Mikrobiologi Tanah: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Menambah isi artikel |
penambahan gambar dan perbaikan kalimat |
||
(2 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan) | |||
Baris 1:
[[Berkas:Stagnogley.JPG|jmpl|Lapisan tanah]]
'''Mikrobiologi tanah'''
▲'''Mikrobiologi tanah''' adalah cabang ilmu pengetahuan dari subdisiplin [[mikrobiologi lingkungan]] yang meneliti seluruh aspek biologis mikroorganisme ([[bakteri]], [[archaea]], [[virus]], [[jamur]], [[parasit]], dan [[protozoa]]) yang mendiami [[ekosistem]] [[tanah]].<ref>{{Cite web|title=Soil microbiology - Latest research and news {{!}} Nature|url=https://www.nature.com/subjects/soil-microbiology|website=www.nature.com|access-date=2024-02-20}}</ref> Bakteri dan jamur, memegang kendali atas fungsi [[ekosistem]] melalui proses [[dekomposisi]] dan siklus [[nutrisi]] dan dapat berperan sebagai indikator perubahan penggunaan lahan dan kesehatan ekosistem. [[Habitat]] tanah digambarkan sebagai matriks kompleks dengan pori-pori dan [[Agregat (komposit)|agregat]] dengan ukuran berbeda. [[Rizosfer]] menjadi tempat berkumpul bakteri dan jamur tertentu yang dapat memanfaatkan gula yang dikeluarkan oleh akar tanaman atau bahkan bersimbiosis mutualistik dengan berasosiasi secara fisik dengan sistem akar tanaman dan bertukar serta nutrisi , interkasi tersebut dapat dilihat pada [[mikoriza]] dan [[tanaman]]. [[Komunitas tanah]] dan habitatnya dipengaruhi oleh suhu, kelembaban, keasaman atau alkalinitas tanah ([[pH]]).<ref name=":0">{{Cite book|last=Dixon|first=Geoffrey R.|last2=Tilston|first2=Emma L.|date=2010-09-08|url=https://books.google.co.id/books/about/Soil_Microbiology_and_Sustainable_Crop_P.html?id=5EzVHWiHjVMC&redir_esc=y|title=Soil Microbiology and Sustainable Crop Production|publisher=Springer Science & Business Media|isbn=978-90-481-9479-7|language=en}}</ref> Mikroba tanah memiliki peran ganda dalam ekosistem, mereka memberikan kontribusi positif yang fundamental bagi kesehatan tanah, tanaman bahkan manusia. Namun, dalam kondisi tertentu, mikroba tanah dapat menimbulkan dampak negatif yang perlu diwaspadai.
[[Berkas:Bacillus anthracis Gram.jpg|jmpl|Penampang mikroskopis bakteri ''Bacillus'']]
Tanaman menunjukkan berbagai interaksi dengan organisme tanah, seperti simbiosis mutualistik dengan jamur mikoriza dan bakteri pengikat
== Rhizobakteri pemacu pertumbuhan tanaman ==
▲== Hubungan Mikroba Tanah dengan Tumbuhan ==
[[Berkas:
Rhizobakteri pemacu pertumbuhan tanaman atau ''Plant Growth-Promoting Rhizobacteria'' (PGPR)
▲Tanaman menunjukkan berbagai interaksi dengan organisme tanah, seperti simbiosis mutualistik dengan jamur mikoriza dan bakteri pengikat nitrogen pada kacang-kacangan. Interaksi ini telah dimanfaatkan manusia sejak lama, seperti pelapisan benih dengan bakteri seperti ''Azotobacter chroococcum'' atau ''Bacillus megaterium'' untuk meningkatkan pertumbuhan tanaman. Sejak tahun 1980-an, berbagai strain bakteri, seperti ''Pseudomonas'' dan ''Azospirillum'', telah terbukti dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman.<ref>{{Cite journal|last=Jacoby|first=Richard|last2=Peukert|first2=M|last3=Succurro|first3=A|last4=Koprivova|first4=A|last5=Kopriva|first5=S|date=2017|title=The Role of Soil Microorganisms in Plant Mineral Nutrition—Current Knowledge and Future Directions|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5610682/|journal=Front Plant Sci|volume=8|issue=1617|doi=10.3389/fpls.2017.01617}}</ref><ref>{{Cite book|last=Morton|first=Alan G.|date=1981|url=https://books.google.com/books?id=_toPAQAAMAAJ&newbks=0&printsec=frontcover&dq=History+of+Botanical+Science.+An+account+of+the+development+of+botany+from+ancient+times+to+the+present+day.&q=History+of+Botanical+Science.+An+account+of+the+development+of+botany+from+ancient+times+to+the+present+day.