Transkripsi (genetik): Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
EmausBot (bicara | kontrib)
Tidak ada ringkasan suntingan
Baris 1:
'''Transkripsi''' ({{lang-en|transcription}}) dalam [[genetika]] adalah pembuatan [[RNA]] dengan menyalin sebagian berkas [[DNA]].<ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Transcription and RNA polymerase
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A1808
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref><ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Genes as determinants of the inherent properties of species
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A1808&rendertype=figure&id=A1815
| accessdate = 2010-08-16
}}</ref><ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Figure 10-9. Initiation of transcription.
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A64
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref><ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Figure 10-13. A model for rho action on a nascent cotranslated mRNA.
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A1808&rendertype=figure&id=A1821
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref><ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Figure 10-11. Transcription by RNA polymerase.
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A1808&rendertype=figure&id=A1818
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref> Transkripsi adalah bagian dari rangkaian [[ekspresi genetik]]. Pengertian asli "transkripsi" adalah alih aksara atau penyalinan. Di sini, yang dimaksud adalah mengubah "teks" DNA menjadi RNA. Sebenarnya, yang berubah hanyalah [[basa nitrogen]] [[timina]] di DNA yang pada RNA digantikan oleh [[urasil]].
 
== Proses ==
Transkripsi berlangsung di dalam [[inti sel]] atau di dalam matriks [[mitokondria]] dan [[plastida]]. Transkripsi dapat dipicu oleh rangsangan dari luar maupun tanpa rangsangan. Pada proses tanpa rangsangan, transkripsi berlangsung terus-menerus ([[gen]]-gennya disebut [[gen|gen konstitutif]] atau "gen pengurus rumah", ''house-keeping genes''). Sementara itu, gen yang memerlukan rangsangan biasanya gen yang hanya diproduksi sewaktu-waktu; gennya disebut [[gen|gen regulatorik]] karena biasanya mengatur mekanisme khusus. Rangsangan akan mengaktifkan bagian [[promoter inti]],<ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Transcription: an overview of gene regulation in eukaryotes
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A2021
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref> segmen [[gen]] yang berfungsi sebagai pencerap [[RNA polimerase]]<ref name="iga A5256">{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Glossary - Promoter
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A4529&rendertype=def-item&id=A5256
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref> yang terletak di bagian hulu bagian yang akan disalin (disebut ''transcription unit''), tidak jauh dari ujung 5' gen.<ref name="iga A5256" /> Promoter inti terdiri dari [[kotak TATA]], [[kotak CCAAT]] dan [[kotak GC]].<ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Figure 11-25. The promoter region in higher eukaryotes.
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A2021&rendertype=figure&id=A2024
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref>
 
Sebelum RNA polimerase dapat terikat pada promoter inti, [[faktor transkripsi]] TFIID akan membentuk kompleks dengan kotak TATA.<ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Figure 11-29. Assembly of the RNA polymerase II initiation complex
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A2021&rendertype=figure&id=A2030
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref> Inhibitor dapat mengikat pada kompleks TFIID-TATA dan mencegah terjadinya kompleks dengan faktor transkripsi lain, namun hal ini dapat dicegah dengan TFIIA yang membentuk kompleks DA-TATA. Setelah itu TFIIB dan TFIIF akan turut terikat membentuk kompleks DABF-TATA. Setelah itu RNA polimerase akan mengikat pada DABF-TATA, dan disusul dengan TFIIE, TFIIH dan TFIIJ.
 
Kompleks tersebut terjadi pada bagian kotak TATA yang terletak sekitar 10-25 [[pasangan basa]] di bagian hulu (''upstream'') dari [[kodon]] mulai (AUG). Adanya faktor transkripsi ini akan menarik enzim [[RNA polimerase]] mendekat ke DNA dan kemudian menempatkan diri pada tempat yang sesuai dengan kodon mulai (TAC pada berkas DNA). Berkas DNA yang ditempel oleh RNA polimerase disebut sebagai ''berkas templat'', sementara berkas pasangannya disebut sebagai ''berkas kode'' (karena memiliki urutan basa yang sama dengan RNA yang dibuat). Pada awal transkripsi, [[enzim]] [[guaniltransferase]] menambahkan [[gugus fungsional|gugus]] [[7-metilguanosina|m7Gppp]] pada ujung 5' untai pre-mRNA.<ref name="iga A1829">{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Figure 10-15. Processing of primary transcript.
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A1822&rendertype=figure&id=A1829
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref> Sejumlah [[ATP]] diperlukan untuk membuat RNA polimerase mulai bergerak dari ujung 3' (ujung karboksil) berkas templat ke arah ujung 5' (ujung amino). pre-mRNA yang terbentuk dengan demikian berarah 5' → 3'. Pergerakan RNA polimerase akan berhenti apabila ia menemui urutan basa yang sesuai dengan kodon berhenti, dan deret AAUAAA akan ditambahkan pada pangkal 3' pre-mRNA.<ref name="iga A1829" /> Setelah proses selesai, RNA polimerase akan lepas dari DNA, sedangkan pre-mRNA akan teriris sekitar 20 [[pasangan basa|bp]] dari deret AAUAAA dan sebuah enzim, [[poli(A) polimerase]] akan menambahkan deret antara 150 - 200 [[adenosina]] untuk membentuk pre-mRNA yang lengkap yang disebut [[mRNA primer]].<ref name="iga A1829" />
 
Baris 121:
 
== Hasil ==
Hasil transkripsi adalah berkas RNA yang masih "mentah" yang disebut mRNA primer.<ref>{{en}} {{cite book
| title = An Introduction to Genetic Analysis
| author = Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart
| work = University of British Columbia, University of California, Harvard University
| isbn = 0-7167-3520-2
| edition = 7
| year = 2000
| page = Eukaryotic RNA
| publisher = W. H. Freeman
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=iga&part=A1822
| accessdate = 2010-08-17
}}</ref> Di dalamnya terdapat fragmen berkas untuk protein yang mengatur dan membantu sintesis protein ([[translasi]]) selain fragmen untuk dilanjutkan dalam translasi sendiri, ditambah dengan bagian yang nantinya akan dipotong ([[intron]]). Berkas RNA ini selanjutnya akan mengalami proses yang disebut sebagai [[proses pascatranskripsi]] (''post-transcriptional process'').