[[Berkas:COLLECTIE TROPENMUSEUM Gelovigen voor de moskee in Kaitetoe TMnr 10016552.jpg|thumb|200px|Masjid di Kaitetu di awal abad ke-20]]
Mayoritas penduduk di Maluku memeluk agama KristenIslam dan IslamKristen . Hal ini dikarenakan pengaruh penjajahan [[Portugis]] dan [[Spanyol]] sebelum [[Belanda]] yang telah menyebarkan kekristenan dan pengaruh Kesultanan Ternate dan Tidore yang menyebarkan Islam di wilayah Maluku serta Pedagang [[Arab]] di pesisir Pulau Ambon dan sekitarnya sebelumnya. Tempat ibadah di Provinsi Maluku pada tahun 2008 adalah Gereja Protestan 1.188 buah, Mesjid 780 buah,Gereja Katolik 442 buah, Pura 14 buah dan Wihara 8 buah.
