Farmakogenomik: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Rescuing 1 sources and tagging 0 as dead.) #IABot (v2.0.9.5 |
|||
| (5 revisi perantara oleh 3 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 1:
'''Farmakogenomik''' adalah studi tentang peran [[genom]] dalam respons obat. Bidang farmakogenomik menyelidiki bagaimana informasi genetik seseorang memengaruhi reaksinya terhadap obat.<ref>{{Cite book|vauthors=Ermak G|year=2015|title=Emerging Medical Technologies|publisher=World Scientific|isbn=978-981-4675-80-2}}</ref> Istilah ini merupakan kombinasi dari [[farmakologi]] dan [[Genomika|genomik]]. Dengan memeriksa [[mutasi]] DNA seperti [[polimorfisme nukleotida tunggal]] (SNP), variasi jumlah salinan, dan [[Indel|insersi/penghapusan]], farmakogenomik bertujuan untuk memahami bagaimana variasi genetik, baik yang diwariskan maupun yang didapat, dapat berdampak pada respons obat. Analisis ini melibatkan studi aspek [[Farmakokinetika|farmakokinetik]] ([[Absorbsi obat|penyerapan]], distribusi, [[metabolisme obat]], dan ekskresi obat), efek [[farmakodinamik]] (bagaimana obat berinteraksi dengan [[target biologis]]), dan/atau titik akhir imunogenik.<ref name="pmid14585618">{{Cite journal|date=November 2003|title=Pharmacogenetics: potential for individualized drug therapy through genetics|url=https://archive.org/details/sim_trends-in-genetics_2003-11_19_11/page/660|journal=Trends in Genetics|volume=19|issue=11|pages=660–666|doi=10.1016/j.tig.2003.09.008|pmid=14585618|vauthors=Johnson JA}}</ref><ref name="UNC Center for Pharmacogenomics and Individualized Therapy">{{Cite news|title=Center for Pharmacogenomics and Individualized Therapy|url=https://pharmacy.unc.edu/research/centers/cpit/|work=Unc Eshelman School of Pharmacy|access-date=2014-06-25|archive-date=2015-07-02|archive-url=https://web.archive.org/web/20150702034039/http://pharmacy.unc.edu/research/centers/cpit/|dead-url=no}}</ref><ref>{{Cite web|date=May 16, 2014|title=overview of pharmacogenomics|url=http://www.uptodate.com/contents/overview-of-pharmacogenomics|publisher=Up-to-Date|access-date=2014-06-25|archive-date=2011-11-19|archive-url=https://web.archive.org/web/20111119003731/http://www.uptodate.com/contents/overview-of-pharmacogenomics|dead-url=no}}</ref> Farmakogenomik mengintegrasikan beberapa disiplin ilmu seperti, ilmu genetik, [[Ilmu Farmasi|ilmu farmasi]], [[ilmu kedokteran]], biologi dan [[Bioinformatika|bioinformatik]]. Penyatuan dari berbagai disiplin ilmu membuat farmakogenomik menjadi studi yang kompleks.<ref>{{Cite journal|last=Holtzman|first=Neil A.|last2=Marteau|first2=Theresa M.|date=2000-07-13|title=Will Genetics Revolutionize Medicine?|url=http://dx.doi.org/10.1056/nejm200007133430213|journal=New England Journal of Medicine|volume=343|issue=2|pages=141–144|doi=10.1056/nejm200007133430213|issn=0028-4793|access-date=2023-03-04|archive-date=2023-07-18|archive-url=https://web.archive.org/web/20230718000202/https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJM200007133430213|dead-url=no}}</ref>
