Pada 9 Juni 2008 dia kembali dibeli oleh Milan dan memasukkannya dalam skuat mereka<ref>{{cite news|title=Comunicato ufficiale A.C. Milan|url=http://www.acmilan.com/NewsDetail.aspx?idNews=67791|work=acmilan.com|publisher=[[A.C. Milan|Associazione Calcio Milan]]|date=9 June 2008|accessdate=10 February 2010|language=Italian}} {{Dead link|date=October 2010|bot=H3llBot}}</ref> dengan harga 2.9 juta Euro.<ref>{{cite web|url=http://media3.acmilan.com/uploads/bilancio/BilancioGruppoMilan_ACM_12-08.pdf|title=AC Milan Group 2008 Annual Report|date=ca. April 2009|accessdate=11 June 2011|work=AC Milan|language=Italian}}</ref> Di musim pertamanya dengan "Rossoneri", dia jarang mendapat kesempatan bermain, hanya 11 kali tampil di liga. Di musim 2009-10, Milan mendatangkan pelatih kepala baru [[Leonardo de Araújo|Leonardo]], yang awalnya kurang mempertimbangkan untuk memakai Antonini. Akan tetapi, cedera yang menghantam para pemain inti seperti [[Gianluca Zambrotta|Zambrotta]] dan [[Marek Jankulovski|Jankulovski]] di musim yang berjalan membuat orang [[BrazilBrasil]] itu memasangnya dalam susunan pemain. Antonini memanfaatkan kesempatan ini dan mendapat kepercayaan Leonardo dengan konsisten bermain bagus.<ref>{{cite news|title=Leonardo: "Antonini e Abate, una crescita che mi fa felice"|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/2009/dicembre/08/Leonardo_Antonini_Abate_una_crescita_ga_10_091208019.shtml|author=Olivero Giovanni Battista|newspaper=[[La Gazzetta dello Sport]]|date=8 December 2009|accessdate=10 February 2010|language=Italian}}</ref> Kinerja bagusnya juga membuat klub ini menawarkan perpanjangan kontrak sampai 2014 yang ditandatangai pada 11 Februari 2010.<ref>{{cite news|title=A.C. Milan official note|url=http://www.acmilan.com/NewsDetail_popup.aspx?idNews=116221&progr=4|work=acmilan.com|publisher=[[A.C. Milan|Associazione Calcio Milan]]|date=11 February 2010|accessdate=11 February 2010}} {{Dead link|date=October 2010|bot=H3llBot}}</ref><ref>{{cite news|title=Abate and Antonini commit to Milan|url=http://www.uefa.com/uefachampionsleague/news/newsid=1447631.html|work=uefa.com|publisher=[[UEFA|Union of European Football Associations]]|date=11 February 2010|accessdate=11 February 2010}}</ref> Dia mengakhiri musim keduanya di Milan dengan bangga ketika mencetak gol pertamanya untuk ''Rossoneri'' dalam pertandingan terakhir di musim tersebut dalam sebuah pertandingan kandang melawan [[Juventus F.C.|Juventus]], pada 15 Mei 2010.<ref>{{cite news|title=Great satisfaction|url=http://www.acmilan.com/NewsDetail.aspx?idNews=121829|work=acmilan.com|publisher=[[A.C. Milan|Associazione Calcio Milan]]|date=16 May 2010|accessdate=16 May 2010}} {{Dead link|date=October 2010|bot=H3llBot}}</ref>
