Perikanan pesisir dilakukan dengan perahu kecil, jala, atau teknik penangkaran terhitung sekitar sepertiga produksi total industri perikanan Jepang. Sementara itu, perikanan lepas pantai dengan kapal ukuran menengah terhitung sekitar lebih dari separuh produksi total. Di antara hasil laut yang diambil misalnya: [[sarden]], [[cakalang]], [[kepiting]], [[udang]], [[salem]], [[cumi-cumi]], [[kerang]], [[tuna]], [[saury]], ''[[Seriola quinqueradiata|yellowtail]]'', dan [[makerel]].
Jepang termasuk salah satu negara yang memiliki armada [[perikanan]] terbesar di dunia. Walaupun demikian, Jepang adalah negara pengimpor hasil laut terbesar di dunia (senilai AS$ 14 milyarmiliar)<ref>{{cite web |url=http://www.fao.org/newsroom/common/ecg/1000850/en/fishtradefacts08b.pdf |title=The State of World Fisheries and Aquaculture 2006 |accessdate=2009-03-02 |publisher=FAO Fisheries and Aquaculture Department FAO |date=2007 |isbn=978-92-5-105568-7 }}</ref> Sejak tahun 1996, Jepang berada di peringkat ke-6 dalam total tangkapan ikan di bawah [[Republik Rakyat Tiongkok|RRT]], [[Peru]], [[Amerika Serikat]], [[Indonesia]], dan [[Chili]].<ref>{{cite web |url=ftp://ftp.fao.org/docrep/fao/009/a0699e/a0699e.pdf |title=Yearbooks of Fishery Statistics: World fisheries production, by capture and aquaculture, by country (2006) |publisher=Fisheries and Aquaculture Department FAO |month=January |year=2006 |accessdate=2009-03-08}}</ref><ref>{{cite book |title=The World Almanac and book of facts 2008 |year=2008 |publisher=World Almanac Books |location= |isbn=1-60057-072-0 |page=94 |}}</ref> Jepang juga menebarkan kontroversi dengan mendukung perburuan ikan paus.<ref>http://news.bbc.co.uk/1/hi/sci/tech/4118990.stm Japanese whaling 'science' rapped</ref>
