[[File:Mika Hakkinen DTM Norisring 2009 (cropped).jpg|thumb|right|upright|[[Mika Häkkinen]] (foto 2009) sempat memimpin pada awal perlombaan setelah mengawali start dari posisi kedua.]]
Perlombaan sebanyak 53 putaran ini meliputi jarak sekitar {{Convert|310.596|km|mi|abbr=on}} yang dimulai pada pukul 14.30 waktu setempat,.{{efn|name=Distances}} Lomba danini disaksikan oleh sekitar 151.000 penonton.{{efn|name=Distances}}<ref name="2013PressKit">{{cite web |title=2013 Japanese Grand Prix: Official Media Kit |url=http://www.fia.com/sites/default/files/external_archive/node4131/jpn_media_kit_en_2013.pdf |url-status=dead |archive-url=https://web.archive.org/web/20140307111513/http://www.fia.com/sites/default/files/external_archive/node4131/jpn_media_kit_en_2013.pdf |archive-date=7 Maret 2014 |access-date=5 Februari 2016 |work=FIA.com |publisher=Fédération Internationale de l'Automobile |page=31 |format=PDF}}</ref> Cuaca pada hari perlombaan adalah kering dan mendung.<ref name="temp" /> Ramalan cuaca memprediksikan hujan akan turun selama acara berlangsung.<ref name="F1MagReport" /> Suhu udara saat itu adalah {{convert|22|C|F}} dan suhu lintasan {{convert|23|C|F}}.<ref name=temp/> Saat menjalani putaran pemanasan sebelum start, mobil milik Häkkinen mengalami kebocoran pada sistem hidroliknya, sehingga mengeluarkan asap, tetapi ia masih bisa memulai lomba. Frentzen memulai lomba dengan menggunakan [[monokok]] cadangan.<ref name=gprace/> Ketika lampu padam yang menandai lomba dimulai, Häkkinen mampu mengakselerasi lebih cepat daripada Michael Schumacher dari garis start dengan cengkeraman lintasan yang lebih baik.<ref name=SpeedvisionRace>{{Cite web |last=Gardner |first=John |date=8 October 2000 |title=Japanese GP: Schumacher Wins, Clinches Championship |url=http://speedvision.com/pub/articles/racing/01Formula1/001008b.html |url-status=dead |archive-url=https://web.archive.org/web/20001019084131/http://speedvision.com/pub/articles/racing/01Formula1/001008b.html |archive-date=19 Oktober 2000 |access-date=29 Maret 2022 |website=Speedvision}}</ref> Saat memasuki tikungan pertama, ia memimpin dan berhasil menahan laju Schumacher yang mencoba mengambil kembali posisinya.<ref name="Goodman2000" /><ref name=Hilton2009/> Direktur balap FIA Charlie Whiting tidak mengibarkan bendera hitam-putih diagonal untuk menandai standar mengemudi yang buruk.<ref name="gprace" /> Manuver Michael Schumacher menciptakan beberapa aksi di belakang kedua pembalap terdepan saat memasuki tikungan pertama. Ralf Schumacher berhasil melewati Barrichello dan Coulthard berhasil menahan upaya Ralf untuk meraih posisi ketiga. Verstappen naik dari posisi 14 menjadi posisi kesembilan pada akhir putaran pertama.<ref name=fiarace>{{cite journal|last=Elizalde|first=Pablo|title=The Japanese GP Review|url=http://atlasf1.autosport.com/2000/jpn/elizalde.html|journal=AtlasF1|publisher=Haymarket Publications|volume=6|issue=41|date=11 Oktober 2000|access-date=18 Desember 2021|archive-url=https://web.archive.org/web/20100125190135/http://atlasf1.autosport.com/2000/jpn/elizalde.html|archive-date=25 Januari 2010}}</ref> Sementara sistem ''anti-stall'' di mobil Fisichella tiba-tiba aktif dan membuatnya memulai lomba dengan lambat dengan turun delapan posisi.<ref name=gprace/>
Setelah satu putaran berlalu, Häkkinen memimpin atas Michael Schumacher dengan selisih delapan persepuluh detik, diikuti oleh Coulthard, Ralf Schumacher, Irvine, Barrichello, dan Button.<ref name="lapchart">{{cite web|title=Lap-by-Lap: Grand Prix of Japan 2000|url=http://dbs.galeforcef1.com/laps_2000/lbl_jp_laps.html|publisher=Gale Force F1|date=8 Oktober 2000|access-date=21 Maret 2015|archive-url=https://web.archive.org/web/20070812141728/http://dbs.galeforcef1.com/laps_2000/lbl_jp_laps.html|archive-date=12 Agustus 2007}}</ref> Häkkinen mencatatkan waktu putaran tercepat pada putaran kedua dan mulai mempertahankan jarak di depan Michael Schumacher saat kedua pembalap menjauh dari peserta lainnya.<ref name=lapchart/> Gerimis ringan turun ke lintasan pada putaran keempat, tetapi tidak cukup deras untuk mempengaruhi jalannya lomba. Pada putaran ketujuh, Villeneuve berhasil melewati Herbert untuk meraih posisi kedelapan, sementara Trulli melewati rekannya, Frentzen, dari posisi ke-11.<ref name=fiarace/> Verstappen mengalami masalah pada sistem elektronik di girboksnya dan terpaksa keluar dari lintasan. Ia didorong ke dalam garasi dan menjadi pembalap pertama yang tersingkir dari lomba pada putaran.<ref name="F1MagReport" /><ref name=fiarace/><ref name=f1comrace>{{cite web|title=2000 – Round 16 – Japan:Suzuka|url=http://www.formula1.com/races/racenews00/japan/race.html|work=Formula1.com|publisher=Formula1.com Limited|date=8 Oktober 2000|access-date=16 Mei 2015|archive-url=https://web.archive.org/web/20010603113643/http://www.formula1.com/races/racenews00/japan/race.html|archive-date=3 Juni 2001 }}</ref> Diniz melakukan [[pit stop]] pertamanya pada putaran ke-13, dan menjadi pembalap pertama dalam lomba ini yang melakukannya. Di posisi terdepan, Häkkinen memperlebar jaraknya dari Michael Schumacher menjadi dua detik, sementara Schumacher unggul sepuluh detik dari Coulthard yang berada di posisi ketiga.<ref name=fiarace/> Ralf Schumacher tertinggal 8,8 detik dari Coulthard tetapi menjauh dari Irvine yang berada di posisi kelima.<ref name=lapchart/>
