Protestantisme dan Islam mulai berhubungan pada abad ke-16 ketika Protestan Calvinis di Hongaria dan Transilvania saat ini bertepatan dengan perluasan Kesultanan Utsmaniyah di Balkan. Karena Protestantisme terbagi menjadi beberapa cabang dan beberapa denominasi yang dapat dibedakan, maka sulit untuk menentukan hubungan secara spesifik. Banyak dari denominasi ini mempunyai pendekatan berbeda terhadap masalah ini. Islam juga terbagi menjadi berbagai denominasi . Artikel ini berfokus pada hubungan Protestan-Muslim, namun harus ditanggapi dengan hati-hati.
Hubungan menjadi lebih bermusuhan pada periode awal modern dan modern, meskipun upaya pemulihan hubungan baru-baru ini telah dilakukan. Dalam hal perbandingan agama, terdapat persamaan yang menarik terutama dengan Sunni, sementara umat Katolik sering kali dikenal karena persamaannya dengan Syiah,<ref>{{cite book|title=A Brief Guide to Islam: History, Faith and Politics: The Complete Introduction|author1=Grieve|first=Paul|date=7 Feb 2013|publisher=Hachette UK|isbn=9781472107558|location=The Development of Islam: Shi'a and Catholics}}</ref><ref>{{cite book|title=The Future Church: How Ten Trends are Revolutionizing the Catholic Church|author1=Allen, Jr.|first=John L.|date=10 Nov 2009|publisher=Crown Publishing Group|isbn=9780385529532|edition=unabridged|pages=442–3}}</ref><ref>{{cite book|editor1-last=Smith|editor1-first=John MacDonald|editor2-last=Quenby|editor2-first=John|title=Intelligent Faith: A Celebration of 150 Years of Darwinian Evolution|date=2009|publisher=John Hunt Publishing|isbn=9781846942297|page=245|edition=illustrated}}</ref><ref>{{cite book|title=The Oxford Handbook of Biblical Studies|last1=Rogerson|first1=J. W.|last2=Lieu|first2=Judith M.|date=16 Mar 2006|publisher=OUP Oxford|isbn=9780199254255|edition=reprint|page=829}}</ref><ref>{{cite book|title=Shirin Ebadi|author1=Hubbard-Brown|first=Janet|date=2007|publisher=Infobase Publishing|isbn=9781438104515|page=47}}</ref><ref>{{cite book|title=Global Connections|last1=Coatsworth|first1=John|last2=Cole|first2=Juan|last3=Hanagan|first3=Michael|last4=Perdue|first4=Peter C.|last5=Tilly|first5=Charles|last6=Tilly|first6=Louise A.|date=16 Mar 2015|publisher=Cambridge University Press|isbn=9780521761062|edition=illustrated|page=26}}</ref> serta perbedaan keduanya pendekatan keagamaan.