&hl=id|title=History of Botanical Science: An Account of the Development of Botany from Ancient Times to the Present Day|publisher=Academic Press|isbn=978-0-12-508380-5|language=en}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Brown|first=M E|date=1974-09|title=Seed and Root Bacterization|url=https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.py.12.090174.001145|journal=Annual Review of Phytopathology|language=en|volume=12|issue=1|pages=181–197|doi=10.1146/annurev.py.12.090174.001145|issn=0066-4286}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Burr|first=T. J.|date=1978|title=Increased Potato Yields by Treatment of Seedpieces with Specific Strains of Pseudomonas fluorescens and P. putida|url=http://dx.doi.org/10.1094/phyto-68-1377|journal=Phytopathology|volume=68|issue=9|pages=1377|doi=10.1094/phyto-68-1377|issn=0031-949X}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Teintze|first=Martin|last2=Hossain|first2=M. B.|last3=Barnes|first3=C. L.|last4=Leong|first4=John|last5=Van der Helm|first5=Dick|date=1981-10-01|title=Structure of ferric pseudobactin: a siderophore from a plant growth promoting Pseudomonas|url=https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi00525a025|journal=Biochemistry|language=en|volume=20|issue=22|pages=6446–6457|doi=10.1021/bi00525a025|issn=0006-2960}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Lin|first=Willy|last2=Okon|first2=Yaacov|last3=Hardy|first3=Ralph W. F.|date=1983-06|title=Enhanced Mineral Uptake by Zea mays and Sorghum bicolor Roots Inoculated with Azospirillum brasilense|url=https://journals.asm.org/doi/10.1128/aem.45.6.1775-1779.1983|journal=Applied and Environmental Microbiology|language=en|volume=45|issue=6|pages=1775–1779|doi=10.1128/aem.45.6.1775-1779.1983|issn=0099-2240|pmc=PMC242537|pmid=16346311}}</ref> Mikroorganisme tanah berperan dalam [[dekomposisi]] bahan organik. Mikroorganisme tersebut memperoleh energi dan nutrisi dari beragam molekul dalam bahan organik tanah (BOT). Proses dekomposisi memegang peranan penting dalam penggunaan dan daur ulang nutrisi yang efisien dalam ekosistem terkelola, pertanian, semi-alami, dan alami pada proses ini biomolekul kompleks didegradasi menjadi bioelemen seperti nitrogen (N) dan dilepaskan dalam bentuk yang tersedia bagi tanaman.<ref name=":0" /> Mikroorganisme tanah yang hidup di lingkungan kaya karbon dapat menghasilkan eksudat akar, karbon organik volatil, dan rhizodeposisi kimiawi. Eksudat akar ini berbeda-beda antar spesies tanaman, sehingga mikrobioma rizosfer (komunitas mikroba di sekitar akar) pun berbeda-beda. Eksudat ini mengandung berbagai macam senyawa organik, seperti gula, asam amino, asam organik, nukleotida, flavonoid, zat antibakteri, dan enzim.<ref>{{Cite book|date=2004-01-11|url=http://dx.doi.org/10.1201/9781482280128-14|title=Interactions between Microorganisms|publisher=CRC Press|pages=174–204}}</ref><ref>{{Cite web|title=Effect of Lime and Rice Husk Ash on Index Properties of Black Cotton Soil.|url=https://paper.researchbib.com/view/paper/16290|website=paper.researchbib.com|access-date=2024-02-21}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Somers|first=E.|last2=Vanderleyden|first2=J.|last3=Srinivasan|first3=M.|date=2004-01|title=Rhizosphere Bacterial Signalling: A Love Parade Beneath Our Feet|url=http://dx.doi.org/10.1080/10408410490468786|journal=Critical Reviews in Microbiology|volume=30|issue=4|pages=205–240|doi=10.1080/10408410490468786|issn=1040-841X}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Fiehn|first=Oliver|last2=Wohlgemuth|first2=Gert|last3=Scholz|first3=Martin|last4=Kind|first4=Tobias|last5=Lee|first5=Do Yup|last6=Lu|first6=Yun|last7=Moon|first7=Stephanie|last8=Nikolau|first8=Basil|date=2008-02|title=Quality control for plant metabolomics: reporting MSI‐compliant studies|url=http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313x.2007.03387.x|journal=The Plant Journal|volume=53|issue=4|pages=691–704|doi=10.1111/j.1365-313x.2007.03387.x|issn=0960-7412}}</ref><ref>{{Cite book|date=2005-01-06|url=http://dx.doi.org/10.1201/9781482280302-16|title=Biological Control of Soil-borne Sclerotial Pathogens using Fluorescent Pseudomonads|publisher=CRC Press|pages=387–414}}</ref>