Farmakogenomik bertujuan untuk meningkatkan terapi obat dengan mempertimbangkan [[Genotipe|susunan genetik]] pasien untuk mencapai pengobatan yang paling efektif dengan [[efek samping]] yang paling sedikit.<ref name="pmid19530963">{{Cite journal|date=June 2009|title=Pharmacogenomics of adverse drug reactions: practical applications and perspectives|journal=Pharmacogenomics|volume=10|issue=6|pages=961–969|doi=10.2217/pgs.09.37|pmid=19530963|vauthors=Becquemont L}}</ref> Bidang ini berusaha untuk beralih dari pendekatan "satu dosis untuk semua" (one-dose-fits-all) terhadap [[Medikasi|obat-obatan]], dan menghilangkan kebutuhan untuk mencoba-coba dalam meresepkan obat. Dengan mempertimbangkan gen pasien dan fungsinya, farmakogenomik dapat memberikan alasan kegagalan pengobatan di masa lalu,<ref name="pmid19565025">{{Cite journal|date=May 2009|title=Clinical use of pharmacogenomic tests in 2009|journal=The Clinical Biochemist. Reviews|volume=30|issue=2|pages=55–65|pmc=2702214|pmid=19565025|vauthors=Sheffield LJ, Phillimore HE}}</ref><ref name=":2">{{Cite journal|date=January 2018|title=Pharmacogenomics of GPCR Drug Targets|journal=Cell|volume=172|issue=1–2|pages=41–54.e19|doi=10.1016/j.cell.2017.11.033|pmc=5766829|pmid=29249361|vauthors=Hauser AS, Chavali S, Masuho I, Jahn LJ, Martemyanov KA, Gloriam DE, Babu MM}}</ref> dan mengoptimalkan obat dan kombinasi untuk kelompok pasien tertentu atau bahkan profil genetik individu yang unik. Pendekatan pengobatan presisi ini menawarkan potensi untuk rencana [[Obat presisi|pengobatan yang dipersonalisasi]] yang disesuaikan dengan kebutuhan setiap pasien.<ref>{{Cite web|date=March 2005|title=Guidance for Industry Pharmacogenomic Data Submissions|url=https://www.fda.gov/downloads/RegulatoryInformation/Guidances/ucm126957.pdf|publisher=[[U.S. Food and Drug Administration]]|access-date=2008-08-27|archive-date=2016-10-06|archive-url=https://web.archive.org/web/20161006210237/http://www.fda.gov/downloads/RegulatoryInformation/Guidances/ucm126957.pdf|dead-url=no}}</ref><ref name="Squassina2010">{{Cite journal|displayauthors=6|date=August 2010|title=Realities and expectations of pharmacogenomics and personalized medicine: impact of translating genetic knowledge into clinical practice|journal=Pharmacogenomics|volume=11|issue=8|pages=1149–1167|doi=10.2217/pgs.10.97|pmid=20712531|vauthors=Squassina A, Manchia M, Manolopoulos VG, Artac M, Lappa-Manakou C, Karkabouna S, Mitropoulos K, Del Zompo M, Patrinos GP}}</ref>
== Sejarah ==
Farmakogenomik memiliki sejarah yang panjang, dengan pengenalan awal sejak [[Pythagoras]] pada 510 SM yang menghubungkan bahaya mengonsumsi [[Kara oncet|kacang fava]] dengan [[anemia hemolitik]] dan [[stres oksidatif]]. Pada 1950-an, hubungan ini divalidasi dan dikaitkan dengan defisiensi [[Glukosa-6-fosfat dehidrogenase|G6PD]], yang dinamai favisme.