Autofagosom: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Fabi Fuu 76 (bicara | kontrib) |
Fabi Fuu 76 (bicara | kontrib) |
||
Baris 7:
== Proses pembentukan autofagosom ==
Dalam sel ragi (''[[Saccharomyces cerevisiae]]''), setelah induksi makroautofagi terjadi, pembentukan autofagosom dimulai pada situs perivakuola yang disebut situs perakitan fagosom (''phagophore assembly site'', PAS).<ref name=":0" /> Perikvakuola dalam sel ragi biasa terletak dekat dengan retikulum endoplasma (RE). Dalam sel mamalia, pembentukan autofagosom dimulai di berbagai tempat di seluruh sitoplasma, bukan di satu PAS saja.<ref name=":0" /><ref>{{Cite journal|last=Chen|first=Yongqiang|last2=Klionsky|first2=Daniel J.|date=2011-01-15|title=The regulation of autophagy – unanswered questions|url=https://journals.biologists.com/jcs/article/124/2/161/31858/The-regulation-of-autophagy-unanswered-questions|journal=Journal of Cell Science|language=en|volume=124|issue=2|pages=161–170|doi=10.1242/jcs.064576|issn=1477-9137|pmc=PMC3037094|pmid=21187343}}</ref> Beberapa penelitian menunjukkan bahwa struktur pada [[retikulum endoplasma]] (RE) yang disebut [[omegasom]] berfungsi sebagai tempat inisiasi pada mamalia.<ref name=":0" /> Omegasom adalah subdomain dari retikulum endoplasma yang tersusun oleh membran lipid bilayer yang diperkaya dengan [[Fosfatidil inositol 3-fosfatase|fosfatidilinositol 3-fosfat]].<ref>{{Cite journal|last=Roberts|first=Rebecca|last2=Ktistakis|first2=Nicholas T.|date=2013-09-27|editor-last=Lane|editor-first=Jon D.|title=Omegasomes: PI3P platforms that manufacture autophagosomes|url=https://portlandpress.com/essaysbiochem/article/doi/10.1042/bse0550017/78211/Omegasomes-PI3P-platforms-that-manufacture|journal=Essays in Biochemistry|language=en|volume=55|pages=17–27|doi=10.1042/bse0550017|issn=0071-1365}}</ref>▼
=== Induksi autofagi ===
Baris 12 ⟶ 13:
=== Pembentukan perancah oleh kompleks Atg1/ULK ===
Pembentukan prekursor autofagosom dimulai dengan perakitan beberapa kompleks Atg1/ULK yang membentuk perancah (''scaffolding'') untuk proses perekrutan protein ATG lainnya.<ref name=":3" /> Atg1/ULK adalah salah satu protein penting dalam keluarga protein ATG, terutama dalam proses inisiasi autofagi.<ref>{{Cite journal|last=Lazarus|first=Michael B.|last2=Novotny|first2=Chris J.|last3=Shokat|first3=Kevan M.|date=2015-01-16|title=Structure of the Human Autophagy Initiating Kinase ULK1 in Complex with Potent Inhibitors|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cb500835z|journal=ACS Chemical Biology|language=en|volume=10|issue=1|pages=257–261|doi=10.1021/cb500835z|issn=1554-8929|pmc=PMC4301081|pmid=25551253}}</ref>
▲Dalam sel ragi (''[[Saccharomyces cerevisiae]]''), setelah induksi makroautofagi terjadi, pembentukan autofagosom dimulai pada situs perivakuola yang disebut situs perakitan fagosom (''phagophore assembly site'', PAS).<ref name=":0" /> Perikvakuola dalam sel ragi biasa terletak dekat dengan retikulum endoplasma (RE). Dalam sel mamalia, pembentukan autofagosom dimulai di berbagai tempat di seluruh sitoplasma, bukan di satu PAS saja.<ref name=":0" /><ref>{{Cite journal|last=Chen|first=Yongqiang|last2=Klionsky|first2=Daniel J.