Protestanisme pertama kali diperkenalkan oleh Belanda pada abad keenam belas, sehingga terpengaruh oleh ajaran [[Calvinisme]] dan [[Lutheran]].
Gereja [[pertama di Indonesia]] diberi nama Gereja Sion.<ref>{{factCite web|last=Media|first=Kompas Cyber|date=2023-02-21|title=Mengenal Gereja Sion, Gereja Tertua di Indonesia, Berdiri sejak 1693 Halaman all|url=https://www.kompas.com/tren/read/2023/02/22/061500265/mengenal-gereja-sion-gereja-tertua-di-indonesia-berdiri-sejak-1693|website=KOMPAS.com|language=id|access-date=2023-05-16}}</ref> Gereja ini dikenal juga dengan nama Portugeesche Buitenkerk atau Gereja Portugis berada di sudut Jalan Pangeran Jayakarta dan Mangga Dua Raya. Peresmian gedung gereja dilakukan pada hari Minggu, 23 Oktober 1695 dengan dihadiri gubernur jenderal Willem van Outhoorn dan pemberkatan oleh Pendeta Theodorus Zas.
