Aurangzeb selanjutnya memaingkan perhatuannyaperhatiannya ke Deccan, ia sampai di [[Ahmadnagar]] pada tahun 1663. Disana ia mendapati bahwa ada tiga kerajaan yang memberontak: [[Kemaharajaan Maratha|Negeri Maratha]] dari [[Sambhaji]], putra Sivaji dan dari sekutu – sekutunya Golkonda dan Bijapur. Demikian ia memutuskan untuk menundukan kerajaan – kerajaan lainnya dulu. Ia merebut Bijapur pada tahun 1685 dan mGolkonda 1687. Dalam tahun 1689 ia mengambil Sambhaji.orang – orang dari Marata menempatkan saudaranya, Raja Ram diatas tahta, setelah Raja Ram jandanya Tara Bai melanjutkan peperangan,tetapi benteng demi benteng jatuh, sampai akhirnya pada tahun 1705 Aurangzeb menghapuskan kerajaan Marata.
