Seorang makhluk misterius menghancurkan 70% dari bulan dengan kekuatannya, menyebabkan kepanikan di bumi. Makhluk tersebut juga mengancam ingin menghancurkan bumi. Pemerintah telah berusaha untuk membunuh makhluk tersebut, namun semua usaha yang dilakukan sia-sia karena makhluk tersebut memiliki kecepatan 20 mach yang tidak dapat ditandingi oleh siapapun atau apapun. Makhluk tersebut mengancammenawarkan sebuah perjanjian dengan pemerintah. Ia akan menghancurkanmenunda penghancuran bumi pada tanggalhingga 20 Maret tahun depan.Namun,asalkan ia menawarkan sebuah perjanjian dengan pemerintah. Ia inginbisa mengajar di kelas 3-E SMP Kunigigaoka dan memberi kesempatan untuk murid kelas 3-E untuk membunuhnya. Kelas 3-E merupakan bagian dari sebuah sekolah yang elit, SMP Kunigigaoka. Namun, karena prinsip dari kepala sekolah SMP Kunigigaoka, kelas 3-E diasingkan dari bangunan utama dan dianggap sebagai kelas bagipecundang. merekaPemerintah yangmemerintahkan pengecut.kelas Makhluk3-E tersebutuntuk punmembunuh mulaimakhluk menjaditersebut walidengan kelas10 dimilyar kelasyen 3-Esebagai bayarannya. IaNamun, menjadidiluar dugaan ternyata makhluk tersebut adalah seorang guru yang benar-benarsangat hebat. danIa bahkan berhasil meningkatkan nilai murid-murid kelas 3-E. MakhlukSejak yangkedatangan padamakhluk yang akhirnyanantinya diberi nama Koro-sensei oleh kelas 3-E itu pun mengubah, kelas 3-E, pun berubah dari sebuah kelas pengecutpecundang danmenjadi buangankelas menjadipembunuh sebuahyang kelaspenuh pembunuhsemangat. Nama Koro-sensei diambil dari kata ''korosenai'' yang memiliki arti "tidak bisa dibunuh" dan ''sensei'' yang memiliki arti "guru".
