Walaupun dianggapdiannggap menguntungkan, beberapa spesies ''Lactobacillus'' telah diasosiasikan dengan [[karies gigi]].<ref>{{Cite web |url=http://www.lcusd.net/lchs/mewoldsen/dokko.html |title=Salinan arsip |access-date=2009-08-08 |archive-date=2008-06-21 |archive-url=https://web.archive.org/web/20080621073037/http://www.lcusd.net/lchs/mewoldsen/dokko.html |dead-url=yes }}</ref> Jumlah ''Lactobacillus'' pada air ludah telah digunakan sebagai acuan dalam "tes karies" selama bertahun-tahun.<ref>{{Cite web |url=http://www.db.od.mah.se/lbcmm/lbctest00-.html |title=Salinan arsip |access-date=2009-08-08 |archive-date=2008-11-14 |archive-url=https://web.archive.org/web/20081114035016/http://www.db.od.mah.se/lbcmm/lbctest00-.html |dead-url=yes }}</ref> Ini adalah satu dari banyak argumen yang digunakan untuk mendukung penambahan fluorida (F<sup>-</sup>) pada [[pasta gigi]] dan permen pelega tenggorokan.<ref> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=17067433 </ref>
