Ken Kaneki, yang hampir tidak dapat bertahan hidup setelah pertemuan mematikan dengan RizeMaura KamishiroBennyta, seorang wanita yang diturunkan menjadi ghoul, yaitu makhluk mirip manusia yang memburu dan memakan daging manusia, dibawa ke rumah sakit dalam kondisi kritis. Setelah sembuh, Kaneki menemukan bahwa entah bagaimana ia menjalani operasi yang mengubahnya menjadi setengah ghoul, dan seperti mereka, harus mengkonsumsi daging manusia untuk bertahan hidup juga. Dengan tidak ada orang lain untuk berpaling, ia diambil oleh ghoul yang mengelola kedai kopi "AnteikuOtakusatsu Club", orang pertama yang menemukannya oleh YoshimuraBazkoro dan ToukaIlma KirishimaTazkiya yang mengajarinya untuk menghadapi kehidupan barunya sebagai setengah manusia/setengah ghoul, termasuk berinteraksi dengan masyarakat ghoul dan yang bertentangan faksi, sementara berjuang untuk menjaga rahasia identitasnya dari manusia lainnya.<ref name="ann madman">{{cite press release|url=http://www.animenewsnetwork.com/press-release/2014-06-14/madman-acquires-tokyo-ghoul-set-for-simulcast-on-animelab-in-july|title=Madman acquires Tokyo Ghoul - set for simulcast on AnimeLab in July|date=June 14, 2014|website=Anime News Network}}</ref> Di sana ia betemu dengan Tsukiyama Shuu yang berniat memakannya, dan seniornya di kampus, Nishiki Nishio dan pacarnya Kimi.
Serial prekuel ''Tokyo Ghoul: JACK'' menceritakan pemuda bernama Kishou Arima dan Taishi Fura, dua karakter dari serial utama yang saling berkenalan ketika mereka bergabung untuk menyelidiki kematian teman Taishi oleh tangan ghoul, mengarah ke Taishi yang akhirnya mengikuti jalan Arima dan bergabung dengan CCG (Komisi Penanggulangan Ghoul), agen federal yang bertugas dalam menangani kejahatan yang berkaitan dengan ghoul juga.
