Istana Paku Alaman ini adalah sebuah istana kecil jika dibandingkan dengan [[Keraton Yogyakarta]]. Ini menunjukkan kedudukan Kadipatenkadipaten ini yang walaupun sebagai negara berdaulat sendiri di luar Kesultanan Yogyakarta namun tetap setingkat di bawahnya. Istana ini menghadap ke arah selatan (sekarang jalanJalan Sultan Agung). Di depannya juga terdapat sebuah tanah lapang kecil, [[Alun-alun Paku AlamanSewandanan]]. [[Masjid besarBesar Paku AlamanPakualaman]] terdapat di sebelah barat daya istana. Arsitektur masjid mirip dengan [[Masjid Gedhe Kauman|masjid raya kesultanan]] namun dalam skala lebih kecil dan sederhana. Di dalamnya juga terdapat [[mimbar]] dan [[maksura]], tempat ibadahkhusus untuk Pangeran Paku Alam, seperti yang juga terdapat di masjid raya kesultanan.
Arsitek istana Paku Alaman tidak diketahui lagi, begitu pula dengan bagian-bagian dalam istana ini. Hal ini dikarenakan Puro Paku Alaman masih menjadi tempat kediaman resmi Sri Paduka [[Paku Alam IX]], yang juga Wakil Gubernur Prov. DIY. Bagian yang dapat dilihat adalah pendapa terdepan yang disebut dengan '''Bangsal Sewatama'''. Sedangkan bagian yang terbuka untuk umum hanyalah Museum Paku Alaman. Istana ini diapit oleh jalan umum di sisi utara(Jl. Purwanggan), timur (Jl. Harjono), dan selatan (Jl. Sewandanan). Gerbang istana Paku Alaman terdapat di sisi selatan (gerbang utama) dan sisi utara (sudah ditutup, namun masih ada bekas-bekasnya). Konon dulu Istanaistana ini juga dikelilingi benteng [[baluwarti]] yang tidak beranjungan. Konon tembok tebal sepanjang 20 m di sisi utara jalan Sultan Agung sebelah timur pertigaan dengan jalanJalan Jagalan dipercaya sebagai bekas baluwarti tersebut. Gerbangnya konon terdapat di ujung selatan jalanJalan Gajah Mada.
Puro Paku Alaman masih menjadi tempat kediaman resmi Sri Paduka [[Paku Alam IX]], yang juga Wakil Gubernur [[Provinsi DIY]]. Bagian yang dapat dilihat oleh umum adalah pendapa terdepan yang disebut dengan '''Bangsal Sewatama'''. Sementara itu, bagian yang terbuka untuk dimasuki umum hanyalah [[Museum Pakualaman]].