<ref name="pmid11678777">{{Cite journal|date=October 2001|title=Pharmacogenetics and pharmacogenomics|journal=British Journal of Clinical Pharmacology|volume=52|issue=4|pages=345–347|doi=10.1046/j.0306-5251.2001.01498.x|pmc=2014592|pmid=11678777|vauthors=Pirmohamed M}}</ref><ref name="pmid22461095">{{Cite journal|date=January 2009|title=Role of regulatory agencies in translating pharmacogenetics to the clinics|journal=Clinical Cases in Mineral and Bone Metabolism|volume=6|issue=1|pages=29–34|pmc=2781218|pmid=22461095|vauthors=Prasad K}}</ref> Meskipun publikasi resmi pertama tidak terjadi hingga 1961,<ref name="Evans_1961">{{Cite journal|date=September 1961|title=Pharmacogenetics|journal=British Medical Bulletin|volume=17|issue=3|pages=234–240|doi=10.1093/oxfordjournals.bmb.a069915|pmid=13697554|vauthors=Evans DA, Clarke CA}}</ref> awal dari bidang ini terlihat jelas pada 1950-an dengan laporan kelumpuhan yang berkepanjangan dan reaksi fatal pada pasien yang kekurangan butirilkolinesterase setelah injeksi [[suksinilkolin]] selama anestesi.<ref name="pmid145856182">{{Cite journal|date=November 2003|title=Pharmacogenetics: potential for individualized drug therapy through genetics|url=https://archive.org/details/sim_trends-in-genetics_2003-11_19_11/page/660|journal=Trends in Genetics|volume=19|issue=11|pages=660–666|doi=10.1016/j.tig.2003.09.008|pmid=14585618|vauthors=Johnson JA}}</ref><ref name="pmid16415920">{{Cite journal|year=2006|title=Pharmacogenetics and pharmacogenomics: origin, status, and the hope for personalized medicine|journal=The Pharmacogenomics Journal|volume=6|issue=3|pages=162–165|doi=10.1038/sj.tpj.6500361|pmid=16415920|vauthors=Kalow W}}</ref>
Istilah farmakogenetik diciptakan pada 1959 oleh [[Friedrich Vogel]],<ref>{{Cite journal|date=1959|title=Moderne probleme der humangenetik.|trans-title=Modern human genetics problems|journal=Ergebnisse der Inneren Medizin und Kinderheilkunde|language=German|location=Berlin, Heidelberg|publisher=Springer|pages=52–125|vauthors=Vogel F}}</ref> dan penelitian kembar pada akhir 1960-an mendukung gagasan keterlibatan genetik dalam [[metabolisme obat]].<ref name="pmid16421980">{{Cite journal|date=February 2006|title=Pharmacogenetics, pharmacogenomics and ecogenetics|journal=Journal of Zhejiang University. Science. B|volume=7|issue=2|pages=169–170|doi=10.1631/jzus.2006.B0169|pmc=1363768|pmid=16421980|vauthors=Motulsky AG, Qi M}}</ref> Istilah farmakogenomik mulai muncul pada tahun 1990-an,<ref name="pmid11678777" /> dan persetujuan FDA pertama untuk tes farmakogenetik diberikan pada 2005 untuk alel dalam CYP2D6 dan CYP2C19.
Baris 11:
Istilah ''farmakogenomik'' dan ''farmakogenetik'' berkaitan dengan pengaruh genetika terhadap respons obat, tetapi keduanya tidak sepenuhnya dapat dipertukarkan. '''Farmakogenomik''' mengambil pendekatan yang lebih komprehensif, yang melibatkan hubungan seluruh genom dan menggabungkan genomik dan [[Epigenetika|epigenetik]] untuk memeriksa efek beberapa gen atau bahkan [[kromosom]] pada respons obat.