam elongasi. Untai pengarah dan masing-masing fragmen untai tertinggal diinisiasi oleh RNA primer dengan bantuan aktivitas primase yang merupakan bagian integral enzim DNA polimerase a. Enzim ini akan meneruskan [[elongasi]] replikasi tetapi kemudian segera digantikan oleh DNA polimerase d pada untai pengarah dan DNA polimerase e pada untai tertinggal. Baik DNA polimerase d maupun e mempunyai fungsi penyuntingan. Kemampuan DNA polimerase d untuk menyintesis DNA yang panjang disebabkan oleh adanya [[antigen]] perbanyakan nuklear sel atau proliferating cell nuclear antigen (PCNA), yang fungsinya setara dengan subunit b holoenzim DNA polimerase III pada ''E. coli''. Selain terjadi penggandaan DNA, kandungan [[histon]] di dalam sel juga mengalami penggandaan selama fase S.

Ujung kromosom linier tidak dapat direplikasi sepenuhnya karena tidak ada DNA yang dapat menggantikan RNA primer yang dibuang dari ujung 5’ untai tertinggal. Dengan demikian, informasi genetik dapat hilang dari DNA. Untuk mengatasi hal ini, ujung kromosom eukariota (telomer) mengandung beratus-ratus sekuens repetitif sederhana yang tidak berisi informasi genetik dengan ujung 3’ melampaui ujung 5’. Enzim telomerase mengandung molekul RNA pendek, yang sebagian sekuensnya komplementer dengan sekuens repetitif tersebut. RNA ini akan bertindak sebagai cetakan (templat) bagi penambahan sekuens repetitif pada ujung 3’.<ref>{{Cite book|last=Pellegrini|first=Marco|last2=Magi|first2=Alberto|last3=Iliopoulos|first3=Costas S.|date=2016-10-27|url=https://books.google.co.id/books?id=9cS0DQAAQBAJ&pg=PA17&dq=repetitive+sequence&hl=en&sa=X&ved=2ahUKEwjL7-K72artAhWB_XMBHXSvACkQ6AEwAHoECAQQAg#v=onepage&q&f=false|title=Repetitive Structures in Biological Sequences: Algorithms and Applications|location=|publisher=Frontiers Media SA|isbn=978-2-88945-018-3|pages=17|language=en|url-status=live}}</ref>

 

 

== Pengaturan replikasi ==