Tiga perguruan tinggi yang melebur jadi UNISNU<refhttpref>http://www.suaramerdeka.com/v1/index.php/read/cetak/2013/05/14/224677/Jepara-Miliki-Universitas-Baru</ref> adalah [[Sekolah Tinggi Ilmu Ekonomi Nahdlatul Ulama Jepara|STIENU]], [[Sekolah Tinggi Teknologi Desain Nahdlatul Ulama Jepara|STTDNU]], [[Institut Islam Nahdlatul Ulama Jepara|INISNU]]. Rapat perdana pembahasan sekaligus pengumuman universitas baru itu dilakukan mengacu pada surat keputusan Dirjen Dikti Kemendikbud bertanggal 26 April 2013, Unisnu membuka 15 program studi (prodi) yang semuanya untuk jenjang strata 1 (S-1). .