Saluran kalium: Perbedaan antara revisi

Mekanisme selektivitas saluran kalium tetap menjadi bahan perdebatan yang terus berlanjut. Oksigen karbonil sangat elektronegatif dan penarik kation. Filter ini dapat memuat ion kalium pada 4 situs yang biasanya diberi nama S1 hingga S4 dimulai dari sisi ekstraseluler. Sebagai tambahan, satu ion dapat berikatan di dalam rongga pada situs yang disebut SC, atau satu/lebih ion di sisi ekstraseluler pada situs yang lebih didefinisikan dengan baik disebut S0 atau situs yang kurang didefinisikan dengan baik disebut Sext. Berbagai penempatan berbeda situs tersebut mungkin terjadi. Karena struktur sinar-x rata-rata mencakup banyak molekul, tidak mungkin disimpulkan penempatan sebenarnya secara langsung dari struktur tersebut. Secara umum, terdapat beberapa kerugian akibat tolakan elektrostatik ketika dua situs bersebelahan ditempati ion. Proposal mengenai mekanisme selektivitas telah dibuat berdasarkan pada simulasi [[dinamika molekuler]],<ref>{{cite journal | vauthors = Noskov SY, Roux B | title = Importance of hydration and dynamics on the selectivity of the KcsA and NaK channels | journal = The Journal of General Physiology | volume = 129 | issue = 2 | pages = 135–43 | date = Feb 2007 | pmid = 17227917 | pmc = 2154357 | doi = 10.1085/jgp.200609633 }}</ref> model kecil ikatan ion,<ref>{{cite journal | authors = Noskov SY, Bernèche S, Roux B | title = Control of ion selectivity in potassium channels by electrostatic and dynamic properties of carbonyl ligands | journal = Nature | volume = 431 | issue = 7010 | pages = 830–4 | date = Oct 2004 | pmid = 15483608 | doi = 10.1038/nature02943 | bibcode = 2004Natur.431..830N }}</ref> perhitungan termodinamika,<ref>{{cite journal | vauthors = Varma S, Rempe SB | title = Tuning ion coordination architectures to enable selective partitioning | journal = Biophysical Journal | volume = 93 | issue = 4 | pages = 1093–9 | date = Aug 2007 | pmid = 17513348 | pmc = 1929028 | doi = 10.1529/biophysj.107.107482 | bibcode = 2007BpJ....93.1093V | arxiv = physics/0608180 }}</ref> pertimbangan topologi,<ref>{{cite journal | vauthors = Thomas M, Jayatilaka D, Corry B | title = The predominant role of coordination number in potassium channel selectivity | journal = Biophysical Journal | volume = 93 | issue = 8 | pages = 2635–43 | date = Oct 2007 | pmid = 17573427 | pmc = 1989715 | doi = 10.1529/biophysj.107.108167 | bibcode = 2007BpJ....93.2635T }}</ref><ref>{{cite journal | vauthors = Bostick DL, Brooks CL | title = Selectivity in K+ channels is due to topological control of the permeant ion's coordinated state | journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 104 | issue = 22 | pages = 9260–5 | date = May 2007 | pmid = 17519335 | pmc = 1890482 | doi = 10.1073/pnas.0700554104 | bibcode = 2007PNAS..104.9260B }}</ref> dan perbedaan struktur<ref>{{cite journal | vauthors = Derebe MG, Sauer DB, Zeng W, Alam A, Shi N, Jiang Y | title = Tuning the ion selectivity of tetrameric cation channels by changing the number of ion binding sites | journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 108 | issue = 2 | pages = 598–602 | date = Jan 2011 | pmid = 21187421 | pmc = 3021048 | doi = 10.1073/pnas.1013636108 | bibcode = 2011PNAS..108..598D }}</ref> antara saluran selektif dan takselektif.

 

 

=== Wilayah hidrofobik ===