'''Kereta api [[Pakuan]] Ekspres''' adalah [[kereta rel listrik|kereta rel listrik (KRL)]] ekspres yang pernah melayani [[koridor]] [[Stasiun Bogor|Bogor]] - [[Stasiun Jakarta Kota|Jakarta Kota]] dan [[Stasiun Bogor|Bogor]] - [[Stasiun Tanah Abang|Tanah Abang]]. yangJalur ini diluncurkan tahun [[2000]] dan menggunakan unit KRL [[hibah]] dari [[Jepang]] ([[kereta rel listrik Toei seri 6000|KRL Toei 6000]]). Kereta api ini merupakan [[Kereta rel listrik|kereta rel listrik (KRL) Ekspres]] pertama yang menggunakan fasilitas [[pendingin udara]] (AC). Pakuan Ekspres menempuh jarak antara [[Bogor]] - [[Jakarta]] sepanjang 55 kilometer dalam waktu 55-70 [[menit]]. Nama kereta ini diambil dari nama sebuah kerajaan di [[Bogor]] yaitu [[Pakuan Padjadjaran]].
Pakuan Ekspres berhenti di '''[[Stasiun Cilebut''']] (Tidaktidak setiap rangkaian), '''[[Stasiun Bojonggede''']] (Tidaktidak setiap rangkaian), '''[[Stasiun Tebet''']] (Tidaktidak Setiap rangkaian), [[Stasiun Manggarai]] (Tidaktidak setiap rangkaian), '''[[Stasiun Cikini''']] (Tidaktidak setiap rangkaian), [[Stasiun Gondangdia]], [[Stasiun Gambir]], dan [[Stasiun Juanda]] untuk tujuan [[Stasiun Jakarta Kota|Jakarta Kota]]. Sedangkan untuk tujuan [[Stasiun Tanah Abang]], Pakuan Ekspres berhenti di '''Stasiun Cilebut''', '''Stasiun Bojonggede''' dan '''[[Stasiun Sudirman''']].
Pada tahun 2006 [[Kereta Api Indonesia|PT KAKereta Api]] membeli 16 rangkaian baru dan rangkaian lama dijadikan kereta semi ekspres, kemudian KA Semi ekspress diubah menjadi KRL Ekonomi AC. Kereta ini merupakan cikal bakal kereta berpenyejuk udara lainnya. Di bulan Juli 2011, semua KRL Ekspres dihapus dan diganti KRL ''[[Kereta api komuter|Commuter Line]]'' AC yang awalnya tiketnya cukup mahal (hampir seperti harga karcis Pakuan Ekspres). Di KRL Commuter Line, penerus jalur ini adalah [[Lin Bogor]].