<ref name="pmid195650252">{{Cite journal|date=May 2009|title=Clinical use of pharmacogenomic tests in 2009|journal=The Clinical Biochemist. Reviews|volume=30|issue=2|pages=55–65|pmc=2702214|pmid=19565025|vauthors=Sheffield LJ, Phillimore HE}}</ref><ref name="pmid19299369">{{Cite journal|date=April 2009|title=Pharmacogenetics: from discovery to patient care|journal=American Journal of Health-System Pharmacy|volume=66|issue=7|pages=625–637|doi=10.2146/ajhp080170|pmid=19299369|vauthors=Shin J, Kayser SR, Langaee TY}}</ref><ref name="Pharmacogenetics and Pharmacogenomics Factsheet.">{{Cite web|title=Center for Genetics Education|url=http://www.genetics.edu.au/Publications-and-Resources/Genetics-Fact-Sheets/pharmacogenetics-pharmacogenomics=2014-09-03}}{{Pranala mati}}</ref> Farmakogenomik juga mempertimbangkan bagaimana perbedaan [[Genetika|genetik]] yang diwariskan dalam jalur [[metabolisme obat]], enzim, pembawa pesan, dan reseptor dapat memengaruhi efek terapeutik dan [[Efek samping|efek obat yang merugikan]].<ref name="Klotz-2007">{{Cite journal|year=2007|title=The role of pharmacogenetics in the metabolism of antiepileptic drugs: pharmacokinetic and therapeutic implications|journal=Clinical Pharmacokinetics|volume=46|issue=4|pages=271–279|doi=10.2165/00003088-200746040-00001|pmid=17375979|vauthors=Klotz U}}</ref>
Di sisi lain, '''farmakogenetik''' mempelajari obat dengan fokus pengaruh faktor genetik pada metabolisme dan efek obat.<ref>{{Cite web|first=Humas UGM|date=20 Agustus 2008|title=Farmakogenetik dan Farmakogenomik Mestinya Menjadi Paradigma Baru Dalam Terapi Obat|url=https://www.ugm.ac.id/id/berita/418-farmakogenetik-dan-farmakogenomik-mestinya-menjadi-paradigma-baru-dalam-terapi-obat#:~:text=Farmakogenetik%20dan%20farmakogenomik%20merupakan%20cabang,maupun%20tumbuhan%20dan%20jasad%20renik.|publisher=Universitas Gadjah Mada|access-date=5 Maret 2023|archive-date=2023-05-10|archive-url=https://web.archive.org/web/20230510203136/https://www.ugm.ac.id/id/berita/418-farmakogenetik-dan-farmakogenomik-mestinya-menjadi-paradigma-baru-dalam-terapi-obat#:~:text=Farmakogenetik%20dan%20farmakogenomik%20merupakan%20cabang,maupun%20tumbuhan%20dan%20jasad%20renik.|dead-url=no}}</ref> Farmakogenetika berfokus pada interaksi gen-obat tunggal, dengan mempertimbangkan gen alel, [[Gen dominan|dominasi]], dan [[polimorfisme gen]] untuk lebih memahami penggunaan obat pada masing-masing pasien atau populasi.
== Mekanisme interaksi farmakogenetik ==
Baris 17:
=== Pengangkut obat (transporter) ===
Transporter memainkan peran penting dalam pergerakan banyak obat melintasi membran sel, yang memungkinkannya untuk melakukan perjalanan di antara kompartemen cairan tubuh yang berbeda seperti darah, lumen usus, empedu, urin, otak, dan cairan serebrospinal.<ref name=":1">{{Cite journal|date=January 2015|title=What do drug transporters really do?|journal=Nature Reviews. Drug Discovery|volume=14|issue=1|pages=29–44|doi=10.1038/nrd4461|pmc=4750486|pmid=25475361|vauthors=Nigam SK}}</ref> Jenis utama transporter meliputi pembawa zat terlarut, [[
=== Enzim-enzim pemetabolisme ===
Sebagian besar variasi farmakogenetik yang relevan secara klinis ditemukan pada gen yang memproduksi enzim pemetabolisme obat, yang mencakup [[metabolisme obat]] fase I dan fase II. Enzim [[sitokrom P450]] sangat penting untuk metabolisme banyak obat dan memiliki tingkat polimorfisme yang tinggi.