▲''Plant Growth-Promoting Rhizobacteria'' (PGPR)[https://www.kompas.com/homey/read/2022/08/07/113600076/mengenal-bakteri-pgpr-dan-fungsinya-untuk-tanaman] adalah bakteri alami yang hidup di tanah yang membantu tanaman dengan berbagai cara, yaitu:<ref>{{Cite journal|date=2006|editor-last=Gnanamanickam|editor-first=Samuel S.|title=Plant-Associated Bacteria|url=http://dx.doi.org/10.1007/1-4020-4538-7|doi=10.1007/1-4020-4538-7}}</ref>
* Meningkatkan pertumbuhan bibit
* Mempercepat [[nodulasi]] dan fungsinya
* Memperluas permukaan daun
* Meningkatkan kekuatan, biomassa, dan penyerapan nutrisi, air, dan udara
Baris 27 ⟶ 29:
* ''[[Agrobacterium]]''
* ''[[Azotobacter]]''
* ''[[Alcaligenes]]''
* ''[[Clostridium]]''
* ''[[Beijerinckia]]''
* ''[[Rhizobium]]''
* ''[[Arthrobacter]]''
* ''[[Serratia]]''
* ''[[Enterobacter]]''
* ''[[Phyllobacterium]]''
* ''[[Burkholderia]]''
* ''[[Klebsiella]]''
* ''[[Vario-vovax]]''
* ''[[Xanthomonas]]''
== Mikroba
[[Berkas:Anthrax PHIL 2033.png|jmpl|Penyakit Antraks]]
[[Berkas:Botulism1and2.JPG|jmpl|Penyakit Botulisme]]
Dalam berbagai laporan ilmiah mikroba-mikroba tanah dilaporkan bersifat [[patogen]] pada
{| class="wikitable"
|+
Baris 51 ⟶ 53:
!Referensi
|-
|''[[Bacillus anthracis]]''
|[[Antraks]]
|Bakteri
|<ref>{{Cite journal|last=Dragon|first=Daniel C|last2=Rennie|first2=Robert P.|date=1995|title=The ecology of anthrax spores: Tough but not invincible|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1686874/pdf/canvetj00342-0041.pdf|journal=Can Vet J.|volume=36|pages=295-301}}</ref>
|-
|''[[Clostridium botulinum]]''
|[[Botulisme]]
|Bakteri
|<ref>{{Cite journal|last=Espelund|first=Mari|last2=Klaveness|first2=Dag|date=2014|title=Botulism outbreaks in natural environments – an update|url=https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2014.00287|journal=Frontiers in Microbiology|volume=5|doi=10.3389/fmicb.2014.00287|issn=1664-302X|pmc=PMC4052663|pmid=24966853}}</ref>
|-
|''[[Mycobacterium leprae]]''
|[[Kusta]]
|Bakteri
|<ref name=":1">{{Cite journal|last=Baumgardner|first=D. J.|date=2012-09-01|title=Soil-Related Bacterial and Fungal Infections|url=http://www.jabfm.org/cgi/doi/10.3122/jabfm.2012.05.110226|journal=The Journal of the American Board of Family Medicine|language=en|volume=25|issue=5|pages=734–744|doi=10.3122/jabfm.2012.05.110226|issn=1557-2625}}</ref>
|-
|''[[Shigella]]'' spp.
|[[Shigellosis]]
|Bakteri
|<ref name=":1" />
|-
|''[[Clostridium tetani]]''
|[[Tetanus]]
|Bakteri
|<ref>{{Cite book|last=George|first=Elizabeth K.|last2=De Jesus|first2=Orlando|last3=Vivekanandan|first3=Renuga|date=2024|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK482484/|title=Clostridium tetani Infection|location=Treasure Island (FL)|publisher=StatPearls Publishing|pmid=29494091}}</ref>
|-
|''[[Francisella tularensis]]''
|[[Tularemia]]
|Bakteri
|<ref name=":1" />
|-
|''[[Blastomyces dermatitidis]]''
|[[Blastomikosis]]
|Fungi
|<ref>{{Cite journal|last=Baumgardner|first=Dennis J.|last2=Laundre|first2=Bryan|date=2001|title=Studies on the molecular ecology of Blastomyces dermatitidis|url=http://link.springer.com/10.1023/A:1012438029997|journal=Mycopathologia|volume=152|issue=2|pages=51–58|doi=10.1023/A:1012438029997}}</ref>
|-
|''[[Coccidioides]]'' spp.
|[[Coccidioidomycosis]]
|Fungi
|<ref>{{Cite book|last=Hasan|first=Syed E.|date=2021|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/B9780124095489125230|title=Medical Geology|publisher=Elsevier|isbn=978-0-08-102909-1|pages=684–702|language=en|doi=10.1016/b978-0-12-409548-9.12523-0.}}</ref>
|-
|''[[Histoplasma capsulatum]]''
|[[Histoplasmosis]]
|Fungi
|<ref>{{Cite book|last=Akram|first=Sami M.|last2=Koirala|first2=Janak|date=2024|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK448185/|title=Histoplasmosis|location=Treasure Island (FL)|publisher=StatPearls Publishing|pmid=28846361}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Emmons|first=C. W.|date=1949|title=Isolation of Histoplasma capsulatum from Soil|url=http://dx.doi.org/10.2307/4587021|journal=Public Health Reports (1896-1970)|volume=64|issue=28|pages=892|doi=10.2307/4587021|issn=0094-6214}}</ref>
|}
== Baca
* [[Dekomposer]]
* [[Patogen]]
* [[Bahan organik tanah]]
* [[Pembusukan]]
== Referensi ==
|