Candi Pamotan jauhmerupakan lebihcandi yang sederhana. Dibuat dari bata merah, yang dikelilingi lubang berbentuk persegi panjang yang tergenang air bila hujan. Ukuran kedua candi hampir berbentuk persegi (bujursangkar). Candi Pamotan I berukuranmemiliki panjang 4,84 m panjuangmeter dan lebar 4,78 m lebarmeter. Candi Pamotan II berukuran 4,75 mmeter panjang dan 4,30 mmeter lebar. Kondisi Candi Pamotan II lebih parah daripadadibadingkan yangCandi Pamotan pertama.