Enzim pemetabolisme obat lain yang telah dikaitkan dengan interaksi farmakogenetik termasuk UGT1A1, yang menghasilkan [[Glukuronosiltransferase|UDP-glukuronosiltransferase]], serta DPYD dan TPMT.<ref name=":0">{{Cite web|title=Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium|url=https://cpicpgx.org/|website=cpicpgx.org|language=en-US|access-date=2022-12-13|archive-date=2023-07-01|archive-url=https://web.archive.org/web/20230701123758/https://cpicpgx.org/|dead-url=no}}</ref>
=== Reseptor ===
[[Reseptor (biokimia)|Reseptor]] adalah molekul pada permukaan sel atau di dalam sel yang berikatan dengan obat atau ligan tertentu, yang memulai sinyal yang mengarah pada efek terapeutik yang diinginkan. Variasi genetik dapat memengaruhi ekspresi atau aktivitas reseptor, atau mengubah afinitas pengikatan antara obat dan targetnya, yang menyebabkan perbedaan respons obat. Variasi genetik dapat menghasilkan jumlah reseptor yang lebih tinggi atau lebih rendah, yang dapat memengaruhi tingkat respons obat. Atau, variasi genetik dapat menyebabkan perubahan struktur reseptor itu sendiri, yang memengaruhi cara reseptor berikatan dengan obat atau mengubah jalur pensinyalan hilir yang dimulai. Dalam beberapa kasus, variasi genetik dapat menyebabkan hilangnya fungsi reseptor, sehingga tidak efektif sebagai target obat.
Gen ''VKORC1'' bertanggung jawab untuk memproduksi ''vitamin K epoksida reduktase kompleks subunit 1'', yang merupakan target warfarin, suatu obat antikoagulan.<ref name="pmid21507031">{{Cite journal|displayauthors=6|date=April 2012|title=Clinical relevance of VKORC1 (G-1639A and C1173T) and CYP2C9*3 among patients on warfarin|journal=Journal of Clinical Pharmacy and Therapeutics|volume=37|issue=2|pages=232–236|doi=10.1111/j.1365-2710.2011.01262.x|pmid=21507031|vauthors=Teh LK, Langmia IM, Fazleen Haslinda MH, Ngow HA, Roziah MJ, Harun R, Zakaria ZA, Salleh MZ}}</ref> Warfarin bekerja dengan menghambat VKOR, yang dikodekan oleh gen VKORC1, sehingga mengurangi jumlah faktor pembekuan aktif dalam darah. Namun demikian, variasi genetik pada gen VKORC1 dapat memengaruhi efektivitas terapi warfarin.<ref name="tableFDA">{{Cite web|last=U.S. Food and Drug Administration (FDA)|title=Table of Pharmacogenomic Biomarkers in Drug Labels.|url=https://www.fda.gov/drugs/scienceresearch/researchareas/pharmacogenetics/ucm083378.htm|website=[[Food and Drug Administration]]|access-date=2014-09-03|archive-date=2017-08-22|archive-url=https://web.archive.org/web/20170822051354/https://www.fda.gov/Drugs/ScienceResearch/ResearchAreas/Pharmacogenetics/ucm083378.htm|dead-url=no}}</ref>
Polimorfisme genetik tertentu pada VKORC1 dapat memengaruhi produksi atau aktivitas VKOR, yang menyebabkan perbedaan kebutuhan dosis warfarin dan peningkatan risiko komplikasi perdarahan. Sebagai contoh, SNP yang dikenal sebagai rs9923231, yang terletak di wilayah promotor gen VKORC1, telah terbukti terkait dengan ekspresi VKORC1 yang lebih rendah dan peningkatan kepekaan terhadap warfarin. SNP ini telah dikaitkan dengan risiko perdarahan yang lebih tinggi pada pasien yang menggunakan warfarin.
