[[Berkas:Prokudin-Gorskii-19.jpg|thumb|left|200px|[[MohammedMuhammad Alim Khan]] (1880–1944), EmirAmir Bukhara terakhir. foto diambil oleh [[Prokudin-Gorski]] pada tahun 1911.]]
EmiratKeamiran Bukhara resmi dibuat pada tahun 1785, oleh asumsi kekuasaan oleh emiramir [[Manghit]], ShahSyah Murad. Selama abad ke-18, para emirsmir perlahan-lahan meraih kendali efektif di [[Kekhanan Bukhara]], dari posisi mereka sebagai ataliq. Pada 1740-an, ketika kerajaan itu ditaklukkan oleh [[NaderNadir ShahSyah]] dari Persia, jelas bahwa emiramir memegang kekuasaan yang sesungguhnya. Pada tahun 1747 setelah kematian Nadir ShahSyah, seorang ataliq bernama Muhammad Rahim Bi membunuh AbulfayzAbulfaiz Khan dan putranya, dan mengakhiri dinasti JanidJan. Sejak itu khan boneka diizinkan untuk memerintah sampai kematian AbuAbul l-Ghazi Khan, ShahSyah Murad diasumsikan takhta secara terbuka.<ref>[[Svat Soucek]], ''A History of Inner Asia'' (2000), pp 179–80</ref>
Pada tahun 1868 emiratkeamiran kalah perang dengan [[Kekaisaran Rusia]], yang telah memiliki keinginan di menjajah wilayah tersebut. Rusia mencaplok banyak wilayah emirat, termasuk kota penting [[SamarkandSamarqand]]<ref>''[[ibid.]]'', p 198</ref>. Pada tahun 1873 sisanya menjadi [[protektorat]]<ref>[http://www.onwar.com/aced/data/romeo/russobukharan1868.htm Russo-Bukharan War 1868], ''Armed Conflict Events Database'', OnWar.com</ref> Rusia, dan wilayahnya kemudian dikelilingi [[Governorat Jenderal Turkistan]].
Reformis di dalam Emiratnegeri telah menemukan bahwa emiramir konservatif, [[MohammedMuhammad Alim Khan]], tidak mau melepaskan cengkeramannya pada kekuasaan, dan berpaling ke revolusioner [[Bolshevik]] Rusia untuk bantuan militer. [[Tentara Merah]] melancarkan serangan gagal dalam bulan Maret 1920, dan kemudian yang sukses pada September pada tahun yang sama<ref>''ibid.'', pp 221–2</ref>. EmiratKeamiran Bukhara dikuasai oleh kaum Bolshevik dan diganti dengan [[Republik Soviet Rakyat Bukhara]]. Kini wilayah emiratkeamiran yang runtuh tersebut sebagian besar terletak di [[Uzbekistan]], dengan sebagian di [[Tajikistan]] dan [[Turkmenistan]].