Di bawah tekanan syahansyah Sasani, Gereja di Timur kian lama kian menjarak dari [[Pentarki]] (saat itu dikenal sebagai Gereja [[Kekaisaran Romawi Timur]]). Oleh karena itu, pada tahun 424, uskup-uskup di Kemaharajaan Sasani bersidang di bawah pimpinan Katolikos [[Dadisyo]] (421–456) dan sepakat untuk seterusnya tidak merujuk kepada pihak berwenang mana pun di luar negeri dalam urusan-urusan tata tertib maupun teologi, khususnya kepada uskup atau konsili Gereja di [[Kekaisaran Romawi]].{{sfn|Hill|1988|p=105}}
Inilah sebabnya gereja-gereja di Mesopotamia tidak mengutus wakil-wakilnya ke berbagai konsili yang dihadiri wakil-wakil "[[Gereja Barat]]". Dengan demikian para pimpinan Gereja di Timur tidak merasa wajib menaati keputusan apa pun yang dipandangmereka anggap sebagai keputusan konsili-konsili Kekaisaran Romawi.<!--DespiteMeskipun thisdemikian, thesyahadat Creeddan and Canons of thekanon-kanon [[FirstKonsili CouncilNikea of NicaeaI]] oftahun 325,affirmingyang themembenarkan fullkeparipurnaan divinitykeilahian ofKristus Christ,secara wereresmi formallyditerima accepted at thedalam [[Council ofKonsili SeleuciaSeleukia-CtesiphonKtesifon]] intahun 410.{{sfn|Cross|Livingstone|2005|p=354}} ThePemahaman church'sGereja understandingdi ofTimur thetentang termistilah "[[HypostasisHipostasis (philosophyfilsafat anddan religionagama)|hypostasishipostasis]]" differsberbeda fromdari thedefinisi definitionistilah oftersebut the term offered at themenurut [[CouncilKonsili of ChalcedonKalsedon]] oftahun 451. For this reason,Oleh thekarena Assyrianitu ChurchGereja hasAsyur nevertidak approvedpernah themenerima [[Chalcedoniansyahadat definitionKalsedon]].{{sfn|Cross|Livingstone|2005|p=354}}
TheKontroversi theologicalteologis controversyyang thattimbul followed theseusai [[Council ofKonsili EphesusEfesus]] intahun 431 provedterbukti amenjadi turningsalah pointsatu intonggak thesejarah Christian Church's historyGereja. TheKonsili CouncilEfesus condemnedmembidatkan as heretical the Christology ofKristologi [[Nestorius]], whoselantaran reluctancekeengganannya tountuk accordmemuliakan thePerawan VirginMaria Marydengan the titlegelar ''[[Theotokos|Teotokos]]'' "God-bearer,(Pelahir MotherAllah) ofdijadikan God"bukti wasbahwa takenia aspercaya evidenceada thatdua hepribadi believed two separate personsterpisah (asalih-alih opposeddua tokodrat two united naturesmanunggal) todi bedalam presentdiri within ChristKristus. <!--(For the theological issues at stake, see ''[[#Assyrian Church of the East and Nestorianism|Assyrian Church of the East and Nestorianism]]''.)
The Sasanian Emperor, hostile to the Byzantines, saw the opportunity to ensure the loyalty of his Christian subjects and lent support to the [[Nestorian Schism]]. The Emperor took steps to cement the primacy of the Nestorian party within the Assyrian Church of the East, granting its members his protection,{{sfn|Outerbridge|1952}} and executing the pro-Roman Catholicos [[Babowai]] in 484, replacing him with the Nestorian Bishop of [[Nusaybin|Nisibis]], [[Barsauma]]. The Catholicos-Patriarch [[Babai (Nestorian patriarch)|Babai]] (497–503) confirmed the association of the Assyrian Church with Nestorianism.