|date=2011-01-15|title=The regulation of autophagy – unanswered questions|url=https://journals.biologists.com/jcs/article/124/2/161/31858/The-regulation-of-autophagy-unanswered-questions|journal=Journal of Cell Science|language=en|volume=124|issue=2|pages=161–170|doi=10.1242/jcs.064576|issn=1477-9137|pmc=PMC3037094|pmid=21187343}}</ref> Beberapa penelitian menunjukkan bahwa struktur pada [[retikulum endoplasma]] (RE) yang disebut [[omegasom]] berfungsi sebagai tempat inisiasi pada mamalia.<ref name=":0" /> Omegasom adalah subdomain dari retikulum endoplasma yang tersusun oleh membran lipid bilayer yang diperkaya dengan [[Fosfatidil inositol 3-fosfatase|fosfatidilinositol 3-fosfat]].<ref>{{Cite journal|last=Roberts|first=Rebecca|last2=Ktistakis|first2=Nicholas T.|date=2013-09-27|editor-last=Lane|editor-first=Jon D.|title=Omegasomes: PI3P platforms that manufacture autophagosomes|url=https://portlandpress.com/essaysbiochem/article/doi/10.1042/bse0550017/78211/Omegasomes-PI3P-platforms-that-manufacture|journal=Essays in Biochemistry|language=en|volume=55|pages=17–27|doi=10.1042/bse0550017|issn=0071-1365}}</ref>
▲Pembentukan prekursor autofagosom dimulai dengan perakitan beberapa kompleks Atg1/ULK yang membentuk perancah (''scaffolding'') untuk proses perekrutan protein ATG lainnya.<ref name=":3" /> Atg1/ULK adalah salah satu protein penting dalam keluarga protein ATG, terutama dalam proses inisiasi autofagi.<ref>{{Cite journal|last=Lazarus|first=Michael B.|last2=Novotny|first2=Chris J.|last3=Shokat|first3=Kevan M.|date=2015-01-16|title=Structure of the Human Autophagy Initiating Kinase ULK1 in Complex with Potent Inhibitors|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cb500835z|journal=ACS Chemical Biology|language=en|volume=10|issue=1|pages=257–261|doi=10.1021/cb500835z|issn=1554-8929|pmc=PMC4301081|pmid=25551253}}</ref>
Pada ragi, inaktivasi TORC1 mengakibatkan pembentukan kompleks Atg1 melalui defosforilasi Atg13.<ref name=":3" /> Selain itu, protein Atg13 dalam kompleks Atg1 menggunakan situs pengikatan di daerah yang secara intrinsik tidak teratur (''long intrinsically disordered region'') untuk "menangkap" Atg17 di kompleks Atg1 yang lain. Dengan cara ini, lusinan kompleks Atg1 saling berikatan-silang satu sama lain melalui Atg13, menghasilkan sebuah struktur yang disebut sebagai ''superassembly''.<ref name=":3" />
Baris 26 ⟶ 25:
Dalam sel mamalia, vesikel ATG9 yang berasal dari jajaring ''trans-''Golgi mungkin terlibat dalam pembentukan prekursor autofagosom dengan mekanisme yang mirip seperti pada sel ragi. Kompleks ULK yang sudah terbentuk akan berasosiasi dengan RE, dan kemudian berasosiasi dengan vesikel ATG9 dengan bantuan ATG14. Setelah itu, kompleks ATG13-ATG101 dari kompleks ULK akan berinteraksi dengan protein ATG9 yang ada di vesikel ATG9.<ref name=":3" />
=== Modifikasi membran pada prekursor autofagosom ===
Pada sel mamalia dan sel ragi, terdapat banyak fosfatidilinositol-3-fosfat (PI3P) pada membran prekursor autofagosom. Lebih lanjut lagi, domain RE spesifik pada sel mamalia yang disebut sebagai omegasom juga memiliki banyak PI3P pada membrannya. PI3P ini dihasilkan oleh enzim bernama PI3K complex I, terutama pada proses inisiasi prekursor autofagosom. Dalam sel ragi, proses sintesis PI3P berada di vesikel Atg9, sedangkan dalam sel mamalia, biasanya ada di ''recycling endosome''.<ref name=":3" />
== Referensi ==
| |||