Yunahar Ilyas adalah putra dari Ilyas dan Syamsidar.{{Bio<ref muslim butuh rujukan}}name=mu/> Kedua orang tuanya telah meninggal dunia, ayahnya meninggal pada tahun 1995, sedangkan ibunya tahun 1988.{{Bio muslim butuh<ref rujukan}}name=mu/> Yunahar menikah pada tanggal 24 September 1987 dengan Liswarni Syahrial dan telah dikaruniai 4 orang anak, yaitu Syamila Azhariya Nahar, Faiza Husnayeni Nahar, Muhammad Hasnan Nahar, Ihda Rufaida Nahar. Pada tahun 2004, anak sulungnya, Syamila Azhariya Nahar meninggal dunia dalam usia 16 th.{{Bio muslim butuh rujukan}}
