Calakmul terletak di negara bagian [[Campeche]] di Meksiko tenggara, sekitar 35 km di sebelah utara perbatasan dengan [[Guatemala]] dan 38 km di sebelah utara reruntuhan [[El Mirador]].<ref>Sharer & Traxler 2006, hlm. 356. Folan et al. 1995a, hlm. 310.</ref> Reruntuhan [[El Tintal]] terletak sejauh 68 km di sebelah barat daya Calakmul dan dihubungkan oleh sebuah jalan dengan El Mirador maupun Calakmul.<ref name="Folan&c95Ap313">Folan et al 1995a, hlm. 313.</ref> Calakmul terletak sekitar 20 km di sebelah selatan kota [[Oxpemul]] dan sekitar 25 km di sebelah barat daya [[La Muñeca]].<ref>Folan et al. 1995a, hlm. 311.</ref> Calakmul sendiri terletak di ketinggian sekitar 35 kmm di atas rawa-rawa musiman yang besar yang terhampar di barat,<ref name="SharerTraxler06p356"/> yang dikenal dengan sebutan El Laberinto.<ref name="Folan&c95a310">Folan et al 1995a, hlm. 310.</ref> Rawa-rawa ini memiliki luas sekitar 34 x 8 km dan merupakan sumber air yang penting pada musim penghujan.<ref name="Folan&c95a310"/> Dataran rawa ini terhubung dengan sistem pengendali air yang mutakhir yang menggunakan kenampakan alami maupun buatan, seperti gulliesselokan anddan canalsterusan thatyang encircledmengelilingi awilayah seluas {{convert|22|km2|sqmi|adj=on}}areakm<sup>2</sup> arounddi thesekeliling sitepusat core,situs an areayang considered as Innerdisebut "Calakmul Dalam".<ref name="Folan&c95a310"/> The location ofLetak Calakmul atdi theujung edgedataran ofrawa a ''bajo''memiliki provideddua two additional advantagesmanfaat: thetanah fertileyang soilssubur alongdi theujung edgerawa-rawa ofdan the swamp and access to abundanttersedianya [[flintnodul (geologi)|nodul]] [[Nodule (geology)|nodulesrijang]] yang berlimpah.<ref name="Folan&c95Ap313"/> TheKota ini juga terletak di kenampakan alam yang berbentuk seperti tanjung yang terbentuk oleh [[gamping]] alami setinggi city is situated on a promontory formed by a natural {{convert|35|m|ft|adj=on}} high [[limestone]] dome rising above the surrounding lowlands.<ref name="Folan&c95Ap313"/> This dome was artificially levelled by the Maya.<ref name="Braswell05p167"/> During the [[Mesoamerican chronology|Preclassic]] and Classic periods settlement was concentrated along the edge of the El Laberinto ''bajo'', during the Classic period structures were also built on high ground and small islands in the swamp where flint was worked.<ref name="Folan&c95Ap313"/>
At the beginning of the 21st century the area around Calakmul remained covered by dense forest.<ref name="Braswell&c05p165">Braswell et al. 2005, p.165.</ref> During the 1st millennium AD the area received moderate and regular rainfall, although there is less surface water available than further south in Guatemala.<ref name="Braswell&c05p165"/> Calakumul is now located within the {{convert|1800000|acre|km2|adj=on}} [[Calakmul Biosphere Reserve]].
