Kota Tarakan terdiri dari 54 Kecamatan dan 2320 Kelurahan, untuk Kecamatan Bunyu terdiri dari 3 kelurahan dan Kecamatan Tarakan Barat dan Tarakan Tengah masing-masing terdiri dari 5 Kelurahan, untuk Tarakan Timur terdiri dari 7 Kelurahan dan 3 Kelurahan untuk Tarakan Utara.
Berikut adalah daftar Kelurahan di Kota Tarakan:
# Kelurahan [[Bunyu Barat, Bunyu, Tarakan|Bunyu Barat]]
# Kelurahan [[Bunyu Selatan, Bunyu, Tarakan|Bunyu Selatan]]
# Kelurahan [[Bunyu Timur, Bunyu, Tarakan|Bunyu Timur]]
# Kelurahan [[Karang Anyar, Tarakan Barat, Tarakan|Karang Anyar]]
# Kelurahan [[Karang Anyar Pantai, Tarakan Barat, Tarakan|Karang Anyar Pantai]]
