Saluran kalium: Perbedaan antara revisi

 

=== Filter selektivitas ===

 

Saluran kalium menghilangkan kulit hidrasi ion ketika memasuki filter selektivitas. Filter selektivitas dibentuk oleh lima sekuens residu, TVGYG, disebut sekuens tanda, di dalam setiap empat subunit. Sekuens tanda ini berada di dalam gelung antara heliks pori dengan TM2/6, sebelumnya disebut gelung-P. Sekuens tanda ini sangat terkonservasikan, dengan pengecualian residu valin pada saluran kalium prokariot sering disubstitusi dengan residu isoleusin pada saluran eukariot. Sekuens ini memakai struktur rantai utama unik, secara struktur analog dengan [[sarang (motif struktur protein)|motif struktur protein sarang]]. Empat himpunan atom oksigen karbonil elektronegatif berbaris menghadap pusat pori filter dan membentuk persegi antiprisma serupa kulit pelarut air mengelilingi setiap situs pengikatan kalium. Jarak antara oksigen karbonil dengan ion kalium pada situs pengikatan filter selektivitas sama dengan jarak antara oksigen air pada kulit hidrasi awal dengan ion kalium pada larutan air, menyediakan rute yang sangat menguntungkan untuk de[[solvasi]] ion. Jarak ini dipertahankan oleh [[ikatan hidrogen]] dan [[gaya van der Waals]] di dalam lembar residu asam amino aromatik mengelilingi filter selektivitas.<ref name="pmid9525859" /><ref>{{cite journal|last1=Sauer|first1=DB|last2=Zeng|first2=W|last3=Raghunathan|first3=S|last4=Jiang|first4=Y|title=Protein interactions central to stabilizing the K+ channel selectivity filter in a four-sited configuration for selective K+ permeation.|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|date=4 October 2011|volume=108|issue=40|pages=16634–9|doi=10.1073/pnas.1111688108|pmid=21933962|pmc=3189067|bibcode=2011PNAS..10816634S}}</ref> Filter selektivitas terbuka menuju larutan ekstraseluler, memaparkan empat oksigen karbonil pada residu glisin (Gly79 pada [[saluran kaliumKcsA|KcsA]]). Residu selanjutnya yang terbuka menuju sisi ekstraseluler protein adalah Asp80 yang bermuatan negatif (KcsA). Residu ini bersama dengan lima residu filter membentuk pori yang menghubungkan rongga berisi air pada pusat protein dengan larutan ekstraseluler.<ref name="pmid16253415"/>