Diikuti dengan kematian ayahnya dipada tahun 666, Namgeon dikacaukan di dalam pertikaian kekuasaan dengan abangya, [[Yeon Namsaeng]]. Namgeon dan adiknya Namsan menjalankan kudeta melawan abangnya ketika ia sedang menginspeksi seluruh benteng di kerajaan Goguryeo untuk mempersiapkan perang melawan Tang. Kudeta Namgeon dan Namsan memaksa Namsaeng untuk menyerah kepada Tang, dan akhirnya memimpin ke arah kehancuran [[Goguryeo]]. Namgeon menunjuk dirinya sendiri sebagai ''Dae Mangniji'' (대막리지, 大莫離支) dan merampas kontrol di pemerintahan.
Selama invasi [[Dinasti Tang|Tang]] yang berikutnya dipada tahun 668, Namgeon memimpin pasukan perlawanan ke pasukan Cina di dekat [[Sungai Amnok]] dan berlanjut membela pasukan Tang ke seluruh penjuru [[Pyongyang]]. Dengan kekalahan Goguryeo, Namgeon menemukan dirinya sendiri adalah seorang tawanan perang dan di transportasi ke Cina dan kemudian dikucilkan ke [[Qianzhou]] (黔州), di lokasi yang sekarang adalah provinsi [[Sichuan]], Cina, dimana ia sepertinya meninggal disana. [[Prasasti]] makam adik Namgeon, [[Yeon Namsaeng|Namsaeng]] dan [[Yeon Namsan|Namsan]] masih ada tapi tidak memberikan informasi tentang kehidupan Namgeon. Jika Namgeon dan adik-adiknya bekerja sama dengan baik, Goguryeo akan bertahan di dalam periode yang lebih lama, namun Silla mengirimkan para pengintai ke dalam lingkungan penasehat bersaudara itu dan berusaha untuk memecah belah hubungan kakak beradik tersebut.
