SelamaDi akhir 2015, Mor dikaitkandi gaet oleh dengan [[Borussia Dortmund]].<ref>{{Cite web|url=http://www.dailymail.co.uk/sport/football/article-3303469/Manchester-United-Liverpool-FC-eye-transfer-swoop-Emre-Mor.html|title=Manchester United and Liverpool eye transfer swoop for Danish starlet Emre Mor|date=4 November 2015|website=Daily Mail}}</ref> Borussia Dortmund mengkonfirmasi penandatanganan kontrak pada tanggal 7 juni 2016,<ref>{{Cite web|url=http://www.bbc.com/sport/football/36472185|title=Borussia Dortmund: Emre Mor becomes fourth summer signing|date=7 June 2016|website=BBC News}}</ref> mengumumkan kontrak 5 tahun untuk Mor.<ref>{{Cite web|url=http://www.bvb.de/eng/News/Overview/Borussia-Dortmund-sign-Emre-Mor|title=Borussia Dortmund sign Emre Mor|date=7 June 2016|website=Borussia Dortmund}}</ref> Ia bermain reguler di Bundesliga dan Liga Champions UEFA untuk Borussia Dortmund, sebagai pengganti di sayap kanan atau gelandang serang.
