KalsedonBatu yaman pernah disangka sebagai kriptokristalin kuarsa yang berserat<ref>Chalcedony mineral information and data. http://www.mindat.org/min-960.html</ref> namun kini diketahui kalsedonbatu yaman juga bersifat polimorf karena keberadaan moganit di dalamnya.<ref name="heany_1994" /><ref>Origlieri, Marcus. "Moganite: a New Mineral -- Not!" Lithosphere (1994). Aug. 2007 <http://fgms.home.att.net/moganite.htm {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20080309094336/http://fgms.home.att.net/moganite.htm |date=2008-03-09 }}>.</ref><ref>Nickel, Ernest H., and Monte C. Nichols. "IMA/CNMNC List of Mineral Names." Materials Data. June 2007. Aug. 2007 <http://www.geo.vu.nl/users/ima-cnmmn/MINERALlist.pdf {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20080530134400/http://www.geo.vu.nl/users/ima-cnmmn/MINERALlist.pdf |date=2008-05-30 }}></ref> Kadar moganit dalam satu sampel kalsedonbatu yaman cukup bervariasi, umumnya antara 5 hingga 20 persen.<ref name="heany_1992">Heaney, Peter J., and Jeffrey E. Post. "The Widespread Distribution of a Novel Silica Polymorph in Microcrystalline Quartz Varieties." Science ns 255 (1992): 441-443. JSTOR. Aug. 2007. Keyword: moganite</ref>
=== Kelarutan ===
Meski memiliki [[senyawa kimia]] yang identik dengan kuarsa, kalsedonbatu yaman bersifat lebih larut dibandingkan kuarsa pada temperatur yang rendah. Kemugnkinan hal ini disebabkan oleh kristal kalsedonbatu yaman yang lebih halus sehingga memiliki rasio luas permukaan dan volume yang lebih tinggi. Kelarutan yang lebih tinggi ini juga diperkirakan karena keberadaan moganit.<ref name="heany_1992" />