ONIOM: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
HsfBot (bicara | kontrib)
k Bot: Perubahan kosmetika
k Bot: Perubahan kosmetika
Baris 1:
'''ONIOM''' merupakan kependekan dari "our own n-layered integrated molecular orbital and molecular mechanics" yakni suatu pendekatan komputasi yang dikembangkan oleh [[Morokuma]] dan rekan-rekan kerjanya. ONIOM sebetulnya [[metode hibrid]] yang menyertakan beragam [[level teori]] dalam perhitungannya namun diterapkan pada atom-atom atau subunit yang berbeda dalam molekul. Sama halnya ketika mengupas bawang, maka dapat diperoleh berbagai lapisan yang satu sama lain saling berkaitan. <ref>{{cite journal|author = Dapprich, I. Komaromi, K.S. Byun, K. Morokuma, and M.J. Frisch| title =A new ONIOM implementation in Gaussian98. Part I. The calculation of energies, gradients, vibrational frequencies and electric field derivatives| journal =Journal of Molecular Structure: THEOCHEM| volume =461-462| pages =1| year =1999| doi =10.1016/S0166-1280(98)00475-8 }}</ref><ref>{{cite journal|last1=Vreven|first1=T|last2=Morokuma|first2=K|title=Chapter 3 Hybrid Methods: ONIOM(QM:MM) and QM/MM|journal=Annual Reports in Computational Chemistry|volume=2|pages=35|year=2006|doi=10.1016/S1574-1400(06)02003-2 }}</ref><ref>{{cite journal|last1 =Svensson|first1 =Mats|last2 =Humbel|first2 =StéPhane|last3 =Froese|first3 =Robert D. J.|last4 =Matsubara|first4 =Toshiaki|last5 =Sieber|first5 =Stefan|last6 =Morokuma|first6 =Keiji|title =ONIOM: A Multilayered Integrated MO + MM Method for Geometry Optimizations and Single Point Energy Predictions. A Test for Diels−Alder Reactions and Pt(P(t-Bu)3)2+ H2Oxidative Addition|journal =The Journal of Physical Chemistry|volume =100|pages =19357|year =1996|doi =10.1021/jp962071j|issue =50 }}</ref>.
Dalam mengkaji molekul besar menggunakan [[komputasi kuantum]], tentu ONIOM merupakan metode yang mutakhir, bahkan [[biomolekul]] juga sudah banyak dihitung menggunakan metode ONIOM. <ref>{{cite journal|last1=Senn|first1=H|last2=Thiel|first2=W|title=QM/MM studies of enzymes|journal=Current Opinion in Chemical Biology|volume=11|issue=2|pages=182–7|year=2007|pmid=17307018|doi=10.1016/j.cbpa.2007.01.684 }}</ref> serta untuk kompleks logam transisi dan katalisis.<ref>{{cite journal | last1 = Ananikov | first1 = Valentine P. | last2 = Musaev | first2 = Djamaladdin G. | last3 = Morokuma | first3 = Keiji | title = Real size of ligands, reactants and catalysts: Studies of structure, reactivity and selectivity by ONIOM and other hybrid computational approaches☆ | journal = Journal of Molecular Catalysis A: Chemical | volume = 324 | pages = 104 | year = 2010 | doi = 10.1016/j.molcata.2010.03.015}}</ref> Secara Umum, ONIOM dapat digolongkan menjadi ONIOM dua lapis dan ONIOM tiga lapis. Adapun penggolongan tersebut berdasarkan kebutuhan untuk mencapai akurasi yang baik dan "computational cost" yang rendah.
 
== Perangkat Lunak ==