Tokoh utama dalam [[film]] ini adalah seekor anak ikan yang ingin menjadi manusia yang bernama, [[Ponyo]] dan seorang anak laki-laki yang bernama Sousuke. [[Hayao Miyazaki]] mengungkap bahwa film Ponyo adalah karya yang tidak memiliki sisi [[kekerasan]]. Flim animasi berjudul [[Kiki's Delivery Service]] yang dirilis pada tahun 1989 memiliki nuansa kesamaan tema dengan flim Ponyo.
Beredar berita bahwa film Ponyo diadaptasi dari cerita anak-anak [[The Little Mermaid]] karya [[Hans Christian Andersen]]. Miyazaki tidak mengadaptasi [[The Little Mermaid]] sepenuhnyaNamun, tetapi dia mengubah banyak hal seperti memindahkan ''setting'' ke [[Jepang]] masa kini agar mengurangi nuansa [[Kekristenan|Kristiani]] yang ada pada The Little Mermaid. Pada konferensi pers di [[Festival Film Venice]], meski Miyazaki mengatakan bahwa dalam proses pembuatan Ponyo ada kemiripan dengan The Little Mermaid. Namun, Miyazaki menegaskan bahwa Ponyo dibuat bukan berdasarkan [[The Little Mermaid]].
Film ini adalah percampuran antara dunia nyata dan [[fantasi]]. Di dalamnya, terjadi banyak fenomena alam tidak lazim. Pada saat membuat karya ini, Miyazaki berpikir untuk membuat film tanpa alur, tetapi mudah dimengerti. Dia merasa bosan dengan alur cerita yang biasa saja dan ingin membuat sesuatu yang tidak bergantung pada [[idealisme]].