Baris 37:
== Penerapan ==
Farmakogenomik memiliki berbagai penerapan, termasuk meningkatkan keamanan obat dengan mengurangi reaksi obat yang tidak diinginkan (ADR), menyesuaikan perawatan agar sesuai dengan kecenderungan genetik spesifik pasien untuk mengidentifikasi dosis yang optimal, dan meningkatkan penemuan obat yang menargetkan penyakit pada manusia. Hal ini juga dapat meningkatkan bukti prinsip (''proof of principle'') untuk uji efikasi.<ref>{{cite book|vauthors=Cohen N|date=November 2008|title=Pharmacogenomics and Personalized Medicine (Methods in Pharmacology and Toxicology)|url=https://archive.org/details/pharmacogenomics0000unse_r4d0|location=Totowa, NJ|publisher=Humana Press|isbn=978-1934115046|page=[https://archive.org/details/pharmacogenomics0000unse_r4d0/page/6 6]}}</ref>
=== Penerapan pada bidang onkologi ===
Baris 43:
=== Penerapan pada bidang psikiatri ===
Dalam bidang psikiatri, penelitian farmakogenomik telah difokuskan pada beberapa gen, tetapi dua yang paling banyak dipelajari pada tahun 2010 adalah 5-HTTLPR dan DRD2. 5-HTTLPR adalah variasi dalam gen transporter serotonin yang telah dikaitkan dengan berbagai gangguan kejiwaan, termasuk depresi, kecemasan, dan gangguan stres pascatrauma. DRD2 adalah gen yang mengkode reseptor dopamin D2, yang terlibat dalam jalur penghargaan dan motivasi di otak. Variasi pada DRD2 telah dikaitkan dengan kecanduan, [[skizofrenia]], dan gangguan kejiwaan lainnya.<ref>{{cite journal|year=2010|title=The state of pharmacogenetics|url=http://www.psychiatrictimes.com/neuropsychiatry/content/article/10168/1550787|journal=Psychiatr Times|volume=27|issue=4|pages=38–41, 62|vauthors=Malhotra AK|access-date=2023-04-30|archive-date=2012-08-25|archive-url=https://web.archive.org/web/20120825025928/http://www.psychiatrictimes.com/neuropsychiatry/content/article/10168/1550787|dead-url=yes}}</ref>
Pada sebuah laporan kasus pasien A menyoroti tantangan dalam mengobati skizofrenia dan potensi manfaat pengujian farmakogenomik dalam meningkatkan hasil pengobatan. Pasien A awalnya diobati dengan kombinasi obat, tetapi mengalami efek samping termasuk pusing, sedasi, keringat berlebih, takikardia, penambahan berat badan, dan [[halusinasi]]. Selama beberapa bulan, pasien beralih ke obat lainnya, tetapi terus mengalami efek samping seperti kekakuan otot, berputar-putar, tremor, berkeringat di malam hari, dan kesulitan berjalan.
Setelah dilakukan tes farmakogenomik, ditemukan bahwa
=== Penerapan pada bidang kardiovaskular ===
Gangguan kardiovaskular terutama difokuskan pada respons obat, termasuk [[warfarin]], clopidogrel, penghambat beta, dan statin.<ref name=":2" /> Pasien dengan CYP2C19 yang mengonsumsi clopidogrel memiliki risiko kardiovaskular yang lebih tinggi, yang mengakibatkan adanya pembaruan pada liflet obat oleh pihak regulator.<ref>{{cite book|vauthors=Dean L|year=2012|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK61999/|title=Medical Genetics Summaries|publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI)|veditors=Pratt VM, McLeod HL, Rubinstein WS, Scott SA, Dean LC, Kattman BL, Malheiro AJ|chapter=Clopidogrel Therapy and CYP2C19 Genotype|pmid=28520346|id=Bookshelf ID: NBK84114|display-editors=3|chapter-url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK84114/|access-date=2023-04-30|archive-date=2020-10-26|archive-url=https://web.archive.org/web/20201026145821/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK61999/|dead-url=no}}</ref> Pada pasien dengan diabetes tipe 2, genotipe haptoglobin (Hp) telah menunjukkan dampak pada penyakit kardiovaskular, dengan genotipe Hp2-2 yang terkait dengan risiko yang lebih tinggi.<ref>{{cite journal|date=2018|title=Precision Healthcare of Type 2 Diabetic Patients Through Implementation of Haptoglobin Genotyping|journal=Frontiers in Cardiovascular Medicine|volume=5|pages=141|doi=10.3389/fcvm.2018.00141|pmc=6198642|pmid=30386783|vauthors=Bale BF, Doneen AL, Vigerust DJ|doi-access=free}}</ref>
== Referensi ==
| |||