Dwi Koen lahir pada 13 Mei 1941 di [[Kota Banjar|Banjar]], Jawa Barat, dengansebagai anak kedua dari enam bersaudara<ref>https://ceknricek.com/a/mengenang-dwi-koen-pencipta-komik-panji-koming/9134</ref> dari ayah [[Raden|R.]] Soemantri Brotoatmodjo, seorang insinyur teknik, dan ibu [[Raden Roro|R.R.]] Siti Soerasmi Brotopratomo, seorang perias pengantin.<ref name="PDAT"/> Ia tumbuh dan menamatkan [[sekolah dasar]]nya di [[Bandung]], Jawa Barat. Selepas menamatkan [[SMP]] di [[Surabaya]], ia melanjutkan pendidikannya di [[Sekolah Seni Rupa Indonesia]] jurusan Seni Lukis di [[Yogyakarta]], dan kemudian jurusan ilustrasi grafis di [[Akademi Seni Rupa Indonesia]] (ASRI) Yogyakarta. Dia tidak dapat menyelesaikan kuliahnya akibat pecahnya peristiwa [[G30S]].<ref name=M2>{{cite web|title=Dwi Koen|url=https://m2indonesia.com/tokoh/sastrawan/dwi-koen.htm|access-date=22 Agustus 2019|website=M2Indonesia}}</ref>