Fragmen Okazaki: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
menambah percobaan dan prokariot eukariot Tag: BP2014 |
Rescuing 2 sources and tagging 0 as dead.) #IABot (v2.0.9.5 |
||
(12 revisi perantara oleh 8 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 1:
[[Berkas:DNA replication numbered.svg|
'''Fragmen Okazaki''' adalah [[DNA]] pendek berbentuk fragmen (
▲[[Berkas:DNA replication numbered.svg|thumb|right|250px|Proses replikasi DNA semi konservatif. (1) Untai DNA awal (''leading strand'') (2) Untai DNA lambat (''lagging strand''). Fragmen Okazaki (7) merupakan DNA pendek yang terbentuk pada untai DNA lambat]]
▲'''Fragmen Okazaki''' adalah [[DNA]] pendek berbentuk fragmen (bagian-bagian) dalam proses [[replikasi DNA]] pada bagian [[Replikasi_dna#Pembentukan_lagging_strand|untaian DNA lambat]] ([[bahasa inggris]]: ''lagging strand'').<ref name="ut">{{cite web|title=Replikasi DNA|publisher= Universitas Terbuka|accessdate=23 April 2014|url= http://www.ut.ac.id/html/suplemen/biol4219/biol4219a/replikasi_dna/replikasi_dna.htm}}</ref><ref name="triwibowo">{{cite book|title= Biologi Molekular|author= Yuwono, Triwibowo| publisher= Penerbit Erlangga| editor= Safitri, Amalia|year=2005|location= Jakarta|isbn=979-781-192-1| url= http://books.google.co.id/books?id=zosAg6HQAF4C&printsec=frontcover&hl=id#v=onepage&q&f=false}}</ref> Sintesis DNA akan selalu bergerak dengan arah 5’ → 3’.<ref name="triwibowo"/> Untai DNA awal (leading strand) dibaca dari ujung 5’ ke 3’ maka sintesisnya dapat dilakukan secara kontinu, sedangkan untaian DNA lambat merupakan anti parallel dari [[Replikasi_dna#Pembentukan_leading_strand|untaian DNA awal]] yang memiliki arah berkebalikan (ujung 3’ ke 5’) maka sintesis tidak dapat dilakukan secara kontinu melainkan dibuat fragmen-fragmen agar sintesis DNA dapat terjadi serentak.<ref name="unud">{{cite web|title=Metabolisme DNA|publisher= Fakultas Pertanian Universitas Udayana|accessdate= 23 April|url= http://www.fp.unud.ac.id/biotek/wp-content/uploads/2009/02/metabolisme-dna.pdf}}</ref> Fragmen DNA pendek yang terbentuk pada akhirnya akan disampung dengan [[enzim]] [[DNA ligase]] sehingga membentuk unit yang utuh.<ref name="triwibowo"/> Panjang fragmen Okazaki berkisar dari ratusan sampai ribuan nukleotida, tergantung jenis selnya.<ref name="unud"/>
Fragmen Okazaki ditemukan pada tahun [[1966]] dalam penelitian tentang proses replikasi DNA pada ''[[Escherichia coli]]'' oleh [[Reiji Okazaki]] dan Kiwako Sakabe.<ref name="okazaki">{{en}} {{cite journal |author=Sakabe K, Okazaki R |title=A unique property of the replicating region of chromosomal DNA |journal=Biochimica et Biophysica Acta |volume=129 |issue=3 |pages=651–54 |date=Desember 1966 |pmid=5337977}}</ref> Fragmen tersebut diteliti lebih lanjut melalui penelitiannya beserta rekan peneliti lainnya dalam studi replikasi DNA pada bakteriofag dengan objek penelitian ''E. coli''.<ref name="pmid4861623">{{en}} {{cite journal |author=Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K |title=Mechanism of DNA replication possible discontinuity of DNA chain growth |journal=Japanese Journal of Medical Science & Biology |volume=20 |issue=3 |pages=255–60 |date=Juni 1967 |pmid=4861623 |doi= |url=}}</ref>
== Percobaan ==
Pembentukan fragmen Okazaki dibuktikan dengan menggunakan model replikasi DNA [[bakteriofag]] T4. Bakteriofag T4 yang digunakan adalah tipe alami maupun [[mutan]] yang tidak mengkode enzim ligase.<ref name="triwibowo"/> [[Sel]] ''E. coli'' diinfeksi dengan T4 dan diperlakukan dengan pulsa-pulsa pendek (dalam skala detik) senyawa bertanda yaitu <sup>3</sup>H-timidin. DNA bakteriofag yang disintesis kemudian diultrasentrifugasi pada gradien untuk mengetahui ukuran fragmen DNA yang terbentuk pada tiap-tiap perlakuan pulsa senyawa bertanda.<ref name="triwibowo"/> Hasil gradien menunjukan pada dua detik setelah perlakuan diperoleh suatu fragmen DNA pendek berukuran sekitar seribu sampai dua ribu nukleotida.<ref name="triwibowo"/> Fragmen DNA yang pendek ini terakumulasi dalam jumlah besar jika digunakan bakteriofag T4 yang mengalami [[mutasi]] pada [[gen]] DNA ligase.<ref name="triwibowo"/>
== Fragmen Okazaki pada prokariota dan eukariota ==
Fragmen Okazaki yang terdapat pada [[eukariota]] lebih pendek dibanding pada [[prokariota]].<ref name="matsunaga">{{en}} {{cite journal |author=Matsunaga F, Norais C, Forterre P, Myllykallio H |title=Identification of short 'eukaryotic' Okazaki fragments synthesized from a prokaryotic replication origin |journal=EMBO Reports |volume=4 |issue=2 |pages=154–8 |date=Februari 2003 |pmid=12612604 |pmc=1315830 |doi=10.1038/sj.embor.embor732 |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1315830/pdf/4-embor732.pdf |access-date=2014-04-22 |archive-date=2023-07-25 |archive-url=https://web.archive.org/web/20230725015756/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1315830/pdf/4-embor732.pdf |dead-url=no }}</ref> Panjang fragmen Okazaki pada eukariota berkisar 100 nukleotida
==
* [[DNA]]
== Referensi ==
{{references}}
{{Authority control}}
▲[[kategori:Genetika molekular]]
[[kategori:DNA]]▼
[[Kategori:Genetika molekular]]
▲[[kategori:Replikasi DNA]]
[[Kategori:Replikasi DNA]]